豬CR1-like基因全長(zhǎng)cDNA和部分DNA片段的克隆及序列生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-09-09 13:49
目的:本實(shí)驗(yàn)以豬為研究對(duì)象設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn),為進(jìn)一步研究豬紅細(xì)胞免疫功能,我們從分子水平上克隆豬CRl-like基因序列,并且分析該基因的特征。方法:運(yùn)用RT-PCR (Reverse transcription-polymerase chain reaction)和RACE (Rapid-amplification of cDNA ends)技術(shù)克隆豬CR1-like基因全長(zhǎng)cDNA,運(yùn)用普通PCR克隆豬CR1-like基因的啟動(dòng)子區(qū)域,結(jié)合生物信息學(xué)方法分析克隆的序列。結(jié)果:豬CR1-like基因全長(zhǎng)cDNA為4391bp,包含3996bp的ORF(Open reading frame),37bp的5’UTR (Untranslated regions)和358bp的3’UTR,該基因位于豬第九號(hào)染色體;通過(guò)對(duì)豬全血基因組DNA的PCR擴(kuò)增,得到了4872bp的豬CR1-like基因的富含轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的啟動(dòng)子區(qū)域序列。此外,生物信息學(xué)分析表明:預(yù)測(cè)豬的CR1-like蛋白分子質(zhì)量為146.6kD,理論等電點(diǎn)為7.95;該蛋白共編碼1331個(gè)氨基酸,由包含19個(gè)SCR (Short co...
【文章來(lái)源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1人A型E-C民1示意圖:Sitel所示sc民位置(SCRs?1-3)結(jié)合C4b,?Site2所示SCR位置(SCRs??8-10、15-17)結(jié)合C3b/C4b;?SC民25血
compemenary,為1組,其內(nèi)部序列具有高度的同源性,因此形成了?4個(gè)長(zhǎng)同源重復(fù)序列(Long??ous?repeat,?LHR),僅SCR?29與SCR?30不是LHR的組成部分,從N端巧始,??為LHR-A,LHR-B,LHR-C,LHR-D,LHR是CR1的獨(dú)特標(biāo)志[1〇]。相關(guān)試驗(yàn)??LHR-A中有一個(gè)C4b結(jié)合位點(diǎn)并具有補(bǔ)體轉(zhuǎn)化酶衰變加速活性,LH民-B和??有一個(gè)C3b/C4b結(jié)合位點(diǎn)并具有因子I輔助因子活性,該試驗(yàn)中利用點(diǎn)巧變研??證實(shí)了?C3b的結(jié)合位晉在SCRS8-10和15-17,C4b的結(jié)合位賈在SCR1-3[W??LH民-D有MBL[口](Mannan-bingding?lectin)和?Clq["喃結(jié)合位點(diǎn),并且在?SC民-25??(Swain-langley)和McC?(McCoy)的結(jié)合位點(diǎn)[W。在A型E-CR1中,由7個(gè)??序列分隔形成的SCR彼此具有同源性(例如SCR?3、10及17),僅N-端的SC民???2是例外的,這種同源性模式在SC民18和SCR?28之后略有變化。因此,在??8?W及SCRsl9-28的堿基序列內(nèi),每對(duì)由7個(gè)重復(fù)序列間隔形成的SC艮之間存??上的同源性(例如SC民S3-9和SC民slO-16,?SCRslO-11和SCRS17-18之間的同??99〇/〇)。正是W上所化的SCR特征的存在,導(dǎo)致CR1各個(gè)LH民之間同源性為??不等[153。??^?UiH?A?"?LHRB?■【?LHRC?■?,?LHR?D??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]感染豬放線桿菌(Ⅰ型)對(duì)豬紅細(xì)胞免疫功能的影響[J]. 左之才,崔恒敏,甘夢(mèng),彭西,鄧俊良. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(12)
