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基于RNA-seq篩選不同飼養(yǎng)模式下肉雞肌肉發(fā)育代謝相關差異基因

發(fā)布時間:2021-10-05 01:00
  為發(fā)掘飼養(yǎng)模式影響肌肉發(fā)育代謝的相關關鍵基因,本研究分別在籠養(yǎng)和地面平養(yǎng)2種飼養(yǎng)模式中隨機選取5只42日齡Ross 308肉雞進行屠宰,提取腿肌RNA,通過RNA-seq技術篩選出與肌肉發(fā)育代謝相關的差異基因,并利用qPCR進行驗證。隨后分離、鑒定并構建了雞骨骼肌衛(wèi)星細胞增殖分化模型,對關鍵差異基因PHGDH在雞骨骼肌細胞中的表達模式進行檢測。結果顯示:在2種飼養(yǎng)模式中共篩選出3個差異表達基因(ASNS、JPH2、PHGDH),qPCR驗證結果與RNA-Seq測序結果一致,差異基因均在平養(yǎng)模式雞腿肌肌肉中高表達;在雞骨骼肌細胞增殖期間,PHGDH表達逐漸上調,但在分化第2天至第6天,表達水平逐漸下降;EdU細胞增殖檢測結果顯示,抑制PHGDH的表達可顯著抑制雞骨骼肌細胞的增殖。以上結果表明,PHGDH可能在雞骨骼肌形成過程中發(fā)揮重要作用。 

【文章來源】:中國畜牧雜志. 2020,56(05)北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

基于RNA-seq篩選不同飼養(yǎng)模式下肉雞肌肉發(fā)育代謝相關差異基因


2種飼養(yǎng)模式下肉雞日增重

散點圖,基因表達,散點圖,飼養(yǎng)模式


圖4顯示,3個差異表達基因在不同飼養(yǎng)模式下的表達水平均存在顯著或極顯著的差異,而隨機選取的2個任意基因差異不顯著。表明熒光定量PCR驗證的結果與RNA-Seq中基因表達檢測的結果一致。圖3 差異基因表達火山圖

散點圖,基因表達,火山,飼養(yǎng)模式


差異基因表達火山圖


本文編號:3418683

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