豬源產(chǎn)腸毒素大腸桿菌菌毛基因多重PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-09-04 22:28
為建立一種可同時(shí)快速準(zhǔn)確檢測(cè)5種菌毛類(lèi)型的產(chǎn)腸毒素大腸桿菌(ETEC)的多重PCR方法,本研究首先通過(guò)大腸桿菌特異性基因uidA的PCR方法鑒定大腸桿菌;選取國(guó)內(nèi)外流行的攜帶K88、K99、F18ab、F18ac和F41菌毛基因的ETEC菌株,根據(jù)這5種菌毛基因的保守序列設(shè)計(jì)5對(duì)特異性引物,通過(guò)對(duì)反應(yīng)條件的優(yōu)化,建立了能同時(shí)檢測(cè)上述5種菌毛ETEC的多重PCR方法。uidA基因的PCR結(jié)果顯示,除了大腸桿菌有特異性擴(kuò)增外,其他細(xì)菌均不能擴(kuò)增,可以用于大腸桿菌的鑒定。菌毛多重PCR優(yōu)化后的反應(yīng)條件為:各混合菌毛基因引物終濃度為3.2μmol/L,各大腸桿菌混合DNA模板濃度為2.5×107拷貝/μL,退火溫度為58℃;特異性試驗(yàn)結(jié)果顯示,該多重PCR方法能夠特異性擴(kuò)增5種ETEC的菌毛基因,而豬源沙門(mén)氏菌、豬源鏈球菌和大腸桿菌DH5α未見(jiàn)擴(kuò)增,特異性強(qiáng);敏感性試驗(yàn)結(jié)果顯示,該方法對(duì)攜帶5種菌毛的大腸桿菌基因組DNA的最低檢測(cè)量均為2.5×104拷貝/μL,敏感性較高。采用uidA基因的PCR方法檢測(cè)了河北省腹瀉致死仔豬臟器分離的101株細(xì)菌,結(jié)果均為大腸桿菌。采用該多重PCR方法和單一P...
【文章來(lái)源】:中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,42(11)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
大腸桿菌uid A基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
使用表1中的引物分別對(duì)5種攜帶不同菌毛基因的標(biāo)準(zhǔn)ETEC基因組DNA進(jìn)行單一PCR擴(kuò)增。結(jié)果顯示,5種標(biāo)準(zhǔn)菌株基因組DNA均擴(kuò)增出了目的條帶,且均與預(yù)期相符(菌毛基因K88、K99、F18ab、F18ac和F41產(chǎn)物長(zhǎng)度分別為343 bp、157 bp、282 bp、494 bp和580 bp)(圖2)。表明,各引物均能有效擴(kuò)增各大腸桿菌菌毛基因。2.3 多重PCR反應(yīng)條件優(yōu)化結(jié)果
分別以各標(biāo)準(zhǔn)ETEC混合或者單獨(dú)基因組DNA為模板,利用優(yōu)化的多重PCR方法進(jìn)行擴(kuò)增。結(jié)果顯示,多重PCR可從攜帶K88、K99、F18ab、F18ac和F41菌毛的大腸桿菌混合或者單獨(dú)基因組DNA擴(kuò)增出相應(yīng)目的條帶,但大腸桿菌DH5α、豬源霍亂沙門(mén)氏菌和豬源鏈球菌基因組DNA無(wú)擴(kuò)增(圖4),表明該方法特異性較強(qiáng)。圖4 多重PCR的特異性試驗(yàn)結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水質(zhì)中大腸桿菌熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 樓秋雯,陳為為,黃志廣,安紫琿,朱振洪. 科技創(chuàng)新與應(yīng)用. 2019(35)
[2]國(guó)內(nèi)外豬源產(chǎn)腸毒素大腸桿菌疫苗研究進(jìn)展[J]. 楊德鴻,麥凱杰,朱元軍,劉洋洋,羅翠芬,周慶豐,劉軍發(fā). 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(07)
[3]廣西豬源產(chǎn)腸毒素大腸桿菌毒力因子及多重耐藥性分析[J]. 葛晨玲,石大麗,胡文,宋星星,葛強(qiáng),莫玉鵬,胡傳活,王曉曄. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(03)
[4]上海臨港地區(qū)豬源ETEC毒力因子及耐藥性調(diào)查[J]. 邢濤,郁星星,朱愛(ài)軍,張紅飛,周光勝,張敏,王海根,李金貴. 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2018(01)
[5]產(chǎn)腸毒素大腸桿菌多重PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 曲澤慧,陳佩佩,張愛(ài)芹,郭東春,師東方,曲連東. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(12)
[6]動(dòng)物源產(chǎn)腸毒素大腸桿菌(ETEC)黏附素研究進(jìn)展[J]. 周虹,朱軍,朱國(guó)強(qiáng). 微生物學(xué)報(bào). 2012(06)
[7]食源性大腸桿菌的PCR檢測(cè)[J]. 席美麗,只帥,王小璞,楊保偉,王新. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2011(12)
[8]陜西省致仔豬腹瀉ETEC的分子流行病學(xué)調(diào)查[J]. 王春江,趙獻(xiàn)軍,趙寶,郝艷陽(yáng),齊雪峰. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(07)
