黔北麻羊TLR4基因結(jié)構(gòu)分析及轉(zhuǎn)染細(xì)胞對(duì)LPS的應(yīng)答
發(fā)布時(shí)間:2021-10-13 07:58
TLR4(Toll-like receptor 4)作為一種重要的模式識(shí)別受體(pattern recognition receptors,PRRs),在介導(dǎo)脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)跨膜信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中發(fā)揮主導(dǎo)作用,并參與介導(dǎo)由LPS誘導(dǎo)的一系列前炎性細(xì)胞因子的合成與釋放,進(jìn)而引發(fā)過(guò)度炎癥反應(yīng)(Goldammer et al.,2004),在G-致病機(jī)理中有至關(guān)重要的作用。現(xiàn)已證實(shí),在人和鼠體內(nèi)TLR4都是LPS最重要的模式識(shí)別受體,作為一種跨膜信號(hào)受體,TLR4可將LPS刺激信號(hào)直接傳入細(xì)胞內(nèi),在介導(dǎo)革蘭氏陰性細(xì)菌及LPS的宿主反應(yīng)中發(fā)揮關(guān)鍵作用(Hashimoto et al.,2004)。研究在LPS介導(dǎo)下TLR4基因與胞內(nèi)炎癥因子的變化情況是闡明TLR4基因在抗革蘭氏陰性細(xì)菌感染的基本途徑。本研究選擇貴州黔北麻羊?yàn)樵囼?yàn)對(duì)象,根據(jù)Gene Bank中山羊TLR4基因序列對(duì)其三個(gè)外顯子分別設(shè)計(jì)引物,采用PCR結(jié)合直接測(cè)序法對(duì)TLR4三個(gè)外顯子SNPs進(jìn)行篩選;通過(guò)克隆TLR4基因CDS全長(zhǎng),構(gòu)建重組真核表達(dá)載體pEGFP-N1-TL...
【文章來(lái)源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
基因組DNA提取結(jié)果
圖 2.2 黔北麻羊 TLR4 基因各外顯子 PCR 擴(kuò)增結(jié)果Fig. 2.2 Amplification results of various primer of TLR4 gene in Qian bei Ma Go圖可知,各擴(kuò)增片段與預(yù)期片段大小相符,條帶明亮單一,無(wú)拖異性條帶,可用于下一步試驗(yàn)。黔北麻羊 DNA 池篩選 TLR4 基因多態(tài)性照上述方法,將所提取 DNA 樣本進(jìn)行混池后,以 DNA 混合池為性擴(kuò)增,取條帶明亮無(wú)雜帶的 PCR 產(chǎn)物送至上海生工生物有限公運(yùn)用 DNAstar 軟件中 SeqMan 程序?qū)y(cè)序結(jié)果與 NCBI 上所提交的分析,初步確定其變異位點(diǎn),經(jīng)對(duì)比分析,TLR4 基因 3 個(gè)外顯子 SNP 位點(diǎn)(見(jiàn)圖 2.3),其中 2 個(gè) SNP 位于 TLR4 基因 Intron1,1Exon3,以TLR4基因第一外顯子第一位堿基為+1,則其SNPs分布為C、Intron1 G+219A、Exon3 C+8209G,其中 Exon3 C+8209G(leu變。
Fig. 2.2 Amplification results of various primer of TLR4 gene in Qian bei Ma Goat由圖可知,各擴(kuò)增片段與預(yù)期片段大小相符,條帶明亮單一,無(wú)拖尾現(xiàn)象,無(wú)非特異性條帶,可用于下一步試驗(yàn)。2.4.3 黔北麻羊 DNA 池篩選 TLR4 基因多態(tài)性按照上述方法,將所提取 DNA 樣本進(jìn)行混池后,以 DNA 混合池為模版進(jìn)行特異性擴(kuò)增,取條帶明亮無(wú)雜帶的 PCR 產(chǎn)物送至上海生工生物有限公司進(jìn)行測(cè)序。運(yùn)用 DNAstar 軟件中 SeqMan 程序?qū)y(cè)序結(jié)果與 NCBI 上所提交的序列進(jìn)行對(duì)比分析,初步確定其變異位點(diǎn),經(jīng)對(duì)比分析,TLR4 基因 3 個(gè)外顯子中共發(fā)現(xiàn) 3 個(gè) SNP 位點(diǎn)(見(jiàn)圖 2.3),其中 2 個(gè) SNP 位于 TLR4 基因 Intron1,1 個(gè)位于TLR4 Exon3,以TLR4基因第一外顯子第一位堿基為+1,則其SNPs分布為Intron1A+212C、Intron1 G+219A、Exon3 C+8209G,其中 Exon3 C+8209G(leu-val)為錯(cuò)義突變。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]奶山羊、絨山羊的飼養(yǎng)管理[J]. 何桂玲. 飼料博覽. 2017(12)
