藏豬俗稱“藏雪豚”，是生活在青藏高原的本地家養(yǎng)動物之一。由于青藏高原地理位置險峻，自然環(huán)境極端，比如低氧、強紫外線輻射和氣溫低等，藏豬為了適應(yīng)這種環(huán)境生存和生產(chǎn)，已經(jīng)形成了許多的特性如：適應(yīng)低氧環(huán)境，抗紫外線輻射，抗病性，反應(yīng)靈敏等。藏豬這些特性引起了越來越多科研工作人員的興趣，目前已經(jīng)有一些文章報道了藏豬高原適應(yīng)性的分子遺傳機理。但由于青藏高原地域遼闊，不同地域的藏豬進化歷史略有不同，且藏豬高原適應(yīng)性的遺傳機理復(fù)雜，藏豬高原適應(yīng)性的分子機理還需要更為深入的研究。本研究使用高密度SNP基因芯片對來自5個藏區(qū)和28個低原地區(qū)群體的共593頭豬進行基因分型。同時我們整合了來自Dryad網(wǎng)站的6個中西方豬種共85頭豬的60k基因芯片分型數(shù)據(jù)。通過一系列的遺傳統(tǒng)計分析工具和基因組學(xué)方法，我們發(fā)現(xiàn)5個藏豬群體在進化和地理位置上有明顯的分化，將其分為西藏藏豬（TT），甘肅藏豬（GST）和四川云南藏豬（SCYN）三個群體。通過使用基于種群分化系數(shù)FST的LSBL分析方法，應(yīng)用0.5%的LSBL分布臨界閾值，我們分別鑒定到207個藏豬群體特有的和共享的高原適應(yīng)性正向選擇候選位點。相對應(yīng)地，在甘肅藏豬、... 

【文章來源】：江西農(nóng)業(yè)大學(xué)江西省

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
    1 青藏高原地貌特征
    2 藏豬的生物學(xué)特征及分布
        2.1 藏豬的生物學(xué)特征
        2.2 藏豬的分布
    3 藏豬近年來研究概況
    4 其他物種高原適應(yīng)性研究概況
    5 EGLN1、EPAS1、和 ADAM17 基因
        5.1 EGLN1 基因
        5.2 EPAS1 基因
        5.3 ADAM17 基因
    6 藏豬高原適應(yīng)性基礎(chǔ)遺傳機理尚未解決的問題
    7 本研究的目的及意義
第二章 研究正文
    1 引言
    2 實驗材料和方法
        2.1 實驗動物
        2.2 實驗樣品準備
        2.3 60k 芯片掃描實驗
        2.4 EGLN1﹑EPAS1 和 ADAM17 基因區(qū)域中 56 個 SNPs 的挑選
        2.5 統(tǒng)計分析
        2.6 候選基因的注釋及 GO、KEGG 分析
    3 結(jié)果
        3.1 不同藏豬群體特異的選擇信號
        3.2 藏豬群體共享的全基因組選擇信號
        3.3 EGLN1、EPAS1、ADAM17 三個基因在藏豬中的信號選擇
    4 分析與討論
        4.1 LSBL 統(tǒng)計方法
        4.2 藏豬群體特異性受選擇的信號結(jié)果分析
        4.3 藏豬共享的受選擇位點和基因
        4.4 EGLN1、EPAS1 和 ADAM17 三個基因在藏豬中選擇信號
        4.5 展望
小結(jié)
參考文獻
致謝
附錄


【參考文獻】：
期刊論文
[1]高原環(huán)境中藏豬血液生理指標測定與比較[J]. 強巴央宗,張浩,白瑪央宗,劉金鳳,商鵬,丹增旺久.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2011(06)
[2]藏豬在高山峽谷地區(qū)舍飼飼養(yǎng)觀察[J]. 吳建平,李有智,馮衛(wèi)東,王麗萍,楊定康.  畜禽業(yè). 2010(05)
[3]兩個藏豬類群微衛(wèi)星DNA遺傳多樣性的研究[J]. 張亞妮,張恩平,吳迪,張濤,李相運,任戰(zhàn)軍,耿社民.  西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2004(06)
[4]青藏高原的主要環(huán)境效應(yīng)[J]. 莫申國,張百平,程維明,譚婭,肖飛,武紅智.  地理科學(xué)進展. 2004(02)
[5]初論陸-陸碰撞與成礦作用——以青藏高原造山帶為例[J]. 侯增謙,呂慶田,王安建,李曉波,王宗起,王二七.  礦床地質(zhì). 2003(04)
[6]小型豬在醫(yī)學(xué)實驗中的應(yīng)用[J]. 詹純列,徐本法,白朝暉.  中國實驗動物學(xué)雜志. 2000(02)
[7]藏豬起源和品種遺傳獨特性的研究[J]. 田志華,張成忠,鐘金城,袁季廣.  西南民族學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版). 1999(04)
[8]藏豬血液蛋白多態(tài)性的研究[J]. 田志華,張成忠,鐘金城,袁季廣.  西南民族學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版). 1999(03)
[9]藏豬調(diào)查研究報告[J]. 段誠中.  中國畜牧雜志. 1980(01)

博士論文
[1]藏豬β-珠蛋白基因與其低氧遺傳適應(yīng)的關(guān)系[D]. 楊會強.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
[2]藏豬幾個重要遺傳特性基因的研究[D]. 應(yīng)三成.四川大學(xué) 2007

碩士論文
[1]藏豬行為學(xué)觀察及規(guī)模養(yǎng)殖工藝研究[D]. 康健.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013



本文編號：3462598