鴨MEF2A/D基因CAG重復(fù)多態(tài)性和SNP的鑒定與分析
發(fā)布時間:2021-09-24 19:44
MEF2A和MEF2D基因在包括不同類型肌肉組織在內(nèi)的多種組織生長發(fā)育中具有調(diào)控作用,對家畜家禽的生產(chǎn)性能、尤其是骨骼肌的產(chǎn)量與品質(zhì)有重要影響。不同物種中的研究均表明,MEF2A和MEF2D基因多態(tài)性與多項生產(chǎn)性狀有關(guān)。骨骼肌是肉鴨生產(chǎn)的主要產(chǎn)品,探究鴨MEF2A和MEF2D基因分子標(biāo)記多態(tài)性及其對生產(chǎn)性能的影響,有助于分子標(biāo)記輔助選擇和優(yōu)質(zhì)肉鴨新品種的培育。然而,關(guān)于MEF2A和MEF2D基因編碼區(qū)CAG重復(fù)及其側(cè)翼序列中SNP的多態(tài)性以及他們對生產(chǎn)性能的影響,還缺少研究報道。并且,農(nóng)華麻鴨GF2系作為新近培育的優(yōu)質(zhì)肉鴨品系,其生產(chǎn)性能還缺乏系統(tǒng)的測定與分析。因此,本研究測定并分析了農(nóng)華麻鴨GF2系肉鴨的生產(chǎn)性能;克隆了鴨MEF2A和MEF2D基因編碼區(qū)內(nèi)CAG重復(fù)序列及其兩端側(cè)翼序列,鑒定了它們在農(nóng)華麻鴨GF2系肉鴨中的多態(tài)性;初步分析了CAG重復(fù)多態(tài)性與其側(cè)翼序列中SNP間的關(guān)系;最后,對CAG重復(fù)基因型和側(cè)翼序列中SNP位點(diǎn)、SNP單倍型組合與生產(chǎn)性能進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析。主要研究結(jié)果如下:(1)9周齡時,農(nóng)華麻鴨GF2系公鴨的體重、胸肌重、腿肌重、屠宰率、胸肌率和腿肌率達(dá)到了347...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
啟動子中重復(fù)序列長度與基因表達(dá)的關(guān)系
因組 DNA 的提取效果定了生產(chǎn)性能的 70 只肉鴨個體,分別進(jìn)行了基因組因組 DNA 經(jīng)微量核酸蛋白儀檢測其濃度和純度,濃度經(jīng) 1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測其完整性。結(jié)果發(fā)現(xiàn),所度均符合要求,并且電泳條帶清晰整齊、沒有雜帶,表用于后續(xù)實驗。部分個體的凝膠電泳檢測結(jié)果如圖 3
圖 3-2 (A)引物對 MEF2A-730 的 PCR 產(chǎn)物電泳圖;(B)引物對 MEF2A-730 的克隆序列;(C)克隆序列的比對結(jié)果注:圖(B)中粗體和下劃線表示的區(qū)域即為 CAG 重復(fù)Fig.3-2(A)Gel electrophoresis result of primer pair MEF2A-730 PCR products;(B)Clonesequence of primer pair MEF2A-730;(C)Sequences alignment of clone sequence of primerpair MEF2A-730Note: The area indicated by bold and underline in Figure (B) is CAG repeat隨后,為明確試驗群體中 MEF2A 基因 CAG 重復(fù)及其側(cè)翼序列是否存在多態(tài)性,隨機(jī)挑選了 27 個體進(jìn)行多態(tài)性的初步鑒定。不同個體測序結(jié)果的比對情況如圖 3-3 所示,表明 MEF2A 基因 CAG 重復(fù)無多態(tài)性,并且其側(cè)翼序列中無SNP 位點(diǎn)。因此,后續(xù)在全部 70 個體中將不再檢測該基因。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]興義鴨MEF2D基因的多態(tài)性及組織差異表達(dá)研究[J]. 師新彩,趙忠海,李輝,卜小雁,易恒潔,陳林. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2018(02)
[2]MEF2A基因第11外顯子CAG三聯(lián)核苷酸重復(fù)序列多態(tài)性與動脈粥樣硬化性腦梗死的相關(guān)性研究[J]. 王鳳,應(yīng)忠明,朱敏,鄭周,胡曉飛,王恩,伍嫦珠,何欣威,李衛(wèi)玲,李彩,朱峰,金笑平. 中華神經(jīng)醫(yī)學(xué)雜志. 2017 (12)
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[8]MyoG和MEF2a基因多態(tài)性聚合效應(yīng)對鴨屠宰性狀的影響[J]. 趙忠海,李輝,易恒潔,楊勝林,彭邦星,卜小雁. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(18)
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[10]四川麻鴨體尺性狀和生產(chǎn)性能觀測[J]. 張軍,呂佳,葉建超,羅淑英,陳有才,胡衛(wèi)杰,朱攀華. 中國家禽. 2016(05)
碩士論文
[1]西門塔爾牛、雪龍黑牛兩群體部分胴體性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 宋禹昕.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[2]興義鴨MEF2A、MEF2B、MEF2C和MEF2D基因克隆與組織時空表達(dá)研究[D]. 趙忠海.貴州大學(xué) 2016
