黔北麻羊TLR4基因結(jié)構(gòu)分析及轉(zhuǎn)染細胞對LPS的應(yīng)答
發(fā)布時間:2021-10-13 07:58
TLR4(Toll-like receptor 4)作為一種重要的模式識別受體(pattern recognition receptors,PRRs),在介導(dǎo)脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)跨膜信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中發(fā)揮主導(dǎo)作用,并參與介導(dǎo)由LPS誘導(dǎo)的一系列前炎性細胞因子的合成與釋放,進而引發(fā)過度炎癥反應(yīng)(Goldammer et al.,2004),在G-致病機理中有至關(guān)重要的作用,F(xiàn)已證實,在人和鼠體內(nèi)TLR4都是LPS最重要的模式識別受體,作為一種跨膜信號受體,TLR4可將LPS刺激信號直接傳入細胞內(nèi),在介導(dǎo)革蘭氏陰性細菌及LPS的宿主反應(yīng)中發(fā)揮關(guān)鍵作用(Hashimoto et al.,2004)。研究在LPS介導(dǎo)下TLR4基因與胞內(nèi)炎癥因子的變化情況是闡明TLR4基因在抗革蘭氏陰性細菌感染的基本途徑。本研究選擇貴州黔北麻羊為試驗對象,根據(jù)Gene Bank中山羊TLR4基因序列對其三個外顯子分別設(shè)計引物,采用PCR結(jié)合直接測序法對TLR4三個外顯子SNPs進行篩選;通過克隆TLR4基因CDS全長,構(gòu)建重組真核表達載體pEGFP-N1-TL...
【文章來源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
基因組DNA提取結(jié)果
圖 2.2 黔北麻羊 TLR4 基因各外顯子 PCR 擴增結(jié)果Fig. 2.2 Amplification results of various primer of TLR4 gene in Qian bei Ma Go圖可知,各擴增片段與預(yù)期片段大小相符,條帶明亮單一,無拖異性條帶,可用于下一步試驗。黔北麻羊 DNA 池篩選 TLR4 基因多態(tài)性照上述方法,將所提取 DNA 樣本進行混池后,以 DNA 混合池為性擴增,取條帶明亮無雜帶的 PCR 產(chǎn)物送至上海生工生物有限公運用 DNAstar 軟件中 SeqMan 程序?qū)y序結(jié)果與 NCBI 上所提交的分析,初步確定其變異位點,經(jīng)對比分析,TLR4 基因 3 個外顯子 SNP 位點(見圖 2.3),其中 2 個 SNP 位于 TLR4 基因 Intron1,1Exon3,以TLR4基因第一外顯子第一位堿基為+1,則其SNPs分布為C、Intron1 G+219A、Exon3 C+8209G,其中 Exon3 C+8209G(leu變。
Fig. 2.2 Amplification results of various primer of TLR4 gene in Qian bei Ma Goat由圖可知,各擴增片段與預(yù)期片段大小相符,條帶明亮單一,無拖尾現(xiàn)象,無非特異性條帶,可用于下一步試驗。2.4.3 黔北麻羊 DNA 池篩選 TLR4 基因多態(tài)性按照上述方法,將所提取 DNA 樣本進行混池后,以 DNA 混合池為模版進行特異性擴增,取條帶明亮無雜帶的 PCR 產(chǎn)物送至上海生工生物有限公司進行測序。運用 DNAstar 軟件中 SeqMan 程序?qū)y序結(jié)果與 NCBI 上所提交的序列進行對比分析,初步確定其變異位點,經(jīng)對比分析,TLR4 基因 3 個外顯子中共發(fā)現(xiàn) 3 個 SNP 位點(見圖 2.3),其中 2 個 SNP 位于 TLR4 基因 Intron1,1 個位于TLR4 Exon3,以TLR4基因第一外顯子第一位堿基為+1,則其SNPs分布為Intron1A+212C、Intron1 G+219A、Exon3 C+8209G,其中 Exon3 C+8209G(leu-val)為錯義突變。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]奶山羊、絨山羊的飼養(yǎng)管理[J]. 何桂玲. 飼料博覽. 2017(12)
[2]LPS誘導(dǎo)牦牛成纖維細胞TLR4及其信號通路基因表達變化分析[J]. 段薈芹,王利,李鍵,鐘金城,字向東,江明鋒,熊顯榮. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2017(09)
[3]基于腫瘤微環(huán)境中TLR4/NF-κB通路的變化探討乳癌術(shù)后方對乳腺癌小鼠肺轉(zhuǎn)移的影響[J]. 盛佳鈺,張馨月,李瓊,薛曉紅. 中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2016(12)
[4]TLR4基因在小尾寒羊乳房炎乳腺組織中的表達[J]. 陳富強,張小麗,李發(fā)弟,楊勃,唐然,張晨,張欣,宋曉育,馬小軍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2016(03)
[5]LPS誘導(dǎo)條件下豬小腸上皮細胞TLR4及其信號通路基因表達變化分析[J]. 孫麗,夏日煒,殷學(xué)梅,喻禮懷,朱國強,吳圣龍,包文斌. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2015(07)
