發(fā)布時(shí)間：2021-11-04 14:36

　　肝臟在脂質(zhì)代謝、消化、吸收、合成和分解過程中均發(fā)揮關(guān)鍵作用。在強(qiáng)飼狀態(tài)下,鵝能將大量脂肪沉積在肝臟中,導(dǎo)致肝脂肪變性,但不損害肝臟的功能。在停止飼喂后,鵝肥肝可以恢復(fù)到正常狀態(tài)。鵝肥肝的研究無論是在醫(yī)學(xué)還是在畜禽分子育種上,均具有重要意義。本試驗(yàn)使用Roche 454 GSFLX測序平臺(tái)對朗德鵝三個(gè)不同填飼狀態(tài)下的肝臟組織進(jìn)行測序,對挖掘到的ACAA1基因進(jìn)行克隆測序分析,結(jié)果如下:1.通過轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得3,824,961個(gè)原始轉(zhuǎn)錄本,其中正常組（NL）,填飼組（FL）和恢復(fù)組（CL）分別為1,423,917、1,153,743和1,247,301個(gè)。包括37,973個(gè)isogenes,通過BLASTX對比,發(fā)現(xiàn)19,752個(gè)（所有序列的52.02%）isogenes與公共數(shù)據(jù)庫匹配良好。2.進(jìn)一步進(jìn)行功能注釋分析發(fā)現(xiàn):具有GO注釋的unigenes有3562個(gè),具有COG注釋的有1,196個(gè),注釋到KEGG通路的有285個(gè),這些基因主要涉及脂肪酸合成、代謝、結(jié)合等途徑。3.基于三個(gè)文庫的差異表達(dá)基因比較,鑒定出1,156個(gè)差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本,主要涉及糖類代謝、脂質(zhì)合成、代謝、分泌和... 

【文章來源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２拼接結(jié)果長度分布圖??

在生物過程類別中，前三項(xiàng)分別為細(xì)胞過程、代謝過程和單一生物過程。在??細(xì)胞組分中條目最多的的前三項(xiàng)為細(xì)胞、細(xì)胞部分和細(xì)胞器。在分子功能類別中，??結(jié)合和催化活性的頻率最高（圖４）。在這些ＧＯ分類中“”ｃｅｌｌ?ｋｉｌｌｉｎｇ，?ｎｕｃｌｅｏｉｄ，??ｓｙｍｐｌａｓｔ，?ｖｉｒｉｏｎ，?ｃｈｅｍｏｒｅｐｅｌｌｅｎｔ?ａｃｔｉｖｉｔｙ，?ｃｈｅｍｏａｔｔｒａｃｔａｎｔ?ａｃｔｉｖｉｔｙ，?ｎｕｔｒｉｅｎｔ?ｅａｓｅｒｖｏｉｒ??ａｃｔｉｖｉｔｙ，ｒｅｃｅｐｔｏｒ?ｒｅｇｕｌａｔｏｒ?ａｃｔｉｖｉｔｙ，?ａｎｔｉｏｘｉｄａｎｔ?ａｃｔｉｖｉｔｙ?等注釋被發(fā)現(xiàn)。這些?ＧＯ??注釋為研究鵝的特定生物過程、功能及細(xì)胞結(jié)構(gòu)提供了有價(jià)值的資源。??１００?－１?「１４２９２??ｉ?：?｜｜?ｌｉｌｉｌｉ?ｉｉｉｉｉｉｉｌ?１?ｉ，?１ＩＩ，???Ｉ??Ｉ?Ｊｌ丨丨丨丨丨丨丨丨Ｉ丨丨丨丨丨丨丨丨丨ＪＩＩ?ＩＭ?：?七Ｉ??／觀罐”：舞’??／／／；／?／／／／／??ｂｉｏｌｏｇｌｃａｌｊＤｒｏｃｅｓｓ?ｃｅｌｌｉ?ｊｔｅｒ＿ｃｏｍ?ｐａｎｅｎｌ?ｍｏｌｅｃｕｌａ＾ｆｕｎｃｔｉｃｗｉ??圖４拼接的ｉｓｏｇｅｎｅｓ?ＧＯ分類??Ｆｉｇ．?４?Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏｇｙ?（ＧＯ）?ｃａｔｅｇｏｒｉｅｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ａｓｓｅｍｂｌｅｄ?ｉｓｏｇｅｎｅｓ．??將所有ｉｓｏｇｅｎｅｓ經(jīng)ＮＲ數(shù)據(jù)庫篩選后與ＣＯＧ，?ＫＯＧ數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對，發(fā)??現(xiàn)有４，３５１、７，４３３個(gè)ｉｓｏｇｅｎｅｓ分別分配到ＣＯＧ和ＫＯＧ功能類別中。在２５個(gè)??ＣＯＧ功能類別（圖５）中