[2]LPS誘導(dǎo)牦牛成纖維細(xì)胞TLR4及其信號(hào)通路基因表達(dá)變化分析[J]. 段薈芹,王利,李鍵,鐘金城,字向東,江明鋒,熊顯榮. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(09)
[3]基于腫瘤微環(huán)境中TLR4/NF-κB通路的變化探討乳癌術(shù)后方對(duì)乳腺癌小鼠肺轉(zhuǎn)移的影響[J]. 盛佳鈺,張馨月,李瓊,薛曉紅. 中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2016(12)
[4]TLR4基因在小尾寒羊乳房炎乳腺組織中的表達(dá)[J]. 陳富強(qiáng),張小麗,李發(fā)弟,楊勃,唐然,張晨,張欣,宋曉育,馬小軍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(03)
[5]LPS誘導(dǎo)條件下豬小腸上皮細(xì)胞TLR4及其信號(hào)通路基因表達(dá)變化分析[J]. 孫麗,夏日煒,殷學(xué)梅,喻禮懷,朱國(guó)強(qiáng),吳圣龍,包文斌. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(07)
[6]TLR2 and TLR4 polymorphisms influence m RNA and protein expression in colorectal cancer[J]. Marcela Alcantara Proen?a,Juliana Garcia de Oliveira,Aline Cristina Targa Cadamuro,Maysa Succi,Jo?o Gomes Netinho,Eny Maria Goloni-Bertolo,érika Cristina Pavarino,Ana Elizabete Silva. World Journal of Gastroenterology. 2015(25)
[7]牦牛TLR2和TLR4基因mRNA在不同組織中的表達(dá)分布研究[J]. 林寶山,蘭道亮,黃偲,陳亞冰,黃勇,李鍵. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(11)
[8]雞外周血白細(xì)胞中Toll樣受體的克隆[J]. 賈鵬鵬. 國(guó)外畜牧學(xué)(豬與禽). 2013(10)
[9]妊娠期關(guān)中奶山羊子宮中TLR4的定位和表達(dá)[J]. 代盈盈,王文麗,趙慧英,劉紅改,王薇. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(04)
[10]TLR4基因多態(tài)性與疾病易感性的研究進(jìn)展[J]. 劉曉聰,沈關(guān)心,朱慧芬,陳琰琰,姜素華. 農(nóng)墾醫(yī)學(xué). 2012(03)
博士論文
[1]過(guò)表達(dá)oTLR4轉(zhuǎn)基因綿羊抗布魯氏菌病能力的評(píng)估及其機(jī)制研究[D]. 王志賢.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]A族鏈球菌感染小鼠巨噬細(xì)胞初期通過(guò)TLR4/MyD88直接途徑誘導(dǎo)SOCS-1高表達(dá)的機(jī)制研究[D]. 吳景華.河北醫(yī)科大學(xué) 2014
[3]小鼠巨噬細(xì)胞TLR2、TLR4及RP105在金黃色葡萄球菌感染中的天然免疫應(yīng)答機(jī)制[D]. 劉博.吉林大學(xué) 2013
[4]奶牛TLR4及其信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)基因的克隆、SNPs檢測(cè)與乳房炎的關(guān)聯(lián)分析[D]. 王興平.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
碩士論文
[1]中國(guó)美利奴羊TLR4、TLR2基因多態(tài)性及其與布魯氏菌病的相關(guān)性分析[D]. 王會(huì)敏.石河子大學(xué) 2017
[2]TLR4基因多態(tài)性與大動(dòng)脈粥樣硬化型腦梗死的相關(guān)性研究[D]. 鐘曉.青島大學(xué) 2017
[3]酪氨酸激酶BMX在內(nèi)毒素/脂多糖誘導(dǎo)小鼠單核巨噬細(xì)胞株RAW264.7促炎性細(xì)胞因子產(chǎn)生中的作用[D]. 方旭.安徽醫(yī)科大學(xué) 2017
[4]LPS刺激對(duì)雛雞氣管和肺TLR4的表達(dá)影響研究[D]. 葛曉紅.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]甘肅地區(qū)小尾寒羊TLR4、TLR9基因多態(tài)性與呼吸系統(tǒng)疾病的相關(guān)性分析[D]. 呂偉麗.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]云南白藥對(duì)P.g-LPS誘導(dǎo)人牙髓細(xì)胞分泌TNF-α、IL-6、IL-1β影響的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 黃松靖.昆明醫(yī)科大學(xué) 2014