[6]TLR2 and TLR4 polymorphisms influence m RNA and protein expression in colorectal cancer[J]. Marcela Alcantara Proen?a,Juliana Garcia de Oliveira,Aline Cristina Targa Cadamuro,Maysa Succi,Jo?o Gomes Netinho,Eny Maria Goloni-Bertolo,érika Cristina Pavarino,Ana Elizabete Silva. World Journal of Gastroenterology. 2015(25)
[7]牦牛TLR2和TLR4基因mRNA在不同組織中的表達分布研究[J]. 林寶山,蘭道亮,黃偲,陳亞冰,黃勇,李鍵. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2014(11)
[8]雞外周血白細胞中Toll樣受體的克隆[J]. 賈鵬鵬. 國外畜牧學(xué)(豬與禽). 2013(10)
[9]妊娠期關(guān)中奶山羊子宮中TLR4的定位和表達[J]. 代盈盈,王文麗,趙慧英,劉紅改,王薇. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2013(04)
[10]TLR4基因多態(tài)性與疾病易感性的研究進展[J]. 劉曉聰,沈關(guān)心,朱慧芬,陳琰琰,姜素華. 農(nóng)墾醫(yī)學(xué). 2012(03)
博士論文
[1]過表達oTLR4轉(zhuǎn)基因綿羊抗布魯氏菌病能力的評估及其機制研究[D]. 王志賢.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]A族鏈球菌感染小鼠巨噬細胞初期通過TLR4/MyD88直接途徑誘導(dǎo)SOCS-1高表達的機制研究[D]. 吳景華.河北醫(yī)科大學(xué) 2014
[3]小鼠巨噬細胞TLR2、TLR4及RP105在金黃色葡萄球菌感染中的天然免疫應(yīng)答機制[D]. 劉博.吉林大學(xué) 2013
[4]奶牛TLR4及其信號轉(zhuǎn)導(dǎo)基因的克隆、SNPs檢測與乳房炎的關(guān)聯(lián)分析[D]. 王興平.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
碩士論文
[1]中國美利奴羊TLR4、TLR2基因多態(tài)性及其與布魯氏菌病的相關(guān)性分析[D]. 王會敏.石河子大學(xué) 2017
[2]TLR4基因多態(tài)性與大動脈粥樣硬化型腦梗死的相關(guān)性研究[D]. 鐘曉.青島大學(xué) 2017
[3]酪氨酸激酶BMX在內(nèi)毒素/脂多糖誘導(dǎo)小鼠單核巨噬細胞株RAW264.7促炎性細胞因子產(chǎn)生中的作用[D]. 方旭.安徽醫(yī)科大學(xué) 2017
[4]LPS刺激對雛雞氣管和肺TLR4的表達影響研究[D]. 葛曉紅.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]甘肅地區(qū)小尾寒羊TLR4、TLR9基因多態(tài)性與呼吸系統(tǒng)疾病的相關(guān)性分析[D]. 呂偉麗.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]云南白藥對P.g-LPS誘導(dǎo)人牙髓細胞分泌TNF-α、IL-6、IL-1β影響的實驗研究[D]. 黃松靖.昆明醫(yī)科大學(xué) 2014
[7]蘇鐘豬TLR4基因多態(tài)性及編碼區(qū)C1027A功能分析[D]. 劉筱.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[8]豬TLR4基因的突變與功能分析[D]. 翟春媛.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[9]牙周優(yōu)勢菌內(nèi)毒素對人牙周膜細胞的生物學(xué)效應(yīng)及mCD14表達的研究[D]. 張風(fēng)秋.第四軍醫(yī)大學(xué) 2001
本文編號:3434263
【文章來源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
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【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
基因組DNA提取結(jié)果
圖 2.2 黔北麻羊 TLR4 基因各外顯子 PCR 擴增結(jié)果Fig. 2.2 Amplification results of various primer of TLR4 gene in Qian bei Ma Go圖可知,各擴增片段與預(yù)期片段大小相符,條帶明亮單一,無拖異性條帶,可用于下一步試驗。黔北麻羊 DNA 池篩選 TLR4 基因多態(tài)性照上述方法,將所提取 DNA 樣本進行混池后,以 DNA 混合池為性擴增,取條帶明亮無雜帶的 PCR 產(chǎn)物送至上海生工生物有限公運用 DNAstar 軟件中 SeqMan 程序?qū)y序結(jié)果與 NCBI 上所提交的分析,初步確定其變異位點,經(jīng)對比分析,TLR4 基因 3 個外顯子 SNP 位點(見圖 2.3),其中 2 個 SNP 位于 TLR4 基因 Intron1,1Exon3,以TLR4基因第一外顯子第一位堿基為+1,則其SNPs分布為C、Intron1 G+219A、Exon3 C+8209G,其中 Exon3 C+8209G(leu變。
