禽源大腸桿菌烈性噬菌體的分離鑒定及功能基因組學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-15 06:58
為了分離純化禽源致病性大腸埃希菌的噬菌體并測定其性質(zhì),將近4000份鴨糞樣品來源于安徽和縣某兩個(gè)規(guī)模化鴨場及南京某市場某鴨場的鴨糞樣品離心、過濾后提取上清液,采用點(diǎn)滴法和雙層瓊脂法對(duì)致病性大腸桿菌噬菌體進(jìn)行鑒定、純化并保存,結(jié)果共分離鑒定了136株大腸埃希菌烈性噬菌體,并對(duì)其中的四十余株進(jìn)行了生物特性學(xué)分析,包括透射電鏡觀察,宿主譜測定等,對(duì)其中的HX01,NJ01進(jìn)行了基因組提取并全基因組測序。以噬菌體NJ01為例,透射電鏡下結(jié)構(gòu)判定為短尾噬菌體科(Podoviridae)。宿主范圍較窄,僅能裂解被測大腸桿菌中的三株:DE172、NJ01和MC1061。效價(jià)為1.33×1013pfu/ml,(?)將純培養(yǎng)物稀釋至108PFU/mL,每隔15min(至4h)測其一步生長曲線,表明潛伏期為30min,平均裂解量為157PFU/cell,最佳感染復(fù)數(shù)為100。采用自己優(yōu)化改進(jìn)過噬菌體基因組提取和純化方法,制備了高質(zhì)量的烈性噬菌體HX01和NJ01的基因組,并通過第二代高通量測序技術(shù)進(jìn)行了全基因組測序,以NJ01為例,測序結(jié)果顯示:NJ01全基因組大小為77,448bp, G+C含量為42....
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一篇 文獻(xiàn)綜述
第一章 禽致病性大腸桿菌(病)研究概況
參考文獻(xiàn)
第二章 噬菌體研究情況概述
1 噬菌體的分類及形態(tài)結(jié)構(gòu)
1.1 噬菌體的生物學(xué)特性及分類概況
1.2 有尾病毒目(Caudovirales)
2 噬菌體的基因組學(xué)
3 噬菌體的應(yīng)用
3.1 細(xì)菌的鑒定和分型
3.2 作為分子生物學(xué)研究的工具
4 本文的研究意義及目的
參考文獻(xiàn)
第二篇 實(shí)驗(yàn)研究
第三章 烈性噬菌體的分離鑒定及生物特性學(xué)分析
摘要
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 噬菌體的生物特性學(xué)研究方法
2 結(jié)果與分析
2.1 噬菌體的分離及純化
2.2 噬菌體透射電鏡下的形態(tài)觀察
2.3 電鏡觀察
2.4 宿主范圍測定
2.5 噬菌體效價(jià)的測定
2.6 噬菌體最佳感染復(fù)數(shù)(multiplicity of infection,MOI)的測定
2.7 一步生長曲線
3 討論
參考文獻(xiàn)
ABSTRACT
第四章 噬菌體全基因組制備、測序及比較基因組分析
摘要
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 噬菌體基因組制備及測序
2 結(jié)果與分析
2.1 NJ01基因組測序結(jié)果及注釋
2.2 核酸接收序列號(hào)
2.3 NJ01的比較基因組學(xué)分析
2.4 臨菌體旳進(jìn)化史探索
3 討論
參考文獻(xiàn)
ABSTRACT
第五章 全噬菌體蛋白樣品制備與二維電泳
摘要
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 全噬菌體蛋白樣品制備方法
1.3 全噬菌體蛋白樣品二維電泳
2 結(jié)果
3 討論
參考文獻(xiàn)
ABSTRACT
第六章 烈性噬菌體NJ01治療禽源大腸桿菌感染的探索研究
摘要
1 材料
1.1 樣品及試劑
1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2 方法
2.1 禽源大腸桿菌DE172的復(fù)壯
2.2 DE172感染小鼠LD50的測定
2.3 噬菌體療效探索
2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 小鼠LD50的測定結(jié)果
3.2 噬菌體NJ01療效測定結(jié)果
4 討論
參考文獻(xiàn)
Abstract
全文結(jié)論
致謝
已發(fā)表文章
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]ICTV第九次報(bào)告對(duì)病毒分類系統(tǒng)的一些修改[J]. 張忠信. 病毒學(xué)報(bào). 2012(05)
