PB2蛋白576E對H3N2犬流感病毒哺乳動物適應性的作用及其機制研究
發(fā)布時間:2021-09-23 19:46
H3N2犬流感病毒(Canine influenza virus,CIV)是一種由禽流感病毒跨宿主傳染至犬,可在犬間迅速傳播的傳染性呼吸道病毒,在亞洲多國以及美國的犬中廣泛流行,易伴隨繼發(fā)性感染,對犬的健康造成極大危害。實驗室前期研究發(fā)現(xiàn)兩株在鼠上復制能力完全不同的毒株:一株禽源H3N2 CIV(A/canine/Zhejiang/01/2012)(簡稱為ZJ01),鼠上復制良好,但無法感染禽;一株H3N2禽流感病毒(A/chicken/Shanghai/D6/2012)(簡稱為SHD6),不感染小鼠。ZJ01-PB2被SHD6-PB2替換后,ZJ01病毒無法成功拯救;反之,將ZJ01-PB2替換到SHD6毒株之后,SHD6在鼠上復制能力從不感染變?yōu)閺椭屏己�。本研究重點闡明PB2對ZJ01病毒在哺乳動物中的適應性及作用機制。分別以ZJ01和SHD6為背景,通過聚合酶活性實驗測定單、雙基因替換后的聚合酶活性,結果顯示,ZJ01-PB2是影響ZJ01病毒株聚合酶活性的關鍵基因。通過替換PB2基因的五個功能區(qū)測定聚合酶活性,結果發(fā)現(xiàn),ZJ01 PB2蛋白的627-domain對聚合酶活性具有...
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
目的片段擴增Fig.2-1Amplificationofthetargetfragment
中國農業(yè)科學院碩士學位論文第二章H3N2犬流感病毒PB2基因576氨基酸位點對聚合酶活性有重要影響16圖2-2單基因和雙基因替換檢測聚合酶活性結果Fig.2-2resultsofsinglegeneanddoublegenesubstitutionfordetectionofpolymeraseactivityA:以ZJ01為背景單基因替換B:以SHD6為背景單基因替換C:以ZJ01為背景雙基因替換D:以SHD6為背景雙基因替換2.3.3關鍵氨基酸位點的篩選對比ZJ01和SHD6毒株的PB2基因,共有18個氨基酸位點不同。將PB2通過功能區(qū)劃分為五個區(qū)域:PB2基因N端區(qū)域、Mid區(qū)域、帽子結合區(qū)域(Cap-binding)、Linker區(qū)域、627功能區(qū)(627-Domain)。每個區(qū)域都包含ZJ01與SHD6毒株不同的氨基酸位點,其結果如下圖所示(圖2-3)。
中國農業(yè)科學院碩士學位論文第二章H3N2犬流感病毒PB2基因576氨基酸位點對聚合酶活性有重要影響17圖2-3氨基酸位點的篩選Fig.2-3Screeningofaminoacidsites2.3.4不同區(qū)域以及氨基酸位點影響聚合酶活性的結果構建了不同區(qū)域突變的PB2基因,通過聚合酶活性實驗測定不同區(qū)域突變對聚合酶活性的影響。其結果如下圖所示(圖2.4)。根據(jù)以下結果可知,627-domain突變后使ZJ01聚合酶活性顯著降低260倍(****P<0.0001)。以SHD6為背景,PB2的627-domain使得SHD6的聚合酶活性顯著增高380倍(****P<0.0001);PB2基因的627-domain區(qū)域中共包含4個ZJ01和SHD6不同的氨基酸位點,通過單點突變,測定不同點突變對聚合酶活性的影響。其結果如下圖所示(圖2-4),當PB2基因的576氨基酸從谷氨酸(E)突變?yōu)橘嚢彼?K)時,使得ZJ01的聚合酶活性顯著降低90倍(****P<0.0001)。當SHD6的PB2基因的576氨基酸位點從賴氨酸(K)突變?yōu)楣劝彼?E)之后,使得SHD6的聚合酶活性顯著增高240倍(***P<0.0002)(圖2-4)。圖2-4627-domain對聚合酶活性的影響Fig.2-4627-domainEffectonpolymeraseactivityA:以ZJ01為背景區(qū)域替換聚合酶活性B:以ZJ01為背景單點突變聚合酶活性C:以SHD6為背景單點突變聚合酶活性
【參考文獻】:
期刊論文
