FADS2對(duì)雞前脂肪細(xì)胞脂肪酸代謝相關(guān)基因表達(dá)的影響
發(fā)布時(shí)間:2021-10-19 22:34
脂肪酸的含量及比例對(duì)改善雞肉品質(zhì)和風(fēng)味起著重要作用,因此探究調(diào)控脂肪酸代謝的關(guān)鍵基因和作用機(jī)制能夠?yàn)楦纳齐u肉品質(zhì)提供新的科學(xué)依據(jù)。基于前期RNA-seq結(jié)果,確定脂肪酸脫氫酶2(FADS2)為影響雞不飽和脂肪酸比率的關(guān)鍵基因。文章構(gòu)建FADS2基因RNA干擾慢病毒表達(dá)載體,轉(zhuǎn)染雞前脂肪細(xì)胞并鑒定干擾效率,篩選出有效干擾片段并進(jìn)行正式試驗(yàn),通過(guò)設(shè)置陰性對(duì)照組,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序檢測(cè)相關(guān)基因表達(dá)。結(jié)果表明,190個(gè)基因顯著差異性表達(dá),其中65個(gè)基因下調(diào),125個(gè)基因上調(diào)。通過(guò)比較基因組學(xué)和基因功能分析,鑒定出STAT1、LY86、FABP5、OGFR、ACTA1、SLC5A6、NCOA7、KLF2、KLF4、ACSL5和FABP3基因可能是FADS2基因影響脂肪酸代謝的相關(guān)下游基因,為深入研究脂肪酸代謝過(guò)程提供一定的理論基礎(chǔ)。
【文章來(lái)源】:合肥工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,43(09)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 雞前脂肪細(xì)胞的分離及培養(yǎng)
1.2.2 shRNA干擾序列的設(shè)計(jì)與合成
1.2.3 shRNA有效片段篩選
1.2.4 FADS2基因的干擾實(shí)驗(yàn)
1.2.5 基因表達(dá)檢測(cè)
1.2.6 構(gòu)建cDNA文庫(kù)及轉(zhuǎn)錄組序列
1.2.7 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
1.2.8 差異表達(dá)及功能富集分析
2 結(jié)果與分析
2.1 FADS2基因干擾效率檢測(cè)
2.2 FADS2基因干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3 雞前脂肪細(xì)胞的RNA測(cè)序
2.4 差異表達(dá)基因的鑒定
2.5 差異表達(dá)基因的功能富集分析
2.6 下游基因
3 討 論
4 結(jié) 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]牦牛KLF2基因功能區(qū)克隆及組織表達(dá)分析[J]. 林森,林亞秋,柏雪,左璐璐,江明鋒,王永. 家畜生態(tài)學(xué)報(bào). 2017(07)
[2]脂肪酸結(jié)合蛋白5對(duì)奶牛乳腺上皮細(xì)胞乳脂合成的影響[J]. 于萌萌,李萌,李?yuàn)檴?李冬,高學(xué)軍. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2017(04)
[3]中國(guó)荷斯坦牛FADS2基因3′端SNP突變對(duì)乳中脂肪酸組成的影響[J]. 徐晨希,王夢(mèng)琦,朱小瑞,張玉鋒,夏海磊,劉賢慧,王小龍,張慧敏,楊章平,毛永江. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(11)
[4]卵泡刺激素增加雞胸肌中肌內(nèi)脂肪含量和脂質(zhì)合成基因的表達(dá)(英文)[J]. Xiao-yan CUI,Ying-ying LI,Ran-ran LIU,Gui-ping ZHAO,Mai-qing ZHENG,Qing-he LI,Jie WEN. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2016(04)
[5]慢病毒轉(zhuǎn)染大鼠破骨樣細(xì)胞研究[J]. 傅繼凡,陳健. 中國(guó)老年學(xué)雜志. 2016(03)
[6]雞轉(zhuǎn)錄因子C/EBPα、KLF2、KLF3、KLF7、PPARα對(duì)L-FABP啟動(dòng)子活性的影響[J]. 賀綦,史洪巖,王海霞,高廣亮,王啟貴,李輝. 中國(guó)畜牧雜志. 2014(17)
[7]不同物種FABP3基因編碼區(qū)及蛋白生物信息學(xué)分析[J]. 高紅,彭靜,沈一飛,王穎,徐寧迎. 揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2014(01)
[8]中國(guó)荷斯坦奶牛STAT1全長(zhǎng)基因的克隆與序列分析[J]. 宋雪梅,張磊,姜俊芳,石放雄,蔣永清. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2011(05)
[9]多不飽和脂肪酸的研究進(jìn)展[J]. 孫翔宇,高貴田,段愛(ài)莉,顧浩峰,李冰,薛騫. 食品工業(yè)科技. 2012(07)
[10]延邊黃牛背最長(zhǎng)肌差異表達(dá)基因的篩選、克隆及序列分析[J]. 田萬(wàn)年,張守發(fā),李香子,高青山,金鑫,嚴(yán)昌國(guó). 遺傳. 2011(11)
博士論文
[1]PPARG基因?qū)δ躺窖蛉橄僦舅岽x的調(diào)控作用研究[D]. 石恒波.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
碩士論文