[2]噬菌體治療制劑的研究進(jìn)展[J]. 高成秀,嚴(yán)亞賢. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2007(07)
[3]致病性雞大腸桿菌噬菌體的分離與效價(jià)測定[J]. 孫海虹,馬同鎖,于珊,趙寶華. 河北師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2007(01)
[4]噬菌體治療細(xì)菌感染的研究[J]. 孫偉,朱春寶. 國外醫(yī)藥(抗生素分冊). 2005(02)
[5]油酸鈉與紫外線聯(lián)用滅活血漿中病毒的研究[J]. 劉蓉,沈德林,張文福,袁慶霞,鐘儒波. 中國消毒學(xué)雜志. 2001(04)
本文編號(hào):3496273
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一篇 文獻(xiàn)綜述
第一章 禽致病性大腸桿菌(病)研究概況
參考文獻(xiàn)
第二章 噬菌體研究情況概述
1 噬菌體的分類及形態(tài)結(jié)構(gòu)
1.1 噬菌體的生物學(xué)特性及分類概況
1.2 有尾病毒目(Caudovirales)
2 噬菌體的基因組學(xué)
3 噬菌體的應(yīng)用
3.1 細(xì)菌的鑒定和分型
3.2 作為分子生物學(xué)研究的工具
4 本文的研究意義及目的
參考文獻(xiàn)
第二篇 實(shí)驗(yàn)研究
第三章 烈性噬菌體的分離鑒定及生物特性學(xué)分析
摘要
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 噬菌體的生物特性學(xué)研究方法
2 結(jié)果與分析
2.1 噬菌體的分離及純化
2.2 噬菌體透射電鏡下的形態(tài)觀察
2.3 電鏡觀察
2.4 宿主范圍測定
2.5 噬菌體效價(jià)的測定
2.6 噬菌體最佳感染復(fù)數(shù)(multiplicity of infection,MOI)的測定
2.7 一步生長曲線
3 討論
參考文獻(xiàn)
ABSTRACT
第四章 噬菌體全基因組制備、測序及比較基因組分析
摘要
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 噬菌體基因組制備及測序
2 結(jié)果與分析
2.1 NJ01基因組測序結(jié)果及注釋
2.2 核酸接收序列號(hào)
2.3 NJ01的比較基因組學(xué)分析
2.4 臨菌體旳進(jìn)化史探索
3 討論
參考文獻(xiàn)
ABSTRACT
第五章 全噬菌體蛋白樣品制備與二維電泳
摘要
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 全噬菌體蛋白樣品制備方法
1.3 全噬菌體蛋白樣品二維電泳
2 結(jié)果
3 討論
參考文獻(xiàn)
ABSTRACT
第六章 烈性噬菌體NJ01治療禽源大腸桿菌感染的探索研究
摘要
1 材料
1.1 樣品及試劑
1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2 方法
2.1 禽源大腸桿菌DE172的復(fù)壯
2.2 DE172感染小鼠LD50的測定
2.3 噬菌體療效探索
2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 小鼠LD50的測定結(jié)果
3.2 噬菌體NJ01療效測定結(jié)果
4 討論
參考文獻(xiàn)
Abstract
全文結(jié)論
致謝
已發(fā)表文章
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]ICTV第九次報(bào)告對(duì)病毒分類系統(tǒng)的一些修改[J]. 張忠信. 病毒學(xué)報(bào). 2012(05)
[2]噬菌體治療制劑的研究進(jìn)展[J]. 高成秀,嚴(yán)亞賢. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2007(07)
[3]致病性雞大腸桿菌噬菌體的分離與效價(jià)測定[J]. 孫海虹,馬同鎖,于珊,趙寶華. 河北師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2007(01)
[4]噬菌體治療細(xì)菌感染的研究[J]. 孫偉,朱春寶. 國外醫(yī)藥(抗生素分冊). 2005(02)
[5]油酸鈉與紫外線聯(lián)用滅活血漿中病毒的研究[J]. 劉蓉,沈德林,張文福,袁慶霞,鐘儒波. 中國消毒學(xué)雜志. 2001(04)
本文編號(hào):3496273
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