[9]豬源腸毒素性大腸桿菌菌毛基因多重PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 華榮虹,張書(shū)霞,何孔旺. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(02)
[10]斷奶仔豬源大腸桿菌F18菌毛的分子流行病學(xué)研究[J]. 成大榮,孫懷昌,徐建生,高崧. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(02)
碩士論文
[1]河北承德地區(qū)仔豬大腸桿菌的分離鑒定及藥物敏感性分析[D]. 張洪巖.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
本文編號(hào):3384121
【文章來(lái)源】:中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,42(11)北大核心CSCD
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【部分圖文】:
大腸桿菌uid A基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
使用表1中的引物分別對(duì)5種攜帶不同菌毛基因的標(biāo)準(zhǔn)ETEC基因組DNA進(jìn)行單一PCR擴(kuò)增。結(jié)果顯示,5種標(biāo)準(zhǔn)菌株基因組DNA均擴(kuò)增出了目的條帶,且均與預(yù)期相符(菌毛基因K88、K99、F18ab、F18ac和F41產(chǎn)物長(zhǎng)度分別為343 bp、157 bp、282 bp、494 bp和580 bp)(圖2)。表明,各引物均能有效擴(kuò)增各大腸桿菌菌毛基因。2.3 多重PCR反應(yīng)條件優(yōu)化結(jié)果
分別以各標(biāo)準(zhǔn)ETEC混合或者單獨(dú)基因組DNA為模板,利用優(yōu)化的多重PCR方法進(jìn)行擴(kuò)增。結(jié)果顯示,多重PCR可從攜帶K88、K99、F18ab、F18ac和F41菌毛的大腸桿菌混合或者單獨(dú)基因組DNA擴(kuò)增出相應(yīng)目的條帶,但大腸桿菌DH5α、豬源霍亂沙門(mén)氏菌和豬源鏈球菌基因組DNA無(wú)擴(kuò)增(圖4),表明該方法特異性較強(qiáng)。圖4 多重PCR的特異性試驗(yàn)結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水質(zhì)中大腸桿菌熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 樓秋雯,陳為為,黃志廣,安紫琿,朱振洪. 科技創(chuàng)新與應(yīng)用. 2019(35)
[2]國(guó)內(nèi)外豬源產(chǎn)腸毒素大腸桿菌疫苗研究進(jìn)展[J]. 楊德鴻,麥凱杰,朱元軍,劉洋洋,羅翠芬,周慶豐,劉軍發(fā). 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(07)
[3]廣西豬源產(chǎn)腸毒素大腸桿菌毒力因子及多重耐藥性分析[J]. 葛晨玲,石大麗,胡文,宋星星,葛強(qiáng),莫玉鵬,胡傳活,王曉曄. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(03)
[4]上海臨港地區(qū)豬源ETEC毒力因子及耐藥性調(diào)查[J]. 邢濤,郁星星,朱愛(ài)軍,張紅飛,周光勝,張敏,王海根,李金貴. 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2018(01)
[5]產(chǎn)腸毒素大腸桿菌多重PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 曲澤慧,陳佩佩,張愛(ài)芹,郭東春,師東方,曲連東. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(12)
[6]動(dòng)物源產(chǎn)腸毒素大腸桿菌(ETEC)黏附素研究進(jìn)展[J]. 周虹,朱軍,朱國(guó)強(qiáng). 微生物學(xué)報(bào). 2012(06)
[7]食源性大腸桿菌的PCR檢測(cè)[J]. 席美麗,只帥,王小璞,楊保偉,王新. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2011(12)
[8]陜西省致仔豬腹瀉ETEC的分子流行病學(xué)調(diào)查[J]. 王春江,趙獻(xiàn)軍,趙寶,郝艷陽(yáng),齊雪峰. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(07)
[9]豬源腸毒素性大腸桿菌菌毛基因多重PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 華榮虹,張書(shū)霞,何孔旺. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(02)
[10]斷奶仔豬源大腸桿菌F18菌毛的分子流行病學(xué)研究[J]. 成大榮,孫懷昌,徐建生,高崧. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2006(02)
碩士論文
[1]河北承德地區(qū)仔豬大腸桿菌的分離鑒定及藥物敏感性分析[D]. 張洪巖.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
本文編號(hào):3384121
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