豬呼吸系統(tǒng)病原菌五重PCR檢測方法的建立與應(yīng)用
發(fā)布時間:2021-11-10 19:11
巴氏桿菌、豬鏈球菌、豬肺炎支原體、胸膜肺炎放線桿菌和副豬嗜血桿菌分別是引起豬巴氏桿菌病、豬鏈球菌病、豬支原體肺炎、豬傳染性胸膜肺炎和格拉瑟氏病的主要病原,也是當(dāng)前養(yǎng)豬業(yè)常見的五種呼吸系統(tǒng)疾病病原菌。這五種病原菌均可引起豬的呼吸道疾病,且引起的臨床癥狀和病理變化通過肉眼觀察有時難以區(qū)分。有時還存在這幾種病原菌混合感染的情況,更給疾病的診斷造成困難。為了有效鑒定這些病原菌,本課題擬建立一種同時鑒定這五種病原的PCR診斷方法。1.豬呼吸系統(tǒng)病原菌單重PCR檢測方法的建立目的:建立豬呼吸系統(tǒng)病原菌的單重PCR檢測方法。方法:針對巴氏桿菌plpE基因、豬鏈球菌gdh基因、豬肺炎支原體mhp677基因、胸膜肺炎放線桿菌apxⅣ基因和副豬嗜血桿菌vanY基因序列各設(shè)計1對引物,確定每種病原單重PCR的退火溫度和敏感性,驗證引物的特異性。結(jié)果:確定五種病原單重PCR擴增的退火溫度范圍為54℃-60℃,每對引物均為相應(yīng)病原菌特異的引物。plpE基因的最低檢出限為0.01 ng/μL,gdh基因的最低檢出限為0.1 ng/μL,mhp677基因的最檢出限為0.1 ng/μL,apxⅣ基因的最低檢出限為0....
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
使用不同的退火溫度擴增巴氏桿菌plpE基因片段
第3章豬呼吸系統(tǒng)病原菌單重PCR檢測方法的建立31圖3.2使用不同的退火溫度擴增豬鏈球菌gdh基因片段Fig3.2AmplificationofS.suisgdhgenefragmentatdifferentannealingtemperatures.M:DL2000DNAMarker;泳道1-8的退火溫度:30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃。M:DL2000DNAMarker;Annealingtemperaturesinlane1-8:30℃,36℃,42℃,48℃,54℃,60℃,66℃,72℃.3.3.1.3豬肺炎支原體mhp677基因片段退火溫度的確定分別以30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃的退火溫度擴增mhp677基因片段。在退火溫度為30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃時,擴增出一條與目的片段大小相同的526bp的條帶;在退火溫度為66℃和72℃時,沒有條帶擴增出來。將與目的片段大小相同的擴增條帶測序后,與目的基因進行核苷酸序列比對,二者核苷酸序列相同,即擴增的與目的片段大小相同的條帶為目的條帶。根據(jù)PCR擴增結(jié)果和核苷酸測序結(jié)果可知,擴增mhp677基因片段的退火溫度范圍為30℃-60℃。圖3.3使用不同的退火溫度擴增豬肺炎支原體mhp677基因片段Fig3.3AmplificationofM.hyopneumonaiemhp677genefragmentatdifferentannealingtemperatures.M:DL2000DNAMarker;泳道1-8的退火溫度:30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃。
第3章豬呼吸系統(tǒng)病原菌單重PCR檢測方法的建立31圖3.2使用不同的退火溫度擴增豬鏈球菌gdh基因片段Fig3.2AmplificationofS.suisgdhgenefragmentatdifferentannealingtemperatures.M:DL2000DNAMarker;泳道1-8的退火溫度:30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃。M:DL2000DNAMarker;Annealingtemperaturesinlane1-8:30℃,36℃,42℃,48℃,54℃,60℃,66℃,72℃.3.3.1.3豬肺炎支原體mhp677基因片段退火溫度的確定分別以30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃的退火溫度擴增mhp677基因片段。在退火溫度為30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃時,擴增出一條與目的片段大小相同的526bp的條帶;在退火溫度為66℃和72℃時,沒有條帶擴增出來。將與目的片段大小相同的擴增條帶測序后,與目的基因進行核苷酸序列比對,二者核苷酸序列相同,即擴增的與目的片段大小相同的條帶為目的條帶。根據(jù)PCR擴增結(jié)果和核苷酸測序結(jié)果可知,擴增mhp677基因片段的退火溫度范圍為30℃-60℃。圖3.3使用不同的退火溫度擴增豬肺炎支原體mhp677基因片段Fig3.3AmplificationofM.hyopneumonaiemhp677genefragmentatdifferentannealingtemperatures.M:DL2000DNAMarker;泳道1-8的退火溫度:30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]豬多殺性巴氏桿菌病預(yù)防與臨床診治[J]. 羅俊,彭宇,廖森林,張?zhí)鞚?吳元浩,鄔旭龍. 豬業(yè)科學(xué). 2020(04)
