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醉馬草DNA提取方法的對比與優(yōu)化

發(fā)布時間:2021-08-24 05:58
  醉馬草是一種多年生牧草,為禾本科芨芨草屬,常用于機場草坪建植和草原生態(tài)恢復(fù),因其重要的經(jīng)濟(jì)與生態(tài)價值近年來被廣泛研究關(guān)注。醉馬草幼苗含有的酚類、蛋白質(zhì)等雜質(zhì)嚴(yán)重影響DNA的提取質(zhì)量,常規(guī)技術(shù)不能很好地滿足高質(zhì)量的實驗要求。本實驗以醉馬草幼苗為材料,分別采用SDS、CTAB、高鹽法提取醉馬草幼苗全基因組DNA。研究發(fā)現(xiàn)使用SDS法提取的DNA濃度為176ng·μL-1,提取率為30%,A值為1.7。使用CTAB法提取的DNA濃度為140ng·μL-1,提取率為23%,A值為1.68。使用高鹽法提取的DNA濃度為37.7ng·μL-1,提取率為6%,A值為1.1。利用CTAB對提取出的DNA進(jìn)一步純化,用瓊脂糖凝膠電泳和超微量分光光度計檢測DNA的濃度和純度,通過PCR分析驗證優(yōu)化后CTAB法提取DNA的效果。結(jié)果表明各方法純化后的DNA濃度為:SDS法(223ng·μL-1)﹥CTAB法(219ng·μL-1)﹥高鹽法(77ng·μL-1); A值為:SDS法(1.8)>CTAB法(1.77)﹥高鹽法(1.4),其中DNA濃度較純化前分別提高27.1%(SDS法)、57.1%(高鹽... 

【文章來源】:草學(xué). 2020,(05)

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

醉馬草DNA提取方法的對比與優(yōu)化


三種方法提取全基因組PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的瓊脂凝膠分析

醉馬草,SDS法,瓊脂糖,凝膠電泳


從表2可以看出,以醉馬草鮮樣為原料進(jìn)行DNA提取,取同樣多的材料,加入同樣多的緩沖液,使用CTAB法提取的DNA濃度均為140ng·μL-1,使用高鹽法提取的DNA濃度為37.7ng·μL-1,而使用SDS法提取的DNA濃度為176ng·μL-1,因此可以看出SDS法和CTAB法的提取量遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于高鹽法。并且使用SDS法和CTAB法提取的DNA較少含有蛋白質(zhì)等小分子雜質(zhì),A值一般集中于1.7,其A值遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于實用高鹽法提取的DNA (A值多為1),由此表明使用SDS法和CTAB法提取DNA的純度較高。從圖1可以看出,由SDS法和CTAB法提取的DNA點樣孔清晰,條帶亮度相差不多,且無明顯拖尾,由此可以看出DNA提取的質(zhì)量較好;使用高鹽低p H法提取的DNA點樣孔有彌散現(xiàn)象,且條帶亮度較低,故使用此法提取的DNA質(zhì)量不理想。

醉馬草,試劑,瓊脂糖,凝膠電泳


從表3可以看出,以三種方法提取的DNA為材料,利用CTAB試劑進(jìn)行純化,純化后使用SDS法提取的DNA濃度提高為223ng·μL-1,使用CTAB法提取的DNA濃度提升為220ng·μL-1,而使用高鹽法提取的DNA濃度也升高為77ng·μL-1,與之前相比分別提高了27.1%(SDS法)、57.1%(CTAB法)、51.0%(高鹽法),因此可以看出使用CTAB試劑進(jìn)行DNA的純化效果較為明顯;而且,純化后的SDS法和CTAB法提取的DNA的A值集中于1.8,其A值遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于實用高鹽法提取的DNA (A值多為1.35),由此可以說明純化后的DNA濃度和純度較沒純化之前都有了相對的提升。通過圖2可以看出,純化過的SDS和CTAB提取的DNA從條帶的亮度和寬度有明顯的變化;而使用高鹽法提取的DNA經(jīng)過純化后質(zhì)量明顯提高,條帶亮度較之前亦有明顯提高。這說明利用CTAB試劑對DNA的純化是有效果的,且效果較為明顯。

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號:3359418

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