[7]蘇鐘豬TLR4基因多態(tài)性及編碼區(qū)C1027A功能分析[D]. 劉筱.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[8]豬TLR4基因的突變與功能分析[D]. 翟春媛.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[9]牙周優(yōu)勢(shì)菌內(nèi)毒素對(duì)人牙周膜細(xì)胞的生物學(xué)效應(yīng)及mCD14表達(dá)的研究[D]. 張風(fēng)秋.第四軍醫(yī)大學(xué) 2001
本文編號(hào):3434263
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【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
基因組DNA提取結(jié)果
圖 2.2 黔北麻羊 TLR4 基因各外顯子 PCR 擴(kuò)增結(jié)果Fig. 2.2 Amplification results of various primer of TLR4 gene in Qian bei Ma Go圖可知,各擴(kuò)增片段與預(yù)期片段大小相符,條帶明亮單一,無(wú)拖異性條帶,可用于下一步試驗(yàn)。黔北麻羊 DNA 池篩選 TLR4 基因多態(tài)性照上述方法,將所提取 DNA 樣本進(jìn)行混池后,以 DNA 混合池為性擴(kuò)增,取條帶明亮無(wú)雜帶的 PCR 產(chǎn)物送至上海生工生物有限公運(yùn)用 DNAstar 軟件中 SeqMan 程序?qū)y(cè)序結(jié)果與 NCBI 上所提交的分析,初步確定其變異位點(diǎn),經(jīng)對(duì)比分析,TLR4 基因 3 個(gè)外顯子 SNP 位點(diǎn)(見(jiàn)圖 2.3),其中 2 個(gè) SNP 位于 TLR4 基因 Intron1,1Exon3,以TLR4基因第一外顯子第一位堿基為+1,則其SNPs分布為C、Intron1 G+219A、Exon3 C+8209G,其中 Exon3 C+8209G(leu變。
Fig. 2.2 Amplification results of various primer of TLR4 gene in Qian bei Ma Goat由圖可知,各擴(kuò)增片段與預(yù)期片段大小相符,條帶明亮單一,無(wú)拖尾現(xiàn)象,無(wú)非特異性條帶,可用于下一步試驗(yàn)。2.4.3 黔北麻羊 DNA 池篩選 TLR4 基因多態(tài)性按照上述方法,將所提取 DNA 樣本進(jìn)行混池后,以 DNA 混合池為模版進(jìn)行特異性擴(kuò)增,取條帶明亮無(wú)雜帶的 PCR 產(chǎn)物送至上海生工生物有限公司進(jìn)行測(cè)序。運(yùn)用 DNAstar 軟件中 SeqMan 程序?qū)y(cè)序結(jié)果與 NCBI 上所提交的序列進(jìn)行對(duì)比分析,初步確定其變異位點(diǎn),經(jīng)對(duì)比分析,TLR4 基因 3 個(gè)外顯子中共發(fā)現(xiàn) 3 個(gè) SNP 位點(diǎn)(見(jiàn)圖 2.3),其中 2 個(gè) SNP 位于 TLR4 基因 Intron1,1 個(gè)位于TLR4 Exon3,以TLR4基因第一外顯子第一位堿基為+1,則其SNPs分布為Intron1A+212C、Intron1 G+219A、Exon3 C+8209G,其中 Exon3 C+8209G(leu-val)為錯(cuò)義突變。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]奶山羊、絨山羊的飼養(yǎng)管理[J]. 何桂玲. 飼料博覽. 2017(12)
[2]LPS誘導(dǎo)牦牛成纖維細(xì)胞TLR4及其信號(hào)通路基因表達(dá)變化分析[J]. 段薈芹,王利,李鍵,鐘金城,字向東,江明鋒,熊顯榮. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(09)
[3]基于腫瘤微環(huán)境中TLR4/NF-κB通路的變化探討乳癌術(shù)后方對(duì)乳腺癌小鼠肺轉(zhuǎn)移的影響[J]. 盛佳鈺,張馨月,李瓊,薛曉紅. 中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2016(12)
[4]TLR4基因在小尾寒羊乳房炎乳腺組織中的表達(dá)[J]. 陳富強(qiáng),張小麗,李發(fā)弟,楊勃,唐然,張晨,張欣,宋曉育,馬小軍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(03)