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[4]豬鏈球菌微滴數(shù)字PCR定量檢測方法的建立[J]. 石磊,溫雯,陳洵,葉蕾,常彥磊,李麗麗. 現(xiàn)代食品科技. 2019(01)
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[7]副豬嗜血桿菌血清13型分離鑒定及其培養(yǎng)特性研究[J]. 龐琳琳,趙秋華,王欣,張俊杰,郭爽,李蓓蓓,劉珂,邵東華,邱亞峰,馬志永,王建,魏建超. 中國動物傳染病學(xué)報. 2019(05)
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[10]豬鏈球菌病的研究進展[J]. 浦堅華,毛紫微,王瓊. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2016(04)
博士論文
[1]豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組測序與比較基因組學(xué)分析[D]. 劉威.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]胸膜肺炎放線桿菌、豬肺炎支原體和多殺性巴氏桿菌基因芯片檢測與分型研究[D]. 肖國生.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]豬鏈球菌多重PCR檢測方法的建立及試劑盒研制[D]. 馬燁.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]豬的三種常見呼吸道細菌多重PCR檢測方法的建立[D]. 孫學(xué)飛.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]豬多殺性巴氏桿菌PlpB與Fur基因融合表達及免疫效果評價[D]. 蔣惠婷.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2014
[4]牛源A型多殺性巴氏桿菌plpE基因的克隆表達及DNA疫苗的研究[D]. 黃園媛.西南大學(xué) 2013
[5]豬多殺性巴氏桿菌分離鑒定及其PMT毒素免疫原性研究[D]. 張軍虎.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]副豬嗜血桿菌,豬傳染性胸膜肺炎放線桿菌和豬鏈球菌2型三重PCR方法的建立與應(yīng)用[D]. 張仁良.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[7]重組多殺性巴氏桿菌細菌幽靈的研究[D]. 劉東勝.南昌大學(xué) 2008
[8]兔多殺性巴氏桿菌鐵調(diào)節(jié)外膜蛋白的免疫原性、表位及耐藥性的分析[D]. 顧宏偉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
本文編號:3487789
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
使用不同的退火溫度擴增巴氏桿菌plpE基因片段
第3章豬呼吸系統(tǒng)病原菌單重PCR檢測方法的建立31圖3.2使用不同的退火溫度擴增豬鏈球菌gdh基因片段Fig3.2AmplificationofS.suisgdhgenefragmentatdifferentannealingtemperatures.M:DL2000DNAMarker;泳道1-8的退火溫度:30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃。M:DL2000DNAMarker;Annealingtemperaturesinlane1-8:30℃,36℃,42℃,48℃,54℃,60℃,66℃,72℃.3.3.1.3豬肺炎支原體mhp677基因片段退火溫度的確定分別以30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃的退火溫度擴增mhp677基因片段。在退火溫度為30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃時,擴增出一條與目的片段大小相同的526bp的條帶;在退火溫度為66℃和72℃時,沒有條帶擴增出來。將與目的片段大小相同的擴增條帶測序后,與目的基因進行核苷酸序列比對,二者核苷酸序列相同,即擴增的與目的片段大小相同的條帶為目的條帶。根據(jù)PCR擴增結(jié)果和核苷酸測序結(jié)果可知,擴增mhp677基因片段的退火溫度范圍為30℃-60℃。圖3.3使用不同的退火溫度擴增豬肺炎支原體mhp677基因片段Fig3.3AmplificationofM.hyopneumonaiemhp677genefragmentatdifferentannealingtemperatures.M:DL2000DNAMarker;泳道1-8的退火溫度:30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃。