Fig. 2.2 Amplification results of various primer of TLR4 gene in Qian bei Ma Goat由圖可知,各擴增片段與預(yù)期片段大小相符,條帶明亮單一,無拖尾現(xiàn)象,無非特異性條帶,可用于下一步試驗。2.4.3 黔北麻羊 DNA 池篩選 TLR4 基因多態(tài)性按照上述方法,將所提取 DNA 樣本進行混池后,以 DNA 混合池為模版進行特異性擴增,取條帶明亮無雜帶的 PCR 產(chǎn)物送至上海生工生物有限公司進行測序。運用 DNAstar 軟件中 SeqMan 程序?qū)y序結(jié)果與 NCBI 上所提交的序列進行對比分析,初步確定其變異位點,經(jīng)對比分析,TLR4 基因 3 個外顯子中共發(fā)現(xiàn) 3 個 SNP 位點(見圖 2.3),其中 2 個 SNP 位于 TLR4 基因 Intron1,1 個位于TLR4 Exon3,以TLR4基因第一外顯子第一位堿基為+1,則其SNPs分布為Intron1A+212C、Intron1 G+219A、Exon3 C+8209G,其中 Exon3 C+8209G(leu-val)為錯義突變。
【參考文獻】:
期刊論文
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[4]TLR4基因在小尾寒羊乳房炎乳腺組織中的表達[J]. 陳富強,張小麗,李發(fā)弟,楊勃,唐然,張晨,張欣,宋曉育,馬小軍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2016(03)
[5]LPS誘導(dǎo)條件下豬小腸上皮細胞TLR4及其信號通路基因表達變化分析[J]. 孫麗,夏日煒,殷學(xué)梅,喻禮懷,朱國強,吳圣龍,包文斌. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2015(07)
[6]TLR2 and TLR4 polymorphisms influence m RNA and protein expression in colorectal cancer[J]. Marcela Alcantara Proen?a,Juliana Garcia de Oliveira,Aline Cristina Targa Cadamuro,Maysa Succi,Jo?o Gomes Netinho,Eny Maria Goloni-Bertolo,érika Cristina Pavarino,Ana Elizabete Silva. World Journal of Gastroenterology. 2015(25)
[7]牦牛TLR2和TLR4基因mRNA在不同組織中的表達分布研究[J]. 林寶山,蘭道亮,黃偲,陳亞冰,黃勇,李鍵. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2014(11)
[8]雞外周血白細胞中Toll樣受體的克隆[J]. 賈鵬鵬. 國外畜牧學(xué)(豬與禽). 2013(10)
[9]妊娠期關(guān)中奶山羊子宮中TLR4的定位和表達[J]. 代盈盈,王文麗,趙慧英,劉紅改,王薇. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2013(04)
[10]TLR4基因多態(tài)性與疾病易感性的研究進展[J]. 劉曉聰,沈關(guān)心,朱慧芬,陳琰琰,姜素華. 農(nóng)墾醫(yī)學(xué). 2012(03)
博士論文
[1]過表達oTLR4轉(zhuǎn)基因綿羊抗布魯氏菌病能力的評估及其機制研究[D]. 王志賢.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]A族鏈球菌感染小鼠巨噬細胞初期通過TLR4/MyD88直接途徑誘導(dǎo)SOCS-1高表達的機制研究[D]. 吳景華.河北醫(yī)科大學(xué) 2014
[3]小鼠巨噬細胞TLR2、TLR4及RP105在金黃色葡萄球菌感染中的天然免疫應(yīng)答機制[D]. 劉博.吉林大學(xué) 2013
[4]奶牛TLR4及其信號轉(zhuǎn)導(dǎo)基因的克隆、SNPs檢測與乳房炎的關(guān)聯(lián)分析[D]. 王興平.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
碩士論文
[1]中國美利奴羊TLR4、TLR2基因多態(tài)性及其與布魯氏菌病的相關(guān)性分析[D]. 王會敏.石河子大學(xué) 2017
[2]TLR4基因多態(tài)性與大動脈粥樣硬化型腦梗死的相關(guān)性研究[D]. 鐘曉.青島大學(xué) 2017
[3]酪氨酸激酶BMX在內(nèi)毒素/脂多糖誘導(dǎo)小鼠單核巨噬細胞株RAW264.7促炎性細胞因子產(chǎn)生中的作用[D]. 方旭.安徽醫(yī)科大學(xué) 2017
[4]LPS刺激對雛雞氣管和肺TLR4的表達影響研究[D]. 葛曉紅.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]甘肅地區(qū)小尾寒羊TLR4、TLR9基因多態(tài)性與呼吸系統(tǒng)疾病的相關(guān)性分析[D]. 呂偉麗.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]云南白藥對P.g-LPS誘導(dǎo)人牙髓細胞分泌TNF-α、IL-6、IL-1β影響的實驗研究[D]. 黃松靖.昆明醫(yī)科大學(xué) 2014
[7]蘇鐘豬TLR4基因多態(tài)性及編碼區(qū)C1027A功能分析[D]. 劉筱.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[8]豬TLR4基因的突變與功能分析[D]. 翟春媛.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[9]牙周優(yōu)勢菌內(nèi)毒素對人牙周膜細胞的生物學(xué)效應(yīng)及mCD14表達的研究[D]. 張風(fēng)秋.第四軍醫(yī)大學(xué) 2001
本文編號:3434263
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