豬CAST基因多態(tài)性分析及發(fā)育性表達研究
發(fā)布時間:2021-10-24 08:07
CAST基因被認為是影響肉質(zhì)性狀的候選基因,本試驗從基因多態(tài)性水平和基因表達水平研究不同豬種CAST基因第2內(nèi)含子和外顯子9的多態(tài)性分布,以及CAST基因在馬身豬和大白豬背最長肌組織中的表達分析,以期為馬身豬優(yōu)良肉質(zhì)遺傳分子機理提供理論基礎(chǔ)。豬CAST基因第2內(nèi)含子中存在以GT為核心序列的微衛(wèi)星座位。本試驗檢測了5個豬種(馬身豬、山西黑豬、大白豬、長白豬、杜洛克豬)共227個個體在該座位的遺傳多態(tài)性,檢測到4個等位基因:A(171bp)、B(179bp)、C(185bp)、D(191bp)。所檢測的豬群體中,馬身豬群體以B等位基因為主(基因頻率為0.6310),山西黑豬和杜洛克豬群體以D等位基因為主(基因頻率分別為0.6389和0.5143),長白豬和大白豬群體中4種基因頻率相近。所選擇的豬群體中,共有10種基因型被檢測到,大白豬和長白豬群體的基因型以純合子為主,遺傳純合度分別為0.7037和0.6667。馬身豬和山西黑豬群體的基因型以雜合子為主,遺傳雜合度分別為0.5476和0.6111。采用PCR-SSCP技術(shù)檢測了杜洛克豬、大白豬、長白豬、晉汾白豬、山西黑豬和馬身豬6個品種共41...
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
中英文縮略對照表
前言
文獻綜述
1 鈣蛋白酶系統(tǒng)簡介
1.1 鈣蛋白酶系統(tǒng)的發(fā)現(xiàn)
1.2 鈣蛋白酶系統(tǒng)的功能
1.3 影響鈣蛋白酶系統(tǒng)的因素
2 CAST基因的研究進展
2.1 CAST基因的發(fā)現(xiàn)及定位
2.2 CAST蛋白的結(jié)構(gòu)
2.3 CAST蛋白的作用機制
2.4 CAST基因多態(tài)性的研究
2.5 CAST基因表達及功能的研究
試驗一 關(guān)于5個豬種CAST基因第2內(nèi)含子的微衛(wèi)星多態(tài)性分析
1 材料與方法
1.1 試驗動物及材料
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗方法
1.4 統(tǒng)計方法
2 結(jié)果與分析
2.1 豬基因組DNA的提取
2.2 PCR擴增產(chǎn)物檢測
2.3 微衛(wèi)星多態(tài)性檢測結(jié)果
2.4 豬CAST基因第二內(nèi)含子微衛(wèi)星多態(tài)性檢測及分析
3 討論
3.1 豬CAST基因遺傳多態(tài)性及群體遺傳學(xué)分析
3.2 各豬種間遺傳結(jié)構(gòu)比較
試驗二 關(guān)于6個豬種CAST基因第9外顯子多態(tài)性分析
1 材料與方法
1.1 試驗動物及材料
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 CAST基因第9外顯子PCR擴增結(jié)果
2.2 CAST基因第9外顯子SSCP結(jié)果
2.3 不同豬種CAST基因單倍型頻率及顯著性檢驗
2.4 豬CAST基因SSCP多態(tài)位點與生長發(fā)育性狀的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 豬CAST基因外顯子9的多態(tài)性
3.2 CAST基因外顯子9的單倍型對豬體重和體尺性狀的影響
試驗三馬身豬和大白豬CAST基因發(fā)育性表達研究
1 材料與方法
1.1 試驗動物及組織
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 總RNA提取結(jié)果
2.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立與分析
2.3 部分樣品擴增動力學(xué)曲線
2.4 樣品擴增溶解曲線
2.5 CAST基因MRNA的相對豐度分析
3 討論
3.1 關(guān)于RTQF-PCR方法
3.2 試驗結(jié)果的誤差分析
3.3 背最長肌CAST基因表達與豬發(fā)育的相關(guān)性分析
全文結(jié)論
參考文獻
Abstract
致謝
本文編號:3454912
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
中英文縮略對照表
前言
文獻綜述
1 鈣蛋白酶系統(tǒng)簡介
1.1 鈣蛋白酶系統(tǒng)的發(fā)現(xiàn)
1.2 鈣蛋白酶系統(tǒng)的功能
1.3 影響鈣蛋白酶系統(tǒng)的因素
2 CAST基因的研究進展
2.1 CAST基因的發(fā)現(xiàn)及定位
2.2 CAST蛋白的結(jié)構(gòu)
2.3 CAST蛋白的作用機制
2.4 CAST基因多態(tài)性的研究
2.5 CAST基因表達及功能的研究
試驗一 關(guān)于5個豬種CAST基因第2內(nèi)含子的微衛(wèi)星多態(tài)性分析
1 材料與方法
1.1 試驗動物及材料
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗方法
1.4 統(tǒng)計方法
2 結(jié)果與分析
2.1 豬基因組DNA的提取
2.2 PCR擴增產(chǎn)物檢測
2.3 微衛(wèi)星多態(tài)性檢測結(jié)果
2.4 豬CAST基因第二內(nèi)含子微衛(wèi)星多態(tài)性檢測及分析
3 討論
3.1 豬CAST基因遺傳多態(tài)性及群體遺傳學(xué)分析
3.2 各豬種間遺傳結(jié)構(gòu)比較
試驗二 關(guān)于6個豬種CAST基因第9外顯子多態(tài)性分析
1 材料與方法
1.1 試驗動物及材料
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 CAST基因第9外顯子PCR擴增結(jié)果
2.2 CAST基因第9外顯子SSCP結(jié)果
2.3 不同豬種CAST基因單倍型頻率及顯著性檢驗
2.4 豬CAST基因SSCP多態(tài)位點與生長發(fā)育性狀的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 豬CAST基因外顯子9的多態(tài)性
3.2 CAST基因外顯子9的單倍型對豬體重和體尺性狀的影響
試驗三馬身豬和大白豬CAST基因發(fā)育性表達研究
1 材料與方法
1.1 試驗動物及組織
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗方法
2 結(jié)果與分析
2.1 總RNA提取結(jié)果
2.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立與分析
2.3 部分樣品擴增動力學(xué)曲線
2.4 樣品擴增溶解曲線
2.5 CAST基因MRNA的相對豐度分析
3 討論
3.1 關(guān)于RTQF-PCR方法
3.2 試驗結(jié)果的誤差分析
3.3 背最長肌CAST基因表達與豬發(fā)育的相關(guān)性分析
全文結(jié)論
參考文獻
Abstract
致謝
本文編號:3454912
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