本研究旨在探索環(huán)狀RNA（circular RNA,circRNA）在香豬皮膚、皮下脂肪及背最長肌的表達(dá)及其潛在功能。本研究采用RNA-Seq技術(shù)和生物信息學(xué)方法,分析香豬皮膚、皮下脂肪及背最長肌circRNA的表達(dá),對3種組織特有circRNA親本基因進(jìn)行GO和KEGG富集分析,對樣品組織結(jié)構(gòu)功能相關(guān)親本基因中circRNA結(jié)合的靶miRNA進(jìn)行預(yù)測。從香豬3種組織表達(dá)譜中共鑒定出6 483個(gè)circRNAs,皮膚、皮下脂肪及背最長肌分別鑒定出4 575、5 180、5 219個(gè)circRNAs,其中特異性表達(dá)的分別有83、234、586個(gè);circRNAs在染色體上分布廣泛,主要來源于外顯子,少數(shù)來源于內(nèi)含子和基因間隔區(qū);多數(shù)circRNAs表達(dá)量較低;皮膚特有circRNAs的親本基因主要參與蛋白水解、RNA轉(zhuǎn)運(yùn)、縫隙連接等過程,其中NF1、MAPK1等親本基因與皮膚性疾病相關(guān),可能以circRNAs的形式發(fā)揮作用,其中親本基因MAPK1中的circRNA（circ-MAPK1）可結(jié)合miR-18a、miR-132、miR-411等,可能參與調(diào)控膠原蛋白的形成;皮下脂肪特有cir... 

【文章來源】：中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(12)北大核心

【文章頁數(shù)】：12 頁

【部分圖文】：

circRNA數(shù)量分布維恩圖

circRNA來源比例

circRNA在染色體上分布

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]miR-18a對人正常滋養(yǎng)細(xì)胞中MMP-2、MMP-9表達(dá)的影響[J]. 楊洋,陳蕊,王穩(wěn)瑩,劉成娟.  國際婦產(chǎn)科學(xué)雜志. 2019(04)
[2]miR-181a對牛骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞分化的影響[J]. 朱新峰,李樹峰,嚴(yán)云勤,佟慧麗,郝衛(wèi)杰,朱月.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(21)
[3]中國小型豬種——香豬[J]. 張博生,馬君峰.  畜牧獸醫(yī)雜志. 2015(04)

博士論文
[1]miR-378a-3p、miR-107和相關(guān)circRNA調(diào)控牛肌細(xì)胞發(fā)育的機(jī)制研究[D]. 魏雪鋒.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017



本文編號：3479991