[2]黃芪雜多糖調(diào)節(jié)AA小鼠紅細(xì)胞免疫黏附功能的研究[J]. 楊麗華,邱建東,李宏全. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2009(12)
[3]溫度對(duì)中華大蟾蜍和中華鱉冬眠前離體紅細(xì)胞免疫功能及其大小的影響[J]. 董曉敏,周顯青,王迎. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2009(03)
[4]Effect of Astragalus polysaccharides on Erythrocyte Immune Adherence of Chickens Inoculated with Infectious Bursal Disease Virus[J]. Lloyd Reeve-Johnson. Agricultural Sciences in China. 2007(11)
[5]酵母活性物質(zhì)對(duì)斷乳仔豬紅細(xì)胞免疫功能的影響[J]. 王玲,蒲萬(wàn)霞,扎西英派,索朗斯珠,孟曉琴,李蕓,程勝利,孟聚誠(chéng),華蘭英. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2007(08)
[6]紅細(xì)胞免疫的物質(zhì)基礎(chǔ)及影響因素[J]. 趙孟春,李宏全,段瑞旭,白瑞. 浙江畜牧獸醫(yī). 2007(03)
[7]補(bǔ)體受體1型的結(jié)構(gòu)功能及sCR1基因克隆表達(dá)的策略[J]. 羅雪,汪正清. 創(chuàng)傷外科雜志. 2005(06)
[8]高滲鹽水處理對(duì)失血性休克兔紅細(xì)胞免疫黏附功能及抗細(xì)菌感染的影響[J]. 李漢臣,秦兆寅,紀(jì)宗正,黎一鳴,劉先珍,王喜青,金紹岐. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2004(06)
[9]附紅細(xì)胞體自然感染對(duì)豬紅細(xì)胞的影響[J]. 馬海利,韓惠瑛,王勝,鄭明學(xué),李宏全,寧官保. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2003(04)
[10]11類(lèi)哺乳類(lèi)和鳥(niǎo)類(lèi)動(dòng)物紅細(xì)胞免疫功能的對(duì)比研究[J]. 王旭東,饒家榮,李正甫,朱文斌,楊紅華,周述成,李天祥,張世洪. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 1995(06)
博士論文
[1]紅細(xì)胞免疫分子、T細(xì)胞亞群水平及相關(guān)基因單核苷酸多態(tài)性與系統(tǒng)性紅斑狼瘡、肝細(xì)胞癌的關(guān)聯(lián)研究[D]. 胡金川.中國(guó)人民解放軍軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院 2009
碩士論文
[1]不同發(fā)育階段WHBE兔紅細(xì)胞免疫特性研究[D]. 潘永明.浙江大學(xué) 2009
本文編號(hào):3392207
【文章來(lái)源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1人A型E-C民1示意圖:Sitel所示sc民位置(SCRs?1-3)結(jié)合C4b,?Site2所示SCR位置(SCRs??8-10、15-17)結(jié)合C3b/C4b;?SC民25血
compemenary,為1組,其內(nèi)部序列具有高度的同源性,因此形成了?4個(gè)長(zhǎng)同源重復(fù)序列(Long??ous?repeat,?LHR),僅SCR?29與SCR?30不是LHR的組成部分,從N端巧始,??為LHR-A,LHR-B,LHR-C,LHR-D,LHR是CR1的獨(dú)特標(biāo)志[1〇]。相關(guān)試驗(yàn)??LHR-A中有一個(gè)C4b結(jié)合位點(diǎn)并具有補(bǔ)體轉(zhuǎn)化酶衰變加速活性,LH民-B和??有一個(gè)C3b/C4b結(jié)合位點(diǎn)并具有因子I輔助因子活性,該試驗(yàn)中利用點(diǎn)巧變研??證實(shí)了?C3b的結(jié)合位晉在SCRS8-10和15-17,C4b的結(jié)合位賈在SCR1-3[W??LH民-D有MBL[口](Mannan-bingding?lectin)和?Clq["喃結(jié)合位點(diǎn),并且在?SC民-25??