黑龍江省某規(guī)�；翀鯞VDV病毒分離鑒定及生物學(xué)信息分析
發(fā)布時間：2021-08-30 02:10
為了探討黑龍江某規(guī)�；翀霭l(fā)病奶牛的致病原及其生物學(xué)特征,對黑龍江省某規(guī)�；霾杉降挠膳７闻K組織樣本進(jìn)行病毒分離鑒定,確定了樣本的基因型為BVDV-1d,5’UTR的同源性比對顯示,與中國北京株BJ1023（Genbank:KF925509）同源性最高。E2基因的同源性比對顯示,與中國北京株BJ1308（Genbank:KT951841）同源性最高。對樣本進(jìn)行E2基因序列分析和理化性質(zhì)分析可知,E2核苷酸水平上有58.9%的可變性位點(diǎn)（763/1 296）,保守區(qū)有兩段:核苷酸位置394～541以及919～1 234。有兩個潛在的跨膜信號區(qū)域:30～50和410～420。蛋白不穩(wěn)定性為33.62,可以將該蛋白質(zhì)分類為穩(wěn)定的蛋白質(zhì)。E2基因的抗原表位與瑞士毒株SuwaCp （Genbank:KC853441）的抗原表位優(yōu)勢部分走勢基本一致。分離獲得的毒株為我國BVDV毒株資源與分子流行病學(xué)提供了資料。
【文章來源】：黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報. 2020,32(05)
【文章頁數(shù)】：10 頁
【部分圖文】：
5’UTR PCR結(jié)果
通過在BLAST對比結(jié)果顯示，樣本株AD-1基因型為BVDV-1d。將所得序列使用MegaX64與Genbank中公布的36株BVDV基因序列進(jìn)行核苷酸、氨基酸同源性比較，結(jié)果顯示，5’-UTR測序結(jié)果的AD-1與所有參考毒株的同源性為70.8%～99.5%。與BVDV-1型的同源性為75.4%～99.5%，與BVDV-2型的參考株同源性為76.4%～77.9%，與BVDV-3型的參考株同源性為70.8%。樣本株AD-1的同源性最高同為北京株BJ1023(Genbank:KF925509）同源性為99.5%，其次是玉樹株Yushu2121(Genbank:KC414613）同源性為95.9%、寧夏株11Y59 (Genbank:JX437158）同源性為94.9%。從進(jìn)化樹上可以看出，與北京株BJ1023處于同一進(jìn)化分支。（圖2、圖3)圖3 BVDV 5’UTR基因核苷酸樹狀分析結(jié)果
BVDV 5’UTR基因核苷酸樹狀分析結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]吉林省西部地區(qū)牛新孢子蟲病流行病學(xué)調(diào)查[J]. 柴方紅,孫興忠,李航,謝素珠,張賀洋,賈立軍. 延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[2]牛病毒性腹瀉病毒研究進(jìn)展[J]. 邵紅,倪宏波. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報. 2017(06)
[3]血漿生物學(xué)指標(biāo)與TOAST分型各亞型的相關(guān)性[J]. 李平,仝秀清,楚洪波. 長春大學(xué)學(xué)報. 2016(02)
[4]牛病毒性腹瀉病毒基因Ⅱ型HLJ-10分離株全基因組克隆及其序列特征分析[J]. 劉華,付培芬,李巖,溫凱,賈瑩,劉曉玫,張海麗,商云鵬,高明春,馬波,張文龍,王君偉. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2012(01)
[5]豬瘟病毒石門強(qiáng)毒株和兔化弱毒疫苗株E2蛋白糖基化位點(diǎn)差異分析[J]. 彭伍平,夏照和,侯強(qiáng),李娜,孫元,童光志,仇華吉. 病毒學(xué)報. 2007(05)
[6]枯草芽孢桿菌與酵母培養(yǎng)物對奶牛產(chǎn)奶性能的影響研究[J]. 趙珺,黃玉珍. 長春大學(xué)學(xué)報. 2007(08)
[7]牛病毒性腹瀉病毒抗原捕獲ELISA檢測方法的標(biāo)準(zhǔn)化研究[J]. 鄧宇,王新華,郭燕,鐘發(fā)剛,沈敏. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2007(07)
[8]豬瘟病毒囊膜糖蛋白E2中和表位的定位及其免疫反應(yīng)性分析[J]. 張富強(qiáng),李志華,張念祖. 病毒學(xué)報. 2005(02)
[9]信使RNA三維遺傳信息的研究[J]. 劉次全. 中國科學(xué)基金. 1998(01)