[3]北京油雞體重和屠體性狀的全基因組關(guān)聯(lián)研究[D]. 吳丹.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[4]固始雞安卡雞資源群體1、8、9、10、11、13號染色體重要經(jīng)濟(jì)性狀的QTL定位[D]. 張艷芳.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[5]鴨MEF2家族的克隆及組織表達(dá)研究[D]. 司建民.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[6]微衛(wèi)星DNA多態(tài)性與騾鴨產(chǎn)肉性能關(guān)聯(lián)性研究[D]. 董健.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[7]北京鴨和櫻桃谷鴨肉用性能及MSTN基因多態(tài)性的研究[D]. 戴曄.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
[8]豬MSTN基因和MEF2D基因的多態(tài)性及其與胴體和肉質(zhì)性狀間關(guān)聯(lián)性研究[D]. 陳磊.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號:3408336
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
啟動子中重復(fù)序列長度與基因表達(dá)的關(guān)系
因組 DNA 的提取效果定了生產(chǎn)性能的 70 只肉鴨個體,分別進(jìn)行了基因組因組 DNA 經(jīng)微量核酸蛋白儀檢測其濃度和純度,濃度經(jīng) 1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測其完整性。結(jié)果發(fā)現(xiàn),所度均符合要求,并且電泳條帶清晰整齊、沒有雜帶,表用于后續(xù)實驗。部分個體的凝膠電泳檢測結(jié)果如圖 3
圖 3-2 (A)引物對 MEF2A-730 的 PCR 產(chǎn)物電泳圖;(B)引物對 MEF2A-730 的克隆序列;(C)克隆序列的比對結(jié)果注:圖(B)中粗體和下劃線表示的區(qū)域即為 CAG 重復(fù)Fig.3-2(A)Gel electrophoresis result of primer pair MEF2A-730 PCR products;(B)Clonesequence of primer pair MEF2A-730;(C)Sequences alignment of clone sequence of primerpair MEF2A-730Note: The area indicated by bold and underline in Figure (B) is CAG repeat隨后,為明確試驗群體中 MEF2A 基因 CAG 重復(fù)及其側(cè)翼序列是否存在多態(tài)性,隨機(jī)挑選了 27 個體進(jìn)行多態(tài)性的初步鑒定。不同個體測序結(jié)果的比對情況如圖 3-3 所示,表明 MEF2A 基因 CAG 重復(fù)無多態(tài)性,并且其側(cè)翼序列中無SNP 位點(diǎn)。因此,后續(xù)在全部 70 個體中將不再檢測該基因。
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期刊論文
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[6]我國肉鴨產(chǎn)業(yè)在新常態(tài)下的發(fā)展思路[J]. 侯水生. 中國禽業(yè)導(dǎo)刊. 2017 (12)
[7]鴨MEF2A基因克隆及其mRNA在組織間的表達(dá)差異[J]. 趙忠海,李輝,卜小雁,師新彩,張蓉,王成棟. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2017(01)
[8]MyoG和MEF2a基因多態(tài)性聚合效應(yīng)對鴨屠宰性狀的影響[J]. 趙忠海,李輝,易恒潔,楊勝林,彭邦星,卜小雁. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(18)
[9]我國優(yōu)質(zhì)肉鴨品種選育進(jìn)展及發(fā)展趨勢[J]. 李昂. 中國禽業(yè)導(dǎo)刊. 2016 (17)
[10]四川麻鴨體尺性狀和生產(chǎn)性能觀測[J]. 張軍,呂佳,葉建超,羅淑英,陳有才,胡衛(wèi)杰,朱攀華. 中國家禽. 2016(05)
碩士論文
[1]西門塔爾牛、雪龍黑牛兩群體部分胴體性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 宋禹昕.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
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[3]北京油雞體重和屠體性狀的全基因組關(guān)聯(lián)研究[D]. 吳丹.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[4]固始雞安卡雞資源群體1、8、9、10、11、13號染色體重要經(jīng)濟(jì)性狀的QTL定位[D]. 張艷芳.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[5]鴨MEF2家族的克隆及組織表達(dá)研究[D]. 司建民.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[6]微衛(wèi)星DNA多態(tài)性與騾鴨產(chǎn)肉性能關(guān)聯(lián)性研究[D]. 董健.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[7]北京鴨和櫻桃谷鴨肉用性能及MSTN基因多態(tài)性的研究[D]. 戴曄.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
[8]豬MSTN基因和MEF2D基因的多態(tài)性及其與胴體和肉質(zhì)性狀間關(guān)聯(lián)性研究[D]. 陳磊.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號:3408336
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