環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)快速檢測牛乳腺炎病原菌方法的建立
發(fā)布時(shí)間:2021-09-05 13:47
乳腺炎是影響奶牛生產(chǎn)的主要疾病之一?焖贉(zhǔn)確鑒定出引起奶牛乳腺炎發(fā)病的主要病原體,對(duì)奶牛乳腺炎的防治、患病牛只的隔離治療、凈化牛群以及保證牛群健康生產(chǎn)具有十分重要的意義。但在生產(chǎn)實(shí)踐中,受到儀器設(shè)備、人員水平和養(yǎng)殖區(qū)域等現(xiàn)實(shí)條件制約,現(xiàn)有奶牛乳腺炎檢測技術(shù)顯的相對(duì)滯后。常規(guī)培養(yǎng)基檢測病原的方法繁瑣費(fèi)時(shí),而且經(jīng)常出現(xiàn)假陽性結(jié)果。而利用PCR方法檢測某一病原體的方法對(duì)操作人員水平和設(shè)備要求較高、不便在一線養(yǎng)殖中全面推廣。因此,開發(fā)快速、特異、靈敏、便捷、經(jīng)濟(jì)適用的奶牛乳腺炎病原菌檢測方法具有重要的應(yīng)用推廣價(jià)值和市場需求。環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一種新型等溫核酸擴(kuò)增技術(shù),因其檢測的特異性好、靈敏度高、耗時(shí)短、可操作性強(qiáng)等多種優(yōu)點(diǎn),近些年該技術(shù)已廣泛應(yīng)用于細(xì)菌、病毒、寄生蟲等多種病原生物的檢測中,在人、畜等的病原物檢測及疾病的早期診斷等領(lǐng)域有著十分廣闊的應(yīng)用前景。本研究通過技術(shù)優(yōu)化和方案改進(jìn),建立了基于LAMP檢測奶牛乳腺炎主要致病菌的方法。主要內(nèi)容包括:(1)結(jié)合鹽酸胍裂解液和核酸提取柱,建立了從牛奶中快速...
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
奶牛乳腺炎發(fā)展示意圖
進(jìn)行鏈置換反應(yīng),實(shí)現(xiàn)恒定溫度條件下對(duì)目的 DNA 片段進(jìn)行體外快速擴(kuò)增。該技術(shù)關(guān)鍵點(diǎn)是引物設(shè)計(jì),引物設(shè)計(jì)主要包括兩點(diǎn):促使反應(yīng)起始物的形成;擴(kuò)增末端能夠形成獨(dú)特莖環(huán)結(jié)構(gòu)以使反應(yīng)能夠循環(huán)。LAMP 擴(kuò)增反應(yīng)包括三個(gè)過程:引物設(shè)計(jì)、反應(yīng)起始物形成以及擴(kuò)增的往復(fù)循環(huán)。LAMP 反應(yīng)檢測的優(yōu)點(diǎn)有:(1)特異性強(qiáng)、靈敏度高。比PCR 擴(kuò)增的靈敏度高出1~2 個(gè)數(shù)量級(jí);(2)反應(yīng)快速高效、反應(yīng)條件簡單。不需要 PCR 的預(yù)變性步驟,核酸的擴(kuò)增在水浴鍋中或恒溫箱恒溫條件下反應(yīng)1h 左右就可以完成;(3)結(jié)果易于觀察。通過自然光下看渾濁度,直接觀察或高速離心后觀察是否有沉淀,也可加入不同的顯色劑來觀察顏色變化。3.2 LAMP 反應(yīng)原理鏈置換型 DNA 聚合酶(如圖 2):這種聚合酶(Bst DNAPolymerase)最適溫度是 65℃,在擴(kuò)增雙鏈 DNA 時(shí)能對(duì)其中一條鏈邊解離邊伸長。
LAMP 的擴(kuò)增分大致分為三個(gè)階段:1)循環(huán)模板合成階段由于雙鏈 DNA 模板在 60 ℃ ~65℃環(huán)境下處于不穩(wěn)定、動(dòng)態(tài)的平衡狀態(tài),此時(shí)在大片段鏈置換型 DNA 聚合酶( Bst DNApolymerase)的催化作用下,該反應(yīng)體系的正向內(nèi)引物 FIP 外引物 F3 依次與各自位點(diǎn)特異性結(jié)合(如圖 3),形成兩條各自互補(bǔ)的 DNA 單鏈,新合成的 DNA 單鏈其中一端存在能與自身互補(bǔ)配對(duì)的堿基片段,這部分自配對(duì)生成帶有環(huán)狀結(jié)構(gòu)的 DNA 單鏈。隨后反向內(nèi)引物 BIP 和外引物 B3 依次結(jié)合到各自匹配的特異性結(jié)合位點(diǎn),并打開DNA 單鏈在上一步形成的環(huán)狀結(jié)構(gòu)合成了兩端反向的環(huán)狀結(jié)構(gòu)鏈。因此,當(dāng)整條鏈呈現(xiàn)出啞鈴狀結(jié)構(gòu)時(shí),LAMP 擴(kuò)增的起始階段完成了。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]奶牛體細(xì)胞裂解方法的研究進(jìn)展[J]. 馮萬宇,周慶民,徐馨,張艷. 養(yǎng)殖與飼料. 2016(10)
