近年來,隨著基因芯片技術(shù)的發(fā)展與育種技術(shù)的進(jìn)步,動植物的基因組選擇成為研究熱點(diǎn)。在家畜育種中,基因組選擇憑借其準(zhǔn)確性高、世代間隔短和育種成本低等優(yōu)勢被應(yīng)用于各種經(jīng)濟(jì)動物的種畜選擇中。本研究根據(jù)前期對內(nèi)蒙古阿爾巴斯絨山羊生產(chǎn)性能的遺傳評估結(jié)果,以山羊的體重（²=0.11）和纖維直徑（²=0.34）兩個性狀為例,參考NCBI已經(jīng)公布的山羊基因組序列信息,設(shè)定合理的基因組參數(shù)和世代傳遞過程,模擬歷史群體和基礎(chǔ)群體的表型和基因型數(shù)據(jù),之后,基礎(chǔ)群體繼續(xù)繁育,從基礎(chǔ)群的后代中選擇不同規(guī)模大小的參考群體和驗(yàn)證群體。以模擬獲得的表型和基因型數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),利用GBLUP、BayesA、BayesB、Bayesian Ridge Regression（BRR）、Bayesian LASSO共5種基因組育種值估計(jì)方法進(jìn)行遺傳評估,針對不同標(biāo)記密度、不同參考群體規(guī)模和不同QTL數(shù)目等,通過交叉驗(yàn)證的方法確定不同水平下基因組選擇的準(zhǔn)確性,初步確定影響基因組選擇準(zhǔn)確性的關(guān)鍵因素的最適水平。具體結(jié)果如下:1.通過研究發(fā)現(xiàn),標(biāo)記密度為45K的中等密度芯片可作為日后利用真實(shí)數(shù)... 

【文章來源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：46 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

絨纖維直徑基因組選擇的準(zhǔn)確性隨標(biāo)記密度的變化

圖 2 體重基因組選擇的準(zhǔn)確性隨標(biāo)記密度的變化Fig.2 Variation of accuracy of body weight genomic selection with marker density結(jié)體來看，無論是絨纖維直徑等中等偏高遺傳力性狀還是體重等低遺傳力性狀

圖 3 絨纖維直徑基因組選擇的準(zhǔn)確性隨參考群體規(guī)模的變化 The accuracy of genomic selection of pile fiber diameter varies with different reference populatio參考群體規(guī)模下體重基因組選擇準(zhǔn)確性的比較4 顯示，GBLUP 法、BRR 法、BL 法和 BA 法的基因組選擇的準(zhǔn)確性

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]內(nèi)蒙古絨山羊抓絨性狀的遺傳參數(shù)及遺傳進(jìn)展估計(jì)的研究[J]. 李學(xué)武,王瑞軍,王志英,娜清,李宏偉,王振宇,蘇蕊,張燕軍,李金泉,劉少卿.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(01)
[2]畜禽基因組選擇研究進(jìn)展[J]. 張哲,張勤,丁向東.  科學(xué)通報(bào). 2011(26)
[3]馬爾科夫鏈蒙特卡羅方法研究綜述[J]. 朱新玲.  統(tǒng)計(jì)與決策. 2009(21)

博士論文
[1]基于SNP芯片和全測序數(shù)據(jù)的奶牛全基因組關(guān)聯(lián)分析和基因組選擇研究[D]. 吳曉平.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014

碩士論文
[1]山羊絨候選基因篩選及低密度芯片設(shè)計(jì)[D]. 劉斌.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]肉用綿羊基因組選擇方法的模擬研究[D]. 王景霖.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]西門塔爾牛部分屠宰和肉質(zhì)性狀基因組選擇初步研究[D]. 朱淼.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[4]通過預(yù)選標(biāo)記法進(jìn)行基因組選擇[D]. 董林松.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012



本文編號：3377498