[5]LPS誘導(dǎo)條件下豬小腸上皮細(xì)胞TLR4及其信號(hào)通路基因表達(dá)變化分析[J]. 孫麗,夏日煒,殷學(xué)梅,喻禮懷,朱國(guó)強(qiáng),吳圣龍,包文斌. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(07)
[6]TLR2 and TLR4 polymorphisms influence m RNA and protein expression in colorectal cancer[J]. Marcela Alcantara Proen?a,Juliana Garcia de Oliveira,Aline Cristina Targa Cadamuro,Maysa Succi,Jo?o Gomes Netinho,Eny Maria Goloni-Bertolo,érika Cristina Pavarino,Ana Elizabete Silva. World Journal of Gastroenterology. 2015(25)
[7]牦牛TLR2和TLR4基因mRNA在不同組織中的表達(dá)分布研究[J]. 林寶山,蘭道亮,黃偲,陳亞冰,黃勇,李鍵. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(11)
[8]雞外周血白細(xì)胞中Toll樣受體的克隆[J]. 賈鵬鵬. 國(guó)外畜牧學(xué)(豬與禽). 2013(10)
[9]妊娠期關(guān)中奶山羊子宮中TLR4的定位和表達(dá)[J]. 代盈盈,王文麗,趙慧英,劉紅改,王薇. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(04)
[10]TLR4基因多態(tài)性與疾病易感性的研究進(jìn)展[J]. 劉曉聰,沈關(guān)心,朱慧芬,陳琰琰,姜素華. 農(nóng)墾醫(yī)學(xué). 2012(03)
博士論文
[1]過(guò)表達(dá)oTLR4轉(zhuǎn)基因綿羊抗布魯氏菌病能力的評(píng)估及其機(jī)制研究[D]. 王志賢.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]A族鏈球菌感染小鼠巨噬細(xì)胞初期通過(guò)TLR4/MyD88直接途徑誘導(dǎo)SOCS-1高表達(dá)的機(jī)制研究[D]. 吳景華.河北醫(yī)科大學(xué) 2014
[3]小鼠巨噬細(xì)胞TLR2、TLR4及RP105在金黃色葡萄球菌感染中的天然免疫應(yīng)答機(jī)制[D]. 劉博.吉林大學(xué) 2013
[4]奶牛TLR4及其信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)基因的克隆、SNPs檢測(cè)與乳房炎的關(guān)聯(lián)分析[D]. 王興平.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
碩士論文
[1]中國(guó)美利奴羊TLR4、TLR2基因多態(tài)性及其與布魯氏菌病的相關(guān)性分析[D]. 王會(huì)敏.石河子大學(xué) 2017
[2]TLR4基因多態(tài)性與大動(dòng)脈粥樣硬化型腦梗死的相關(guān)性研究[D]. 鐘曉.青島大學(xué) 2017
[3]酪氨酸激酶BMX在內(nèi)毒素/脂多糖誘導(dǎo)小鼠單核巨噬細(xì)胞株RAW264.7促炎性細(xì)胞因子產(chǎn)生中的作用[D]. 方旭.安徽醫(yī)科大學(xué) 2017
[4]LPS刺激對(duì)雛雞氣管和肺TLR4的表達(dá)影響研究[D]. 葛曉紅.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]甘肅地區(qū)小尾寒羊TLR4、TLR9基因多態(tài)性與呼吸系統(tǒng)疾病的相關(guān)性分析[D]. 呂偉麗.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]云南白藥對(duì)P.g-LPS誘導(dǎo)人牙髓細(xì)胞分泌TNF-α、IL-6、IL-1β影響的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 黃松靖.昆明醫(yī)科大學(xué) 2014
[7]蘇鐘豬TLR4基因多態(tài)性及編碼區(qū)C1027A功能分析[D]. 劉筱.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[8]豬TLR4基因的突變與功能分析[D]. 翟春媛.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[9]牙周優(yōu)勢(shì)菌內(nèi)毒素對(duì)人牙周膜細(xì)胞的生物學(xué)效應(yīng)及mCD14表達(dá)的研究[D]. 張風(fēng)秋.第四軍醫(yī)大學(xué) 2001
本文編號(hào):3434263
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