[2]乳品中3種常見細(xì)菌多重PCR檢測方法的建立[J]. 閆晗,呂國欽,張洋,張笑嫣,馮旭,王麗威. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2015(07)
[3]LAMP實(shí)時(shí)濁度法快速檢測腸出血性大腸桿菌O157的研究[J]. 李碧霞,游淑珠,鄺筱珊,馮家望,王小玉,唐食明,成曉維,許喜林. 現(xiàn)代食品科技. 2014(07)
[4]LAMP結(jié)合示差脈沖伏安法快速檢測肺炎克雷伯菌的方法建立及臨床應(yīng)用[J]. 劉孝波,蔣棟能,項(xiàng)貴明,蒲曉允. 國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2014(12)
[5]奶牛隱性乳房炎的檢測[J]. 楊柏齡. 畜牧獸醫(yī)科技信息. 2013(02)
[6]LAMP技術(shù)在動(dòng)物病毒病原檢測中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 周廣舟,徐蘇麗,譚曉榮,陳小兵. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2013(02)
[7]保健食品中沙門菌的快速檢測方法[J]. 牛振東,孫偉,高春. 中國衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2013(01)
[8]應(yīng)用LAMP快速檢測金黃色葡萄球菌的研究[J]. 唐夢君,周生,葛慶聯(lián),張小燕,蒲俊華,高玉時(shí). 現(xiàn)代食品科技. 2011(06)
[9]乳品中腸球菌LAMP快速檢測方法的建立及應(yīng)用[J]. 姜侃,張東雷,金燕飛,陳小珍. 中國乳品工業(yè). 2011(05)
[10]奶牛乳房炎主要病原菌及其分離鑒定方法研究進(jìn)展[J]. 鄧海平,蒲萬霞,俞詩源,王玲,孟小琴. 中國草食動(dòng)物. 2009(02)
博士論文
[1]奶牛肝功能酶檢測與乳房炎白色念珠菌快速診斷試紙條研究[D]. 劉平.廣西大學(xué) 2013
碩士論文
[1]南寧某牛場奶牛乳房炎調(diào)查及其快速檢測方法的建立與應(yīng)用[D]. 鄒佳琪.廣西大學(xué) 2016
[2]奶牛鏈球菌性乳房炎可視化LAMP檢測方法的建立及應(yīng)用[D]. 賀婷.廣西大學(xué) 2014
本文編號(hào):3385461
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
奶牛乳腺炎發(fā)展示意圖
進(jìn)行鏈置換反應(yīng),實(shí)現(xiàn)恒定溫度條件下對(duì)目的 DNA 片段進(jìn)行體外快速擴(kuò)增。該技術(shù)關(guān)鍵點(diǎn)是引物設(shè)計(jì),引物設(shè)計(jì)主要包括兩點(diǎn):促使反應(yīng)起始物的形成;擴(kuò)增末端能夠形成獨(dú)特莖環(huán)結(jié)構(gòu)以使反應(yīng)能夠循環(huán)。LAMP 擴(kuò)增反應(yīng)包括三個(gè)過程:引物設(shè)計(jì)、反應(yīng)起始物形成以及擴(kuò)增的往復(fù)循環(huán)。LAMP 反應(yīng)檢測的優(yōu)點(diǎn)有:(1)特異性強(qiáng)、靈敏度高。比PCR 擴(kuò)增的靈敏度高出1~2 個(gè)數(shù)量級(jí);(2)反應(yīng)快速高效、反應(yīng)條件簡單。不需要 PCR 的預(yù)變性步驟,核酸的擴(kuò)增在水浴鍋中或恒溫箱恒溫條件下反應(yīng)1h 左右就可以完成;(3)結(jié)果易于觀察。通過自然光下看渾濁度,直接觀察或高速離心后觀察是否有沉淀,也可加入不同的顯色劑來觀察顏色變化。3.2 LAMP 反應(yīng)原理鏈置換型 DNA 聚合酶(如圖 2):這種聚合酶(Bst DNAPolymerase)最適溫度是 65℃,在擴(kuò)增雙鏈 DNA 時(shí)能對(duì)其中一條鏈邊解離邊伸長。