赴?碩?焙汀昂私峁埂敝揮猩偈?椋螅錚紓澹睿澹螅崳?匹配。然而，沒有ｉｓｏｇｅｎｅｓ分配到“細(xì)胞外結(jié)構(gòu)”類別。在２５個(gè)ＫＯＧ類別（圖６）??中，“信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制”、“一般功能預(yù)測”和“翻譯后修飾、蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)率、分子伴??侶”占主導(dǎo)地位。而“細(xì)胞壁／膜／胞膜生物發(fā)生”，“核結(jié)構(gòu)”和“細(xì)胞運(yùn)動(dòng)”比例很小。??另外，１５４個(gè)，６７７個(gè)和ｉｓｏｇｅｎｅｓ沒有被賦予任何功能類別的ＣＯＧ，ＫＯＧ。??ＣＯＧ?Ｆｕｎｃｔｉｏｎ?Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ??Ａ：?ＲＭＡ?ｐｒｏｃｅｓｓ?ｎｇ?ａｎｄ?ｍｏｄｉｆｔｅａｌｉｃｗ??Ｂ?：?ＣｔｆｆｏｒｎＢｌｉｎ?ｓｔｆｕｃｌｕｒｅ?ａｔｖｄ?ｄｙｒｖａｍｃａ??Ｃ?：?Ｅｎｅｒｇｙ?ｐｒｏｄｕｃｌｓｏｎ?ａｒ＞ｄ?＃櫻荊鰨澹潁螅椹枺睿崳?Ｄ?：?Ｃｅｌｌ?ｔｙｅｌｅ?說?＿ｌｌ?切吣巾〇勢ｒＮ？?ｐ＊ｒ；ｉＵｏｎｉｎｇ??Ｅ?：?Ａｍｉｎａ?ａｃ４ｄ?ｉｒａｎｓｐｗｔ?ａｎｄ?ｍｅＥａｂｏｆｅｓｍ??１１０４?－?Ｆ?：?Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ?ｔｆａａｓｐｏｒ?ａｎｄ?ｎ？ｌａｆｃｏｌｉｓｍ??Ｇ?Ｃａｒｂｏｈｙ－ｄｒａｔｅ?Ｉｒａｎｓｐ＾ｔ?ａｒｉｄ?ｍｅｌ：ａｂ？＞Ｓｒｓｒｎ??＾?Ｈ?：?ＣｂＳｒｔｔｙｍｅ?Ｓｒａｒ＾ｐＯｒｔ?ａｎｄ?ＰｌｉａｔａｂｏＢＳｉＴｌ??運(yùn)－?Ｋ：?Ｌｉｐｅｄ?ｔｒａｎｓｐｏｒｔ?ａｒｅｄ?ｒｎｅｃａｂｏｌＢｍ??，旨＞?８．２８?一?■?ｊ?：?Ｔｆａ＿ｔｉ〇ｎ，咖§〇＿?軟ｆｙｄ腳挪?ｂｔｏｇｅｎｅｓａｓ??ＺＤ?■?Ｋ?：?Ｔｒａｎｓ?ｃｒｉｐｌｉａｎ??Ｏ?Ｉ?Ｌ?：?Ｒｅｐｌｒｃｆｔｔｉｏｎ

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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