第3章豬呼吸系統(tǒng)病原菌單重PCR檢測方法的建立31圖3.2使用不同的退火溫度擴增豬鏈球菌gdh基因片段Fig3.2AmplificationofS.suisgdhgenefragmentatdifferentannealingtemperatures.M:DL2000DNAMarker;泳道1-8的退火溫度:30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃。M:DL2000DNAMarker;Annealingtemperaturesinlane1-8:30℃,36℃,42℃,48℃,54℃,60℃,66℃,72℃.3.3.1.3豬肺炎支原體mhp677基因片段退火溫度的確定分別以30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃的退火溫度擴增mhp677基因片段。在退火溫度為30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃時,擴增出一條與目的片段大小相同的526bp的條帶;在退火溫度為66℃和72℃時,沒有條帶擴增出來。將與目的片段大小相同的擴增條帶測序后,與目的基因進行核苷酸序列比對,二者核苷酸序列相同,即擴增的與目的片段大小相同的條帶為目的條帶。根據(jù)PCR擴增結(jié)果和核苷酸測序結(jié)果可知,擴增mhp677基因片段的退火溫度范圍為30℃-60℃。圖3.3使用不同的退火溫度擴增豬肺炎支原體mhp677基因片段Fig3.3AmplificationofM.hyopneumonaiemhp677genefragmentatdifferentannealingtemperatures.M:DL2000DNAMarker;泳道1-8的退火溫度:30℃、36℃、42℃、48℃、54℃、60℃、66℃、72℃。
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[4]豬鏈球菌微滴數(shù)字PCR定量檢測方法的建立[J]. 石磊,溫雯,陳洵,葉蕾,常彥磊,李麗麗. 現(xiàn)代食品科技. 2019(01)
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[6]豬鏈球菌毒力因子研究新進展[J]. 張海燕,黎婷,張冬冬,蕭晟. 蕪湖職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)報. 2018(03)
[7]副豬嗜血桿菌血清13型分離鑒定及其培養(yǎng)特性研究[J]. 龐琳琳,趙秋華,王欣,張俊杰,郭爽,李蓓蓓,劉珂,邵東華,邱亞峰,馬志永,王建,魏建超. 中國動物傳染病學(xué)報. 2019(05)
[8]副豬嗜血桿菌PCR檢測方法的建立及應(yīng)用[J]. 梁喬,楊本勇,石霖,李井春,張健,趙鳳菊. 現(xiàn)代畜牧獸醫(yī). 2018(09)
[9]7種豬呼吸道綜合征疾病病原多重PCR方法的建立[J]. 任梅滲,冷依伊,蒙正群,張鵬飛,楊澤曉,姚學(xué)萍,王印. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2017(07)
[10]豬鏈球菌病的研究進展[J]. 浦堅華,毛紫微,王瓊. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2016(04)
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[1]豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組測序與比較基因組學(xué)分析[D]. 劉威.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]胸膜肺炎放線桿菌、豬肺炎支原體和多殺性巴氏桿菌基因芯片檢測與分型研究[D]. 肖國生.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]豬鏈球菌多重PCR檢測方法的建立及試劑盒研制[D]. 馬燁.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]豬的三種常見呼吸道細菌多重PCR檢測方法的建立[D]. 孫學(xué)飛.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]豬多殺性巴氏桿菌PlpB與Fur基因融合表達及免疫效果評價[D]. 蔣惠婷.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2014
[4]牛源A型多殺性巴氏桿菌plpE基因的克隆表達及DNA疫苗的研究[D]. 黃園媛.西南大學(xué) 2013
[5]豬多殺性巴氏桿菌分離鑒定及其PMT毒素免疫原性研究[D]. 張軍虎.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]副豬嗜血桿菌,豬傳染性胸膜肺炎放線桿菌和豬鏈球菌2型三重PCR方法的建立與應(yīng)用[D]. 張仁良.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[7]重組多殺性巴氏桿菌細菌幽靈的研究[D]. 劉東勝.南昌大學(xué) 2008
[8]兔多殺性巴氏桿菌鐵調(diào)節(jié)外膜蛋白的免疫原性、表位及耐藥性的分析[D]. 顧宏偉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
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