LAMP 的擴(kuò)增分大致分為三個(gè)階段:1)循環(huán)模板合成階段由于雙鏈 DNA 模板在 60 ℃ ~65℃環(huán)境下處于不穩(wěn)定、動(dòng)態(tài)的平衡狀態(tài),此時(shí)在大片段鏈置換型 DNA 聚合酶( Bst DNApolymerase)的催化作用下,該反應(yīng)體系的正向內(nèi)引物 FIP 外引物 F3 依次與各自位點(diǎn)特異性結(jié)合(如圖 3),形成兩條各自互補(bǔ)的 DNA 單鏈,新合成的 DNA 單鏈其中一端存在能與自身互補(bǔ)配對(duì)的堿基片段,這部分自配對(duì)生成帶有環(huán)狀結(jié)構(gòu)的 DNA 單鏈。隨后反向內(nèi)引物 BIP 和外引物 B3 依次結(jié)合到各自匹配的特異性結(jié)合位點(diǎn),并打開DNA 單鏈在上一步形成的環(huán)狀結(jié)構(gòu)合成了兩端反向的環(huán)狀結(jié)構(gòu)鏈。因此,當(dāng)整條鏈呈現(xiàn)出啞鈴狀結(jié)構(gòu)時(shí),LAMP 擴(kuò)增的起始階段完成了。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]奶牛體細(xì)胞裂解方法的研究進(jìn)展[J]. 馮萬宇,周慶民,徐馨,張艷. 養(yǎng)殖與飼料. 2016(10)
[2]乳品中3種常見細(xì)菌多重PCR檢測方法的建立[J]. 閆晗,呂國欽,張洋,張笑嫣,馮旭,王麗威. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2015(07)
[3]LAMP實(shí)時(shí)濁度法快速檢測腸出血性大腸桿菌O157的研究[J]. 李碧霞,游淑珠,鄺筱珊,馮家望,王小玉,唐食明,成曉維,許喜林. 現(xiàn)代食品科技. 2014(07)
[4]LAMP結(jié)合示差脈沖伏安法快速檢測肺炎克雷伯菌的方法建立及臨床應(yīng)用[J]. 劉孝波,蔣棟能,項(xiàng)貴明,蒲曉允. 國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2014(12)
[5]奶牛隱性乳房炎的檢測[J]. 楊柏齡. 畜牧獸醫(yī)科技信息. 2013(02)
[6]LAMP技術(shù)在動(dòng)物病毒病原檢測中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 周廣舟,徐蘇麗,譚曉榮,陳小兵. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2013(02)
[7]保健食品中沙門菌的快速檢測方法[J]. 牛振東,孫偉,高春. 中國衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2013(01)
[8]應(yīng)用LAMP快速檢測金黃色葡萄球菌的研究[J]. 唐夢君,周生,葛慶聯(lián),張小燕,蒲俊華,高玉時(shí). 現(xiàn)代食品科技. 2011(06)
[9]乳品中腸球菌LAMP快速檢測方法的建立及應(yīng)用[J]. 姜侃,張東雷,金燕飛,陳小珍. 中國乳品工業(yè). 2011(05)
[10]奶牛乳房炎主要病原菌及其分離鑒定方法研究進(jìn)展[J]. 鄧海平,蒲萬霞,俞詩源,王玲,孟小琴. 中國草食動(dòng)物. 2009(02)
博士論文
[1]奶牛肝功能酶檢測與乳房炎白色念珠菌快速診斷試紙條研究[D]. 劉平.廣西大學(xué) 2013
碩士論文
[1]南寧某牛場奶牛乳房炎調(diào)查及其快速檢測方法的建立與應(yīng)用[D]. 鄒佳琪.廣西大學(xué) 2016
[2]奶牛鏈球菌性乳房炎可視化LAMP檢測方法的建立及應(yīng)用[D]. 賀婷.廣西大學(xué) 2014
本文編號(hào):3385461
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3385461.html
最近更新
教材專著