為了探討黑龍江某規(guī)�；翀霭l(fā)病奶牛的致病原及其生物學特征,對黑龍江省某規(guī)�；霾杉降挠膳７闻K組織樣本進行病毒分離鑒定,確定了樣本的基因型為BVDV-1d,5’UTR的同源性比對顯示,與中國北京株BJ1023（Genbank:KF925509）同源性最高。E₂基因的同源性比對顯示,與中國北京株BJ1308（Genbank:KT951841）同源性最高。對樣本進行E₂基因序列分析和理化性質(zhì)分析可知,E₂核苷酸水平上有58.9%的可變性位點（763/1 296）,保守區(qū)有兩段:核苷酸位置394～541以及919～1 234。有兩個潛在的跨膜信號區(qū)域:30～50和410～420。蛋白不穩(wěn)定性為33.62,可以將該蛋白質(zhì)分類為穩(wěn)定的蛋白質(zhì)。E2基因的抗原表位與瑞士毒株SuwaCp （Genbank:KC853441）的抗原表位優(yōu)勢部分走勢基本一致。分離獲得的毒株為我國BVDV毒株資源與分子流行病學提供了資料。 

【文章來源】：黑龍江八一農(nóng)墾大學學報. 2020,32(05)

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

5’UTR PCR結(jié)果

通過在BLAST對比結(jié)果顯示，樣本株AD-1基因型為BVDV-1d。將所得序列使用MegaX64與Genbank中公布的36株BVDV基因序列進行核苷酸、氨基酸同源性比較，結(jié)果顯示，5’-UTR測序結(jié)果的AD-1與所有參考毒株的同源性為70.8%～99.5%。與BVDV-1型的同源性為75.4%～99.5%，與BVDV-2型的參考株同源性為76.4%～77.9%，與BVDV-3型的參考株同源性為70.8%。樣本株AD-1的同源性最高同為北京株BJ1023(Genbank:KF925509）同源性為99.5%，其次是玉樹株Yushu2121(Genbank:KC414613）同源性為95.9%、寧夏株11Y59 (Genbank:JX437158）同源性為94.9%。從進化樹上可以看出，與北京株BJ1023處于同一進化分支。（圖2、圖3)圖3 BVDV 5’UTR基因核苷酸樹狀分析結(jié)果

BVDV 5’UTR基因核苷酸樹狀分析結(jié)果

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號：3371848