(Swain-langley)和McC?(McCoy)的結(jié)合位點(diǎn)[W。在A型E-CR1中,由7個(gè)??序列分隔形成的SCR彼此具有同源性(例如SCR?3、10及17),僅N-端的SC民???2是例外的,這種同源性模式在SC民18和SCR?28之后略有變化。因此,在??8?W及SCRsl9-28的堿基序列內(nèi),每對(duì)由7個(gè)重復(fù)序列間隔形成的SC艮之間存??上的同源性(例如SC民S3-9和SC民slO-16,?SCRslO-11和SCRS17-18之間的同??99〇/〇)。正是W上所化的SCR特征的存在,導(dǎo)致CR1各個(gè)LH民之間同源性為??不等[153。??^?UiH?A?"?LHRB?■【?LHRC?■?,?LHR?D??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]感染豬放線桿菌(Ⅰ型)對(duì)豬紅細(xì)胞免疫功能的影響[J]. 左之才,崔恒敏,甘夢(mèng),彭西,鄧俊良. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(12)
[2]黃芪雜多糖調(diào)節(jié)AA小鼠紅細(xì)胞免疫黏附功能的研究[J]. 楊麗華,邱建東,李宏全. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2009(12)
[3]溫度對(duì)中華大蟾蜍和中華鱉冬眠前離體紅細(xì)胞免疫功能及其大小的影響[J]. 董曉敏,周顯青,王迎. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2009(03)
[4]Effect of Astragalus polysaccharides on Erythrocyte Immune Adherence of Chickens Inoculated with Infectious Bursal Disease Virus[J]. Lloyd Reeve-Johnson. Agricultural Sciences in China. 2007(11)
[5]酵母活性物質(zhì)對(duì)斷乳仔豬紅細(xì)胞免疫功能的影響[J]. 王玲,蒲萬(wàn)霞,扎西英派,索朗斯珠,孟曉琴,李蕓,程勝利,孟聚誠(chéng),華蘭英. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2007(08)
[6]紅細(xì)胞免疫的物質(zhì)基礎(chǔ)及影響因素[J]. 趙孟春,李宏全,段瑞旭,白瑞. 浙江畜牧獸醫(yī). 2007(03)
[7]補(bǔ)體受體1型的結(jié)構(gòu)功能及sCR1基因克隆表達(dá)的策略[J]. 羅雪,汪正清. 創(chuàng)傷外科雜志. 2005(06)
[8]高滲鹽水處理對(duì)失血性休克兔紅細(xì)胞免疫黏附功能及抗細(xì)菌感染的影響[J]. 李漢臣,秦兆寅,紀(jì)宗正,黎一鳴,劉先珍,王喜青,金紹岐. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2004(06)
[9]附紅細(xì)胞體自然感染對(duì)豬紅細(xì)胞的影響[J]. 馬海利,韓惠瑛,王勝,鄭明學(xué),李宏全,寧官保. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2003(04)
[10]11類(lèi)哺乳類(lèi)和鳥(niǎo)類(lèi)動(dòng)物紅細(xì)胞免疫功能的對(duì)比研究[J]. 王旭東,饒家榮,李正甫,朱文斌,楊紅華,周述成,李天祥,張世洪. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 1995(06)
博士論文
[1]紅細(xì)胞免疫分子、T細(xì)胞亞群水平及相關(guān)基因單核苷酸多態(tài)性與系統(tǒng)性紅斑狼瘡、肝細(xì)胞癌的關(guān)聯(lián)研究[D]. 胡金川.中國(guó)人民解放軍軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院 2009
碩士論文
[1]不同發(fā)育階段WHBE兔紅細(xì)胞免疫特性研究[D]. 潘永明.浙江大學(xué) 2009
本文編號(hào):3392207
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