基于RNA-seq篩選不同飼養(yǎng)模式下肉雞肌肉發(fā)育代謝相關(guān)差異基因
發(fā)布時(shí)間:2021-10-05 01:00
為發(fā)掘飼養(yǎng)模式影響肌肉發(fā)育代謝的相關(guān)關(guān)鍵基因,本研究分別在籠養(yǎng)和地面平養(yǎng)2種飼養(yǎng)模式中隨機(jī)選取5只42日齡Ross 308肉雞進(jìn)行屠宰,提取腿肌RNA,通過RNA-seq技術(shù)篩選出與肌肉發(fā)育代謝相關(guān)的差異基因,并利用qPCR進(jìn)行驗(yàn)證。隨后分離、鑒定并構(gòu)建了雞骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞增殖分化模型,對(duì)關(guān)鍵差異基因PHGDH在雞骨骼肌細(xì)胞中的表達(dá)模式進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果顯示:在2種飼養(yǎng)模式中共篩選出3個(gè)差異表達(dá)基因(ASNS、JPH2、PHGDH),qPCR驗(yàn)證結(jié)果與RNA-Seq測(cè)序結(jié)果一致,差異基因均在平養(yǎng)模式雞腿肌肌肉中高表達(dá);在雞骨骼肌細(xì)胞增殖期間,PHGDH表達(dá)逐漸上調(diào),但在分化第2天至第6天,表達(dá)水平逐漸下降;EdU細(xì)胞增殖檢測(cè)結(jié)果顯示,抑制PHGDH的表達(dá)可顯著抑制雞骨骼肌細(xì)胞的增殖。以上結(jié)果表明,PHGDH可能在雞骨骼肌形成過程中發(fā)揮重要作用。
【文章來源】:中國畜牧雜志. 2020,56(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
2種飼養(yǎng)模式下肉雞日增重
圖4顯示,3個(gè)差異表達(dá)基因在不同飼養(yǎng)模式下的表達(dá)水平均存在顯著或極顯著的差異,而隨機(jī)選取的2個(gè)任意基因差異不顯著。表明熒光定量PCR驗(yàn)證的結(jié)果與RNA-Seq中基因表達(dá)檢測(cè)的結(jié)果一致。圖3 差異基因表達(dá)火山圖
差異基因表達(dá)火山圖
本文編號(hào):3418683
【文章來源】:中國畜牧雜志. 2020,56(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
2種飼養(yǎng)模式下肉雞日增重
圖4顯示,3個(gè)差異表達(dá)基因在不同飼養(yǎng)模式下的表達(dá)水平均存在顯著或極顯著的差異,而隨機(jī)選取的2個(gè)任意基因差異不顯著。表明熒光定量PCR驗(yàn)證的結(jié)果與RNA-Seq中基因表達(dá)檢測(cè)的結(jié)果一致。圖3 差異基因表達(dá)火山圖
差異基因表達(dá)火山圖
本文編號(hào):3418683
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3418683.html
最近更新
教材專著