偽狂犬病毒編碼的miRNA血清表達譜及其在疫苗免疫與感染鑒別診斷中的應用
發(fā)布時間:2021-09-11 15:58
偽狂犬。≒esudorabies,PR)是對養(yǎng)豬業(yè)造成嚴重性破壞的重要疫病之一。此病對斷奶后的仔豬、育肥豬、母豬造成明顯神經(jīng)性癥狀、不育、木乃伊胎等一系列嚴重疾病。近期皰疹病毒編碼的miRNA的研究表明,一些皰疹病毒編碼的miRNA參與病毒復制過程,甚至在病毒的調(diào)節(jié)過程中起著關鍵的作用。而目前對于偽狂犬病毒編碼的miRNA來說,相關的研究甚少。本研究旨在研究偽狂犬病毒編碼的miRNA血清表達譜及其在疫苗免疫與感染鑒別診斷中的應用。抽取不同生長階段豬的血清,分別混合不同生長階段疫苗免疫豬的血清和免疫后感染豬的血清。用血清RNA提取試劑盒提取總RNA,利用RT-PCR和實時熒光定量比較集中不同血清樣本偽狂犬病毒編碼的miRNA表達譜,利用生物信息學的方法分析偽狂犬病毒編碼的miRNA對自身的調(diào)控以及感染病毒后對宿主miRNA表達譜的影響。本研究根據(jù)在感染偽狂犬病毒的血清和免疫的血清中miRNA表達量的差異,做出了關于偽狂犬病毒miRNA的血清表達譜。同時,比較分析了不同血清樣本中的miRNA表達譜的差異顯著性,篩選驗證出能夠作為分子標志的miRN A。此外還詳細的分析了在疫苗免疫與感染后...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學遼寧省
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
偽狂犬病毒粒子結(jié)構(gòu)(PomeranzLEetal,2005)
圖 2-2.由 PRV 編碼的 miRNA(圈)和它們的靶基因(矩形)形成的基因調(diào)控網(wǎng)絡。 Gene regulatory networks formed by PRV-encoded miRNAs (circles) and their tar(rectangular).犬病毒功能基因與其編碼的 miRNA狂犬病毒株 JS-2012 株的基因組,分析其編碼的 miRNA 在基因 miRNA 都不參與編碼豬偽狂犬病毒的蛋白質(zhì)編碼,集中在 giRNA 占偽狂犬病毒編碼的 miMRA 中很大部分,miRNA-24-含子中。圖一中多數(shù) miRNA 存在的部分多數(shù)被認為是非編碼Kb 的偽狂犬病毒 DNA 鏈中,編碼 gB,gC,gD 等 N 多個蛋白的 miRNA,因為其高度穩(wěn)定的特性,更能用于疫苗免疫與感染 集中分布在 100Kb 左右處,其存在位置可能因為周圍沒有功能在。到偽狂犬病毒編碼的這 37 條 miRNA 后,將其位置與功能性基來。圖中顯示 miRNA 的位置不在編碼蛋白質(zhì)的基因組中,大白質(zhì)基因位置較遠,不參與偽狂犬病毒蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)蛋白和非
22圖 2-2:病毒編碼的 miRNA 在 PRV JS-2012 基因組中的位置Fig 2-2: Location of virus-encoded miRNAs in the PRV JS-2012 genome注:長線表示偽狂犬病毒基因組,黑色尖頭表示偽狂犬病毒的功能性基因位置,短點標識 miRNA 所在位置。2.3 討論在此之前幾個研究已經(jīng)證明病毒 mRNA 可以由偽狂犬病毒 miRNA 調(diào)節(jié)。偽狂犬病毒編碼的 miRNA 靶向關鍵的反式激活蛋白,這些調(diào)節(jié)機制是所有偽狂犬病毒中控制潛伏期建立和再活化的關鍵。在前人的研究中,這可能是通過直接抑制早期基因來嚴格控制潛伏期的存活機制(Deltcheva E et al,2011)。miRNA-15,miRNA-16,miRNA-17,miRNA-22,miRNA-23,pmiRNA-25,miRNA-1,miRNA-3,miRNA-7,miRNA-8 和 miRNA-11 靶向位于 PRV 的大潛伏期轉(zhuǎn)錄物(LLT)區(qū)中。該靶向可能與維持三叉神經(jīng)節(jié)靜止狀態(tài)或再活化狀態(tài)相關。此外,miRNA 調(diào)節(jié)的途徑與宿主-病毒相互作用的許多方面相關。病毒 miRNA 對細胞轉(zhuǎn)錄物具有調(diào)節(jié)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2013年河南省豬偽狂犬野毒感染血清學調(diào)查[J]. 解偉濤,喬松林,王寅彪,郝慧芳,梁躍,張桂悅,郭成留,張改平. 中國動物傳染病學報. 2014(06)
[2]不同物種FABP3基因編碼區(qū)及蛋白生物信息學分析[J]. 高紅,彭靜,沈一飛,王穎,徐寧迎. 揚州大學學報(農(nóng)業(yè)與生命科學版). 2014(01)