[1]The D253N Mutation in the Polymerase Basic 2 Gene in Avian Influenza(H9N2) Virus Contributes to the Pathogenesis of the Virus in Mammalian Hosts[J]. Jinfeng Zhang,Rong Su,Xiaoyun Jian,Hongliang An,Ronbing Jiang,Chris Ka Pun Mok. Virologica Sinica. 2018(06)
本文編號:3406304
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
目的片段擴增Fig.2-1Amplificationofthetargetfragment
中國農業(yè)科學院碩士學位論文第二章H3N2犬流感病毒PB2基因576氨基酸位點對聚合酶活性有重要影響16圖2-2單基因和雙基因替換檢測聚合酶活性結果Fig.2-2resultsofsinglegeneanddoublegenesubstitutionfordetectionofpolymeraseactivityA:以ZJ01為背景單基因替換B:以SHD6為背景單基因替換C:以ZJ01為背景雙基因替換D:以SHD6為背景雙基因替換2.3.3關鍵氨基酸位點的篩選對比ZJ01和SHD6毒株的PB2基因,共有18個氨基酸位點不同。將PB2通過功能區(qū)劃分為五個區(qū)域:PB2基因N端區(qū)域、Mid區(qū)域、帽子結合區(qū)域(Cap-binding)、Linker區(qū)域、627功能區(qū)(627-Domain)。每個區(qū)域都包含ZJ01與SHD6毒株不同的氨基酸位點,其結果如下圖所示(圖2-3)。
中國農業(yè)科學院碩士學位論文第二章H3N2犬流感病毒PB2基因576氨基酸位點對聚合酶活性有重要影響17圖2-3氨基酸位點的篩選Fig.2-3Screeningofaminoacidsites2.3.4不同區(qū)域以及氨基酸位點影響聚合酶活性的結果構建了不同區(qū)域突變的PB2基因,通過聚合酶活性實驗測定不同區(qū)域突變對聚合酶活性的影響。其結果如下圖所示(圖2.4)。根據(jù)以下結果可知,627-domain突變后使ZJ01聚合酶活性顯著降低260倍(****P<0.0001)。以SHD6為背景,PB2的627-domain使得SHD6的聚合酶活性顯著增高380倍(****P<0.0001);PB2基因的627-domain區(qū)域中共包含4個ZJ01和SHD6不同的氨基酸位點,通過單點突變,測定不同點突變對聚合酶活性的影響。其結果如下圖所示(圖2-4),當PB2基因的576氨基酸從谷氨酸(E)突變?yōu)橘嚢彼?K)時,使得ZJ01的聚合酶活性顯著降低90倍(****P<0.0001)。當SHD6的PB2基因的576氨基酸位點從賴氨酸(K)突變?yōu)楣劝彼?E)之后,使得SHD6的聚合酶活性顯著增高240倍(***P<0.0002)(圖2-4)。圖2-4627-domain對聚合酶活性的影響Fig.2-4627-domainEffectonpolymeraseactivityA:以ZJ01為背景區(qū)域替換聚合酶活性B:以ZJ01為背景單點突變聚合酶活性C:以SHD6為背景單點突變聚合酶活性
【參考文獻】:
期刊論文
[1]The D253N Mutation in the Polymerase Basic 2 Gene in Avian Influenza(H9N2) Virus Contributes to the Pathogenesis of the Virus in Mammalian Hosts[J]. Jinfeng Zhang,Rong Su,Xiaoyun Jian,Hongliang An,Ronbing Jiang,Chris Ka Pun Mok. Virologica Sinica. 2018(06)
本文編號:3406304
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