[1]優(yōu)質(zhì)肉雞脂肪沉積相關(guān)基因的篩選及其在前脂肪細(xì)胞分化過(guò)程中的表達(dá)研究[D]. 張露.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]奶山羊FABP3和FABP4基因的多態(tài)性與乳脂肪酸成分的關(guān)聯(lián)分析[D]. 張偉.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[3]雞FADS2基因5’端SNP鑒定及啟動(dòng)子功能分析[D]. 朱世康.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]優(yōu)質(zhì)雞不同飼養(yǎng)方式下FADS1、FADS2基因的表達(dá)及其對(duì)脂肪酸組成的影響[D]. 梅秀麗.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3445724
【文章來(lái)源】:合肥工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,43(09)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 雞前脂肪細(xì)胞的分離及培養(yǎng)
1.2.2 shRNA干擾序列的設(shè)計(jì)與合成
1.2.3 shRNA有效片段篩選
1.2.4 FADS2基因的干擾實(shí)驗(yàn)
1.2.5 基因表達(dá)檢測(cè)
1.2.6 構(gòu)建cDNA文庫(kù)及轉(zhuǎn)錄組序列
1.2.7 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
1.2.8 差異表達(dá)及功能富集分析
2 結(jié)果與分析
2.1 FADS2基因干擾效率檢測(cè)
2.2 FADS2基因干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3 雞前脂肪細(xì)胞的RNA測(cè)序
2.4 差異表達(dá)基因的鑒定
2.5 差異表達(dá)基因的功能富集分析
2.6 下游基因
3 討 論
4 結(jié) 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]牦牛KLF2基因功能區(qū)克隆及組織表達(dá)分析[J]. 林森,林亞秋,柏雪,左璐璐,江明鋒,王永. 家畜生態(tài)學(xué)報(bào). 2017(07)
[2]脂肪酸結(jié)合蛋白5對(duì)奶牛乳腺上皮細(xì)胞乳脂合成的影響[J]. 于萌萌,李萌,李?yuàn)檴?李冬,高學(xué)軍. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2017(04)
[3]中國(guó)荷斯坦牛FADS2基因3′端SNP突變對(duì)乳中脂肪酸組成的影響[J]. 徐晨希,王夢(mèng)琦,朱小瑞,張玉鋒,夏海磊,劉賢慧,王小龍,張慧敏,楊章平,毛永江. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(11)
[4]卵泡刺激素增加雞胸肌中肌內(nèi)脂肪含量和脂質(zhì)合成基因的表達(dá)(英文)[J]. Xiao-yan CUI,Ying-ying LI,Ran-ran LIU,Gui-ping ZHAO,Mai-qing ZHENG,Qing-he LI,Jie WEN. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2016(04)
[5]慢病毒轉(zhuǎn)染大鼠破骨樣細(xì)胞研究[J]. 傅繼凡,陳健. 中國(guó)老年學(xué)雜志. 2016(03)
[6]雞轉(zhuǎn)錄因子C/EBPα、KLF2、KLF3、KLF7、PPARα對(duì)L-FABP啟動(dòng)子活性的影響[J]. 賀綦,史洪巖,王海霞,高廣亮,王啟貴,李輝. 中國(guó)畜牧雜志. 2014(17)
[7]不同物種FABP3基因編碼區(qū)及蛋白生物信息學(xué)分析[J]. 高紅,彭靜,沈一飛,王穎,徐寧迎. 揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2014(01)
[8]中國(guó)荷斯坦奶牛STAT1全長(zhǎng)基因的克隆與序列分析[J]. 宋雪梅,張磊,姜俊芳,石放雄,蔣永清. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2011(05)
[9]多不飽和脂肪酸的研究進(jìn)展[J]. 孫翔宇,高貴田,段愛(ài)莉,顧浩峰,李冰,薛騫. 食品工業(yè)科技. 2012(07)
[10]延邊黃牛背最長(zhǎng)肌差異表達(dá)基因的篩選、克隆及序列分析[J]. 田萬(wàn)年,張守發(fā),李香子,高青山,金鑫,嚴(yán)昌國(guó). 遺傳. 2011(11)
博士論文
[1]PPARG基因?qū)δ躺窖蛉橄僦舅岽x的調(diào)控作用研究[D]. 石恒波.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
碩士論文
[1]優(yōu)質(zhì)肉雞脂肪沉積相關(guān)基因的篩選及其在前脂肪細(xì)胞分化過(guò)程中的表達(dá)研究[D]. 張露.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]奶山羊FABP3和FABP4基因的多態(tài)性與乳脂肪酸成分的關(guān)聯(lián)分析[D]. 張偉.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[3]雞FADS2基因5’端SNP鑒定及啟動(dòng)子功能分析[D]. 朱世康.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]優(yōu)質(zhì)雞不同飼養(yǎng)方式下FADS1、FADS2基因的表達(dá)及其對(duì)脂肪酸組成的影響[D]. 梅秀麗.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3445724
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