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新城疫病毒RNA適配體的篩選及活性研究

發(fā)布時(shí)間:2021-08-18 13:53
  新城疫病毒(Newcastle Disease Virus,NDV)屬于副黏病毒科,為單股、不分節(jié)段、有囊膜的負(fù)鏈RNA病毒。新城疫病毒F48E9株為標(biāo)準(zhǔn)強(qiáng)毒株,于1948年初次在中國(guó)分離,是我國(guó)特有的基因型。適配體是經(jīng)指數(shù)富集配體系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)(Systematic evolution of ligands byexponential enrichment,SELEX)從體外人工合成的寡核苷酸片段。在診斷治療檢測(cè)等方面已顯現(xiàn)出了巨甘的潛力,在本研究中,通過(guò)對(duì)篩選的RNA適配體特殊三維空間結(jié)構(gòu)分析,特異性和親和性分析,生物甘活性分析從而為抑制新城疫病毒與宿主之間的相互作用機(jī)制提供了材料。實(shí)驗(yàn)利用體外合成的方式構(gòu)建了總長(zhǎng)度為132bp的隨機(jī)寡核苷酸文庫(kù),其中兩端58個(gè)固定序列,中間74個(gè)隨機(jī)序列,在鑒定并純化靶病毒與靶蛋白的基礎(chǔ)上,利用硝酸纖維素膜過(guò)濾的SELEX方法經(jīng)過(guò)12輪的反復(fù)篩選,富集過(guò)程,最終獲得了針對(duì)F48E9株病毒和HN蛋白的富集文庫(kù)。最后一輪篩選的富集RNA文庫(kù)連接、轉(zhuǎn)化、克隆測(cè)序,經(jīng)DNAMAN軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行一級(jí)結(jié)構(gòu)分析和二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),選出針對(duì)F48E9株病毒的3個(gè)優(yōu)... 

【文章來(lái)源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省

【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

新城疫病毒RNA適配體的篩選及活性研究


SELEX篩選技術(shù)路線圖

蔗糖密度梯度離心法,病毒


蔗糖梯度離心純化結(jié)果

血凝試驗(yàn),鑒定結(jié)果,病毒,尿囊液


鑒定結(jié)果經(jīng)過(guò)的復(fù)合 RT-PCR 擴(kuò)增后,產(chǎn)物經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定結(jié)果如圖 1-2 F48E9 株病毒純化前后血凝試驗(yàn)結(jié)果A.F48E9 株病毒尿囊液;B.純化后 F48E9 株病毒。Fig.1-2 The results of hemagglutination test before and after purification F48E9A. F48E9 allantoic fluid; B. After purification F48E9.

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3350011

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