馬匹（Equus caballus）體尺性狀影響馬運(yùn)動(dòng)性能,利用新技術(shù)研究馬體尺性狀為馬匹運(yùn)動(dòng)性能的研究引入新方法。為豐富馬體尺性狀與運(yùn)動(dòng)性能的研究?jī)?nèi)容,探索間接調(diào)控運(yùn)動(dòng)性能的基因,本研究利用全基因組關(guān)聯(lián)分析方法（genome-wide association study, GWAS）挖掘影響馬體尺性狀的遺傳標(biāo)記和功能基因。利用馬670 K高密度芯片,對(duì)伊犁馬、純血馬、俄羅斯速步馬、奧爾洛夫馬共4個(gè)品種157個(gè)個(gè)體的體尺性狀（體高,體長(zhǎng),管?chē)?尻高）及體尺指數(shù)（體長(zhǎng)率,管?chē)?胸圍率）進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析。利用Plink1.9軟件對(duì)SNP位點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)控,質(zhì)控后剩余494 137個(gè)SNP用于后續(xù)關(guān)聯(lián)分析。利用Ensembl等數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行基因注釋和基因功能分析,通過(guò)基因組水平的Bonferroni校正,從體高、管?chē)㈠旮�、胸圍率、管�(chē)?個(gè)性狀中分別檢測(cè)到3、15、1、1和9個(gè)潛在顯著關(guān)聯(lián)的SNP （P<9.29E-06）,未檢測(cè)到與體長(zhǎng)和體長(zhǎng)率顯著相關(guān)的SNP。結(jié)果發(fā)現(xiàn)泛素結(jié)合酶E2家族的第三亞家族（ubiquitin conjugating enzyme E2 E3,UBE2E3）、... 

【文章來(lái)源】：農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2020,28(11)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【部分圖文】：

群體結(jié)構(gòu)多維度分析

馬體型結(jié)構(gòu)影響馬匹的運(yùn)動(dòng)性能。馬匹的管部越長(zhǎng)，運(yùn)動(dòng)過(guò)程中對(duì)肌腱和韌帶的壓迫較大，容易導(dǎo)致馬匹奔跑時(shí)腿部相互碰撞，從而使馬匹運(yùn)動(dòng)速度受阻；而管?chē)值鸟R匹，地面的沖擊對(duì)馬匹在運(yùn)動(dòng)時(shí)的前肢影響較大(Brenda,2007)。在傅曉峰(1990)研究中，管?chē)退俣戎g的相關(guān)性呈較強(qiáng)的負(fù)相關(guān)。在裴紅羅(2003)的研究中，對(duì)于不同距離的比賽，管?chē)叫�，馬匹的成績(jī)?cè)胶�，且短距離的比賽對(duì)馬匹管?chē)囊蟾�。在李敏�?2014)研究中，管?chē)凸車(chē)逝c伊犁馬的速度呈極顯著負(fù)相關(guān)。管?chē)拇笮∮绊戱R匹運(yùn)動(dòng)速度，則與管?chē)嚓P(guān)的基因影響馬匹的運(yùn)動(dòng)性能。3.1 UBE2E3基因與運(yùn)動(dòng)性能

本研究采用MLM對(duì)4個(gè)品種馬7個(gè)體尺指標(biāo)性狀(體高,體長(zhǎng),管?chē)?尻高,體長(zhǎng)率,胸圍率,管?chē)?進(jìn)行GWAS分析，校正方法為Bonferroni，即P值低于4.64 E-07 (0.05/107680)的SNP位點(diǎn)則認(rèn)為與表型顯著相關(guān)；P值低于9.29E-06 (1/107680)的SNP位點(diǎn)則認(rèn)為與表型潛在相關(guān)。由圖3可知，未發(fā)現(xiàn)在基因組水平與7個(gè)性狀顯著相關(guān)的SNP位點(diǎn)；與體高潛在關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有3個(gè)；與管?chē)鷿撛陉P(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有15個(gè)；與尻高潛在關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有1個(gè)；與胸圍率潛在關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有1個(gè)；與管?chē)蕽撛陉P(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有9個(gè)；在全基因組水平?jīng)]有與體長(zhǎng)、體長(zhǎng)率性狀潛在關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn)。尋找可能影響體尺性狀的關(guān)鍵位點(diǎn)，為關(guān)鍵基因的挖掘提供基礎(chǔ)資料。


本文編號(hào)：3436954