傳染性支氣管炎CK/CH/HD/190716株的分離鑒定與全基因組分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-07 21:29
對(duì)河北某免疫雞場(chǎng)采集疑似感染傳染性支氣管炎病毒(IBV)雞的肺臟進(jìn)行病毒分離,并通過(guò)雞胚接種和全基因序列測(cè)定分析,對(duì)分離病毒進(jìn)行鑒定和遺傳變異分析。分離到1株IBV,命名為CK/CH/HD/190716,該病毒接種雞胚后可產(chǎn)生IBV特征性的侏儒胚。該病毒基因組總長(zhǎng)為27 680 bp,其中Ploy A尾含有16個(gè)A。將分離株基因序列與不同基因型的IBV毒株進(jìn)行同源比對(duì),構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹(shù)進(jìn)行基因分型,證實(shí)該毒株屬于QX型。選取我國(guó)分離的14株QX型IBV與之比較同源性,發(fā)現(xiàn)該型病毒全基因組的同源性在93%~97%,但是5a基因的同源性最低,只有80%,表明IBV各基因之間的進(jìn)化具有顯著差異。隨后通過(guò)多個(gè)重組軟件分析證實(shí),該毒株的1a基因部分區(qū)域由QX型野毒KX425847和KU317090重組產(chǎn)生。本試驗(yàn)揭示了我國(guó)流行的QX型IBV存在基因多樣性,需要對(duì)該型病毒的遺傳演化進(jìn)行密切監(jiān)測(cè)。
【文章來(lái)源】:中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2020,56(06)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
基于全基因組序列進(jìn)化樹(shù)分析
CK/CH/HD/190716株致雞胚病變
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]1株QX基因型雞傳染性支氣管炎病毒的致病性[J]. 潘力,于可響,李桂明,劉存霞,李玉峰,楊世發(fā),萬(wàn)仁忠,李智勇,趙增成,林樹(shù)乾. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(08)
[2]2013~2017年雞傳染性支氣管炎病毒分子流行病學(xué)分析[J]. 陳良珂,封柯宇,李鴻鑫,藺文成,陳偉國(guó),謝青梅. 中國(guó)家禽. 2018(15)
[3]淺談雞傳染性支氣管炎診斷和防治措施[J]. 黃清程. 中國(guó)畜禽種業(yè). 2017(03)
[4]2012~2013年雞傳染性支氣管炎病毒廣西分離株S1基因序列分析與血清型鑒定[J]. 張麗華,吳翠蘭,張志鵬,何怡寧,李和鳴,秦麗莉,韋天超,磨美蘭,韋平. 病毒學(xué)報(bào). 2016(01)
[5]QX基因型雞傳染性支氣管炎病毒致弱研究[J]. 霍亞飛,許傳田,崔言順,楊少華,黃慶華,張琳,黃艷艷,李建亮,胡北俠,張秀美. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(03)
[6]雞傳染性支氣管炎病毒的研究進(jìn)展[J]. 李善臣. 中國(guó)畜禽種業(yè). 2014(12)
[7]雞傳染性支氣管炎病毒感染的分子機(jī)制[J]. 孫裴,施雷,魏建忠,李郁,王桂軍. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(12)
[8]雞傳染性支氣管炎病毒HH06分離株的鑒定及其S1基因的分子特征[J]. 馬德星,潘龍,任曉峰,王金俠,李廣興. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2007(11)
[9]雞傳染性支氣管炎病毒中國(guó)分離株S1基因的序列分析[J]. 陳峰,周慶豐,廖秋生,吳孔興,畢英佐,曹永長(zhǎng). 中國(guó)獸醫(yī)科技. 2005(07)
碩士論文
[1]2012~2013年IBV廣西分離株的基因序列分析和血清學(xué)鑒定[D]. 吳翠蘭.廣西大學(xué) 2015
[2]雞傳染性支氣管炎病毒國(guó)內(nèi)分離株LX4 5a、5b及N基因的研究[D]. 杜恩岐.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2003
本文編號(hào):3482435
【文章來(lái)源】:中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2020,56(06)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
基于全基因組序列進(jìn)化樹(shù)分析
CK/CH/HD/190716株致雞胚病變
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]1株QX基因型雞傳染性支氣管炎病毒的致病性[J]. 潘力,于可響,李桂明,劉存霞,李玉峰,楊世發(fā),萬(wàn)仁忠,李智勇,趙增成,林樹(shù)乾. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(08)
[2]2013~2017年雞傳染性支氣管炎病毒分子流行病學(xué)分析[J]. 陳良珂,封柯宇,李鴻鑫,藺文成,陳偉國(guó),謝青梅. 中國(guó)家禽. 2018(15)
[3]淺談雞傳染性支氣管炎診斷和防治措施[J]. 黃清程. 中國(guó)畜禽種業(yè). 2017(03)
[4]2012~2013年雞傳染性支氣管炎病毒廣西分離株S1基因序列分析與血清型鑒定[J]. 張麗華,吳翠蘭,張志鵬,何怡寧,李和鳴,秦麗莉,韋天超,磨美蘭,韋平. 病毒學(xué)報(bào). 2016(01)
[5]QX基因型雞傳染性支氣管炎病毒致弱研究[J]. 霍亞飛,許傳田,崔言順,楊少華,黃慶華,張琳,黃艷艷,李建亮,胡北俠,張秀美. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(03)
[6]雞傳染性支氣管炎病毒的研究進(jìn)展[J]. 李善臣. 中國(guó)畜禽種業(yè). 2014(12)
[7]雞傳染性支氣管炎病毒感染的分子機(jī)制[J]. 孫裴,施雷,魏建忠,李郁,王桂軍. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(12)
[8]雞傳染性支氣管炎病毒HH06分離株的鑒定及其S1基因的分子特征[J]. 馬德星,潘龍,任曉峰,王金俠,李廣興. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2007(11)
[9]雞傳染性支氣管炎病毒中國(guó)分離株S1基因的序列分析[J]. 陳峰,周慶豐,廖秋生,吳孔興,畢英佐,曹永長(zhǎng). 中國(guó)獸醫(yī)科技. 2005(07)
碩士論文
[1]2012~2013年IBV廣西分離株的基因序列分析和血清學(xué)鑒定[D]. 吳翠蘭.廣西大學(xué) 2015
[2]雞傳染性支氣管炎病毒國(guó)內(nèi)分離株LX4 5a、5b及N基因的研究[D]. 杜恩岐.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2003
本文編號(hào):3482435
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