[3]Emerging and re-emerging viruses: A global challenge illustrated by Chikungunya virus outbreaks[J]. Christian A Devaux. World Journal of Virology. 2012(01)
[4]廣東部分地區(qū)中小型豬場豬偽狂犬病野毒感染的血清學調(diào)查[J]. 冼瓊珍,蔡明福,王淑敏,黃良宗,顧萬軍. 動物醫(yī)學進展. 2006(10)
[5]ELISA在豬偽狂犬病診斷中的應用[J]. 牛春玲,祁小樂,崔保安,王鑫. 動物醫(yī)學進展. 2004(03)
本文編號:3393292
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學遼寧省
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
偽狂犬病毒粒子結(jié)構(gòu)(PomeranzLEetal,2005)
圖 2-2.由 PRV 編碼的 miRNA(圈)和它們的靶基因(矩形)形成的基因調(diào)控網(wǎng)絡。 Gene regulatory networks formed by PRV-encoded miRNAs (circles) and their tar(rectangular).犬病毒功能基因與其編碼的 miRNA狂犬病毒株 JS-2012 株的基因組,分析其編碼的 miRNA 在基因 miRNA 都不參與編碼豬偽狂犬病毒的蛋白質(zhì)編碼,集中在 giRNA 占偽狂犬病毒編碼的 miMRA 中很大部分,miRNA-24-含子中。圖一中多數(shù) miRNA 存在的部分多數(shù)被認為是非編碼Kb 的偽狂犬病毒 DNA 鏈中,編碼 gB,gC,gD 等 N 多個蛋白的 miRNA,因為其高度穩(wěn)定的特性,更能用于疫苗免疫與感染 集中分布在 100Kb 左右處,其存在位置可能因為周圍沒有功能在。到偽狂犬病毒編碼的這 37 條 miRNA 后,將其位置與功能性基來。圖中顯示 miRNA 的位置不在編碼蛋白質(zhì)的基因組中,大白質(zhì)基因位置較遠,不參與偽狂犬病毒蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)蛋白和非
22圖 2-2:病毒編碼的 miRNA 在 PRV JS-2012 基因組中的位置Fig 2-2: Location of virus-encoded miRNAs in the PRV JS-2012 genome注:長線表示偽狂犬病毒基因組,黑色尖頭表示偽狂犬病毒的功能性基因位置,短點標識 miRNA 所在位置。2.3 討論在此之前幾個研究已經(jīng)證明病毒 mRNA 可以由偽狂犬病毒 miRNA 調(diào)節(jié)。偽狂犬病毒編碼的 miRNA 靶向關鍵的反式激活蛋白,這些調(diào)節(jié)機制是所有偽狂犬病毒中控制潛伏期建立和再活化的關鍵。在前人的研究中,這可能是通過直接抑制早期基因來嚴格控制潛伏期的存活機制(Deltcheva E et al,2011)。miRNA-15,miRNA-16,miRNA-17,miRNA-22,miRNA-23,pmiRNA-25,miRNA-1,miRNA-3,miRNA-7,miRNA-8 和 miRNA-11 靶向位于 PRV 的大潛伏期轉(zhuǎn)錄物(LLT)區(qū)中。該靶向可能與維持三叉神經(jīng)節(jié)靜止狀態(tài)或再活化狀態(tài)相關。此外,miRNA 調(diào)節(jié)的途徑與宿主-病毒相互作用的許多方面相關。病毒 miRNA 對細胞轉(zhuǎn)錄物具有調(diào)節(jié)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2013年河南省豬偽狂犬野毒感染血清學調(diào)查[J]. 解偉濤,喬松林,王寅彪,郝慧芳,梁躍,張桂悅,郭成留,張改平. 中國動物傳染病學報. 2014(06)
[2]不同物種FABP3基因編碼區(qū)及蛋白生物信息學分析[J]. 高紅,彭靜,沈一飛,王穎,徐寧迎. 揚州大學學報(農(nóng)業(yè)與生命科學版). 2014(01)
[3]Emerging and re-emerging viruses: A global challenge illustrated by Chikungunya virus outbreaks[J]. Christian A Devaux. World Journal of Virology. 2012(01)
[4]廣東部分地區(qū)中小型豬場豬偽狂犬病野毒感染的血清學調(diào)查[J]. 冼瓊珍,蔡明福,王淑敏,黃良宗,顧萬軍. 動物醫(yī)學進展. 2006(10)
[5]ELISA在豬偽狂犬病診斷中的應用[J]. 牛春玲,祁小樂,崔保安,王鑫. 動物醫(yī)學進展. 2004(03)
本文編號:3393292
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