為研究犬弓首蛔蟲(chóng)（Toxocara canis,T.canis）黏蛋白1基因（Tc-MUC-1）的分子特征,該試驗(yàn)根據(jù)犬弓首蛔蟲(chóng)基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中的Tc-MUC-1基因序列設(shè)計(jì)引物,通過(guò)PCR技術(shù)克隆Tc-MUC-1全長(zhǎng)基因,并進(jìn)行多重序列比對(duì)和種系發(fā)育進(jìn)化樹(shù)分析.結(jié)果發(fā)現(xiàn)該基因全長(zhǎng)為531 bp,編碼176個(gè)氨基酸.功能結(jié)構(gòu)域分析發(fā)現(xiàn)Tc-MUC-1蛋白包含1個(gè)由11個(gè)STSSSSA重復(fù)序列構(gòu)成的Mucin結(jié)構(gòu)域和2個(gè)ShKT結(jié)構(gòu)域; GO分析顯示具有蛋白質(zhì)結(jié)合和金屬離子結(jié)合功能;多重序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)Tc-MUC-1與T.canis的其余4個(gè)黏蛋白（Tc-MUC-2-Tc-MUC-5）均含有2個(gè)由36個(gè)氨基酸組成的ShKT結(jié)構(gòu)域;種系發(fā)育進(jìn)化樹(shù)分析顯示Tc-MUC-1與雙胃線(xiàn)蟲(chóng)（Pristionchus pacificus; GenBank No. PDM76930）和秀麗隱桿線(xiàn)蟲(chóng)（Caenorhabditis elegans; GenBank No. NP491509）進(jìn)化關(guān)系較近. 

【文章來(lái)源】：西南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,42(03)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

Tc-MUC-1基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果

重組菌液的PCR鑒定

從GenBank中檢索到Tc-MUC-1氨基酸序列(GenBank No. AAB05820),Tc-MUC-2(GenBank No. AAD49339),Tc-MUC-3(No. AAD49340),Tc-MUC-4(GenBank No. AAD49341),Tc-MUC-5(GenBank No. AAD49342), 并進(jìn)行多重序列比對(duì). 結(jié)果發(fā)現(xiàn)5個(gè)黏蛋白都是由2個(gè)不同模塊構(gòu)成, 其中一個(gè)是黏蛋白樣富含Ser/Thr的黏蛋白結(jié)構(gòu)域, 可以充當(dāng)O-糖基化的位點(diǎn), 另一個(gè)是36個(gè)氨基酸組成的ShKT結(jié)構(gòu)域. 所有蛋白質(zhì)都含有C末端配對(duì)的ShKT基序, 而Tc-MUC-3和Tc-MUC-5在N末端同樣含有ShKT基序(圖4).圖4 Tc-MUC-1序列多重序列比對(duì)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]犬弓首蛔蟲(chóng)abcg-5基因的克隆及序列分析[J]. 黃漢成,江艾耘,羅永莉,楊曉迪,李相蘭,胡志剛,周榮瓊.  西南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(03)



本文編號(hào)：3443680