山羊C/EBPα、C/EBPβ和C/EBPδ基因克隆及表達(dá)模式研究
發(fā)布時(shí)間:2021-10-30 14:05
在克隆獲得山羊C/EBPα、C/EBPβ和C/EBPδ基因序列基礎(chǔ)上分析該家族成員序列特征,明確組織表達(dá)特性,并揭示3個(gè)基因在山羊肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞分化過程中的表達(dá)情況。采用RT-PCR方法克隆山羊C/EBPα、C/EBPβ和C/EBPδ基因序列,利用相關(guān)的生物軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析,利用qPCR檢測3個(gè)基因在山羊各組織及山羊肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞成脂分化中的表達(dá)情況?寺〉玫紺/EBPα、C/EBPβ和C/EBPδ基因序列分別為1 062,1 056,873 bp,所編碼的蛋白均為不穩(wěn)定親水堿性蛋白,均無信號肽和跨膜結(jié)構(gòu)域。C/EBPα在皮下脂肪中表達(dá)水平最高,C/EBPβ和C/EBPδ均在肺中表達(dá)水平最高。在前體脂肪細(xì)胞分化過程中C/EBPα和C/EBPδ均在前體脂肪細(xì)胞分化前表達(dá)水平最高,隨著分化時(shí)間的增加表達(dá)水平降低,C/EBPβ在肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞中的表達(dá)隨著誘導(dǎo)分化天數(shù)的增加而增加,在分化7 d時(shí)表達(dá)水平最高。基于以上研究,推測3個(gè)基因在山羊肌內(nèi)脂肪細(xì)胞分化過程中發(fā)揮著重要作用。
【文章來源】:華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2020,35(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
山羊C/EBPα (A)、C/EBPβ (B)和C/EBPδ (C)蛋白二級結(jié)構(gòu)
C/EBPδ蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示,有53.52%的氨基酸形成無規(guī)則卷曲,42.58%的氨基酸形成α-螺旋,剩余3.91%的氨基酸可能形成延伸鏈(圖1-C)。該蛋白無信號肽結(jié)構(gòu),無跨膜結(jié)構(gòu)域。該蛋白可能和C/EBPα、C/EBPβ、PPARG、SP1和MYC等蛋白存在相互作用(圖2-C)。2.2.3 氨基酸序列的同源性比對及構(gòu)建進(jìn)化樹
以皮下脂肪組織作為對照,分別對C/EBPα、C/EBPβ和C/EBPδ 3個(gè)基因的定量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析并繪制組織表達(dá)譜(圖5)。qPCR結(jié)果顯示3個(gè)基因的mRNA組織表達(dá)較為廣泛,其中C/EBPα基因在皮下脂肪中表達(dá)水平最高,其次在肝中也有較高水平的表達(dá);C/EBPβ和C/EBPδ在山羊組織的表達(dá)模式相似,均在肺中表達(dá)水平最高。圖5 C/EBPα、C/EBPβ和C/EBPδ基因在山羊各組織中的相對表達(dá)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]山羊肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞誘導(dǎo)分化過程中內(nèi)參基因的表達(dá)穩(wěn)定性分析[J]. 許晴,林森,朱江江,王永,林亞秋. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(05)
[2]不同品種豬PPARγ和C/EBPα基因表達(dá)規(guī)律與肌內(nèi)脂肪含量的相關(guān)[J]. 盤道興,王振,楊茂林,廖喬平,楊昌平,吳宇萍,王金洲,劉若余. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(01)
碩士論文
[1]鴨C/EBPα,C/EBPβ和C/EBPδ基因的克隆及在脂肪組織中的發(fā)育性表達(dá)研究[D]. 王萬霞.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]雞脂肪分化轉(zhuǎn)錄因子PPARγ和C/EBPα抗體制備及功能研究[D]. 王娉.新疆大學(xué) 2007
本文編號:3466863
【文章來源】:華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2020,35(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
山羊C/EBPα (A)、C/EBPβ (B)和C/EBPδ (C)蛋白二級結(jié)構(gòu)
C/EBPδ蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示,有53.52%的氨基酸形成無規(guī)則卷曲,42.58%的氨基酸形成α-螺旋,剩余3.91%的氨基酸可能形成延伸鏈(圖1-C)。該蛋白無信號肽結(jié)構(gòu),無跨膜結(jié)構(gòu)域。該蛋白可能和C/EBPα、C/EBPβ、PPARG、SP1和MYC等蛋白存在相互作用(圖2-C)。2.2.3 氨基酸序列的同源性比對及構(gòu)建進(jìn)化樹
以皮下脂肪組織作為對照,分別對C/EBPα、C/EBPβ和C/EBPδ 3個(gè)基因的定量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析并繪制組織表達(dá)譜(圖5)。qPCR結(jié)果顯示3個(gè)基因的mRNA組織表達(dá)較為廣泛,其中C/EBPα基因在皮下脂肪中表達(dá)水平最高,其次在肝中也有較高水平的表達(dá);C/EBPβ和C/EBPδ在山羊組織的表達(dá)模式相似,均在肺中表達(dá)水平最高。圖5 C/EBPα、C/EBPβ和C/EBPδ基因在山羊各組織中的相對表達(dá)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]山羊肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞誘導(dǎo)分化過程中內(nèi)參基因的表達(dá)穩(wěn)定性分析[J]. 許晴,林森,朱江江,王永,林亞秋. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(05)
[2]不同品種豬PPARγ和C/EBPα基因表達(dá)規(guī)律與肌內(nèi)脂肪含量的相關(guān)[J]. 盤道興,王振,楊茂林,廖喬平,楊昌平,吳宇萍,王金洲,劉若余. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(01)
碩士論文
[1]鴨C/EBPα,C/EBPβ和C/EBPδ基因的克隆及在脂肪組織中的發(fā)育性表達(dá)研究[D]. 王萬霞.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]雞脂肪分化轉(zhuǎn)錄因子PPARγ和C/EBPα抗體制備及功能研究[D]. 王娉.新疆大學(xué) 2007
本文編號:3466863
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