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豬zfx基因RNAi片段的篩選及性控效果的觀察

發(fā)布時(shí)間:2021-10-15 17:05
  X染色體耦聯(lián)鋅指蛋白(zinc finger protein,X-linked,Zfx)是鋅指蛋白家族中的一員,Zfx基因是睪丸決定因子(Testis Determining Factor,TDF)的候選基因。Zfx/Zfy是位于哺乳動(dòng)物X染色體和Y染色體上的一對(duì)等位基因,Zfx基因是含有的鋅指結(jié)構(gòu),該結(jié)構(gòu)特點(diǎn)使鋅指蛋白可以選擇性地結(jié)合特異的靶基因,引導(dǎo)靶基因穿過(guò)核膜,定位于精子細(xì)胞核內(nèi),在精子形成過(guò)程中具有一定功能。RNA干擾(RNA interference,RNAi)轉(zhuǎn)錄后水平基因沉默(post transcriptional genesilence, PTGS)現(xiàn)象,是內(nèi)源性或?qū)肴斯ず铣傻男》肿与p鏈RNA特異性降解與其同源的mRNA的過(guò)程,而后形成2025個(gè)堿基大小的小干擾RNA,在mRNA水平上阻斷體內(nèi)特異性基因表達(dá)的現(xiàn)象。目的:本實(shí)驗(yàn)希望將RNAi技術(shù)與豬的性別控制結(jié)合起來(lái),人為對(duì)zfx基因的表達(dá)進(jìn)行干擾,使X精子的發(fā)育和生成受阻或影響X精子的活性和受精能力,從而獲得較高的雄性后代。方法:依照siRNA的設(shè)計(jì)原則,構(gòu)建針對(duì)豬zfx基因的干擾載體,經(jīng)過(guò)... 

【文章來(lái)源】:石河子大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

豬zfx基因RNAi片段的篩選及性控效果的觀察


pLL3.7質(zhì)粒的多克隆插入位點(diǎn)Fig2PLL3.7plasmidpolyclonalenzymeloci

序列,限制圖譜,多克隆,插入位點(diǎn)


iRNA 序列的設(shè)計(jì)驗(yàn)豬 zfx 基因的 mRNA 序列來(lái)自于美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心基因ank,NCBI),基因編碼為 XM-003134981.3。將 zfx 基因的編碼區(qū)提交到 GeneLi//www.genelink.com/sirna/RNAicustomorder.asp )、 WIsiRNA SelectionProgr圖 2.pLL3.7 質(zhì)粒的多克隆插入位點(diǎn)Fig 2 PLL3.7 plasmid polyclonal enzyme loci圖 1. RNAi-Ready-pSIREN-RetroQ-ZsGreen 的限制圖譜和克隆位點(diǎn)Fig 1.The Restriction Map and Cloning Site of RNAi-Ready-pSIREN-RetroQ-ZsGreen

序列,寡核苷酸,序列,終止信號(hào)


內(nèi)其他基因進(jìn)行同源性比對(duì)。3) a、pSIREN 質(zhì)粒載體 siRNA 序列的設(shè)計(jì):在 siRNA 序列正義鏈 5’端加入 BamH I(GATCC),在 3’端加上 Loop 環(huán)TTCAAGAGA),使寡核苷酸序列能在解鏈后形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)(圖 3),再加入正義鏈的向互補(bǔ)序列,加終止信號(hào) 6 個(gè) T,最后加上 EcoR I (CTTAAG),形成酶切位點(diǎn)(BamH I)+義鏈+loop 環(huán)+反義鏈+終止信號(hào)+酶切位點(diǎn)(EcoR I)的(圖 4)。如此便設(shè)計(jì)好了完整的RNA。pSIREN 質(zhì)粒載體 siRNA 序列的 5’端和 3’端均為酶粘性末端。在設(shè)計(jì) pSIREN 質(zhì)粒的空載體 siRNA 序列時(shí),選亂序重排的序列,該序列也經(jīng)LAST,與豬的任何基因無(wú)同源性,此后按前面的步驟設(shè)計(jì)完整的寡合苷酸序列。b、e 質(zhì)粒載體 siRNA 序列的設(shè)計(jì):在 siRNA 序列正義鏈 5’端加 T 重建 U6 啟動(dòng)子-1 位的 T,在 3’端加上 Loop 環(huán)TTCAAGAGA),加入反向互補(bǔ)序列,加入 RNApolymerase 的終止信號(hào) 6 個(gè) T,再加 XhoI(CTCGAG)的粘性末端,由此構(gòu)建 shRNA 表達(dá)的插入序列。序列 5’端為 HpaI切酶(GTTAAC)為平末端,3’端為 Xho I 內(nèi)切酶(CTCGAG)為粘性末端。4) 初步篩選出 5 個(gè) shRNA 寡核苷酸序列,均委托上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限司進(jìn)行人工合成,并經(jīng) PAGE 純化。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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