[10]牛病毒性腹瀉－粘膜病病毒的分離鑒定[J]. 劉善藝,茹仙古麗. 中國畜禽傳染病. 1996(01)
博士論文
[1]牛病毒性腹瀉病毒誘導(dǎo)的細(xì)胞自噬對病毒感染影響機(jī)制研究[D]. 周玉龍.吉林大學(xué) 2017
碩士論文
[1]牛病毒性腹瀉病毒新疆流行株的分離鑒定及E2基因遺傳變異研究[D]. 王國超.石河子大學(xué) 2014
[2]我國牛病毒性腹瀉病毒E2基因的多態(tài)性分析[D]. 郎一飛.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
本文編號：3371848
【文章來源】：黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報. 2020,32(05)
【文章頁數(shù)】：10 頁
【部分圖文】：
5’UTR PCR結(jié)果
通過在BLAST對比結(jié)果顯示，樣本株AD-1基因型為BVDV-1d。將所得序列使用MegaX64與Genbank中公布的36株BVDV基因序列進(jìn)行核苷酸、氨基酸同源性比較，結(jié)果顯示，5’-UTR測序結(jié)果的AD-1與所有參考毒株的同源性為70.8%～99.5%。與BVDV-1型的同源性為75.4%～99.5%，與BVDV-2型的參考株同源性為76.4%～77.9%，與BVDV-3型的參考株同源性為70.8%。樣本株AD-1的同源性最高同為北京株BJ1023(Genbank:KF925509）同源性為99.5%，其次是玉樹株Yushu2121(Genbank:KC414613）同源性為95.9%、寧夏株11Y59 (Genbank:JX437158）同源性為94.9%。從進(jìn)化樹上可以看出，與北京株BJ1023處于同一進(jìn)化分支。（圖2、圖3)圖3 BVDV 5’UTR基因核苷酸樹狀分析結(jié)果
BVDV 5’UTR基因核苷酸樹狀分析結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]吉林省西部地區(qū)牛新孢子蟲病流行病學(xué)調(diào)查[J]. 柴方紅,孫興忠,李航,謝素珠,張賀洋,賈立軍. 延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[2]牛病毒性腹瀉病毒研究進(jìn)展[J]. 邵紅,倪宏波. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報. 2017(06)
[3]血漿生物學(xué)指標(biāo)與TOAST分型各亞型的相關(guān)性[J]. 李平,仝秀清,楚洪波. 長春大學(xué)學(xué)報. 2016(02)
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[5]豬瘟病毒石門強(qiáng)毒株和兔化弱毒疫苗株E2蛋白糖基化位點(diǎn)差異分析[J]. 彭伍平,夏照和,侯強(qiáng),李娜,孫元,童光志,仇華吉. 病毒學(xué)報. 2007(05)
[6]枯草芽孢桿菌與酵母培養(yǎng)物對奶牛產(chǎn)奶性能的影響研究[J]. 趙珺,黃玉珍. 長春大學(xué)學(xué)報. 2007(08)
[7]牛病毒性腹瀉病毒抗原捕獲ELISA檢測方法的標(biāo)準(zhǔn)化研究[J]. 鄧宇,王新華,郭燕,鐘發(fā)剛,沈敏. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2007(07)
[8]豬瘟病毒囊膜糖蛋白E2中和表位的定位及其免疫反應(yīng)性分析[J]. 張富強(qiáng),李志華,張念祖. 病毒學(xué)報. 2005(02)
[9]信使RNA三維遺傳信息的研究[J]. 劉次全. 中國科學(xué)基金. 1998(01)
[10]牛病毒性腹瀉－粘膜病病毒的分離鑒定[J]. 劉善藝,茹仙古麗. 中國畜禽傳染病. 1996(01)
博士論文
[1]牛病毒性腹瀉病毒誘導(dǎo)的細(xì)胞自噬對病毒感染影響機(jī)制研究[D]. 周玉龍.吉林大學(xué) 2017
碩士論文
[1]牛病毒性腹瀉病毒新疆流行株的分離鑒定及E2基因遺傳變異研究[D]. 王國超.石河子大學(xué) 2014
[2]我國牛病毒性腹瀉病毒E2基因的多態(tài)性分析[D]. 郎一飛.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
本文編號：3371848
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