發(fā)布時間：2021-09-29 17:04

　�、蛐拓i鏈球菌（S.suis2）是一種重要的人畜共患病原,感染人類后可導(dǎo)致腦膜炎、敗血癥、關(guān)節(jié)炎以及鏈球菌中毒性休克綜合征等。目前,Ⅱ型豬鏈球菌的跨種傳播和致病機(jī)制仍不清楚,其毒力因子研究尚不全面。為深入研究S.suis2的致病機(jī)制,本課題利用鏈特異性RNA-seq策略,獲得了可感染人的兩株中國高致病性S.suis2（05ZYH33和98HAH33）和不可感染人的參考株S.suis2（P1/7）在相同生長條件下的轉(zhuǎn)錄組圖譜,并對致病菌基因表達(dá)特點進(jìn)行了全面系統(tǒng)的分析�；诟咄哭D(zhuǎn)錄組分析策略,研究發(fā)現(xiàn)在三株菌株同源基因中,兩致病菌株同時與參考株差異表達(dá)的基因有120個,在致病菌中上調(diào)基因53個,主要富集在翻譯／核糖體結(jié)構(gòu)／生物合成等,上調(diào)最明顯的基因編碼表面錨定蛋白；在致病菌中下調(diào)基因66個,主要富集在磷酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)（PTS）、碳水化合物轉(zhuǎn)運和代謝、無機(jī)離子轉(zhuǎn)運和代謝、糖酵解／糖質(zhì)增生以及酪氨酸代謝等代謝通路；另外還有1個基因在05ZYH33中上調(diào),而在98HAH33中下調(diào),該基因的具體功能值得進(jìn)一步探究。上述結(jié)果表明致病菌株與參考株能量代謝和糖轉(zhuǎn)化存在差異,提示兩者能量代謝的不同,其中... 

【文章來源】：中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院北京基因組研究所)北京市

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

細(xì)菌致病性機(jī)制概述（摘自Wilsonetal，Mechanismsofbacteria丨pathogenicity[ii])

009年推出了雙末端（paired-end)測序方法，如圖時，在兩端的接頭上都加上測序引物結(jié)合位點，在引導(dǎo)互補鏈在原位置再生和擴(kuò)增，使得第二輪的的合成測序。上，^J i “

1緒論 精確。多數(shù)轉(zhuǎn)錄組分析集中在獲取單個細(xì)菌在特定時間點的表達(dá)譜，或者在下的基因差異表達(dá)分析。最近，轉(zhuǎn)錄組分析逐漸擴(kuò)展到對不同菌株在特定刺錄組分析，這些研究能夠闡明細(xì)菌在特定環(huán)境下菌株特異性轉(zhuǎn)錄情況，并且病菌中潛在的毒力因子，如圖1.8171]。目前幾乎所有轉(zhuǎn)錄組研究都是分析大方法不能解決不同亞群間的重要差異。然而，這些差異恰恰是解釋調(diào)控通路鍵因素，不過隨著單個細(xì)菌的全轉(zhuǎn)錄本擴(kuò)增的出現(xiàn)單細(xì)胞細(xì)菌轉(zhuǎn)錄組也能。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Tyrosine phosphorylation and bacterial virulence[J]. Sarah E Whitmore,Richard J Lamont.  International Journal of Oral Science. 2012(01)
[2]DNA測序技術(shù)發(fā)展及其展望[J]. 孫海汐,王秀杰.  科研信息化技術(shù)與應(yīng)用. 2009(03)



本文編號：3414101