新城疫病毒RNA適配體的篩選及活性研究
發(fā)布時間:2021-08-18 13:53
新城疫病毒(Newcastle Disease Virus,NDV)屬于副黏病毒科,為單股、不分節(jié)段、有囊膜的負(fù)鏈RNA病毒。新城疫病毒F48E9株為標(biāo)準(zhǔn)強毒株,于1948年初次在中國分離,是我國特有的基因型。適配體是經(jīng)指數(shù)富集配體系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)(Systematic evolution of ligands byexponential enrichment,SELEX)從體外人工合成的寡核苷酸片段。在診斷治療檢測等方面已顯現(xiàn)出了巨甘的潛力,在本研究中,通過對篩選的RNA適配體特殊三維空間結(jié)構(gòu)分析,特異性和親和性分析,生物甘活性分析從而為抑制新城疫病毒與宿主之間的相互作用機制提供了材料。實驗利用體外合成的方式構(gòu)建了總長度為132bp的隨機寡核苷酸文庫,其中兩端58個固定序列,中間74個隨機序列,在鑒定并純化靶病毒與靶蛋白的基礎(chǔ)上,利用硝酸纖維素膜過濾的SELEX方法經(jīng)過12輪的反復(fù)篩選,富集過程,最終獲得了針對F48E9株病毒和HN蛋白的富集文庫。最后一輪篩選的富集RNA文庫連接、轉(zhuǎn)化、克隆測序,經(jīng)DNAMAN軟件對測序結(jié)果進(jìn)行一級結(jié)構(gòu)分析和二級結(jié)構(gòu)預(yù)測,選出針對F48E9株病毒的3個優(yōu)...
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
SELEX篩選技術(shù)路線圖
蔗糖梯度離心純化結(jié)果
鑒定結(jié)果經(jīng)過的復(fù)合 RT-PCR 擴增后,產(chǎn)物經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定結(jié)果如圖 1-2 F48E9 株病毒純化前后血凝試驗結(jié)果A.F48E9 株病毒尿囊液;B.純化后 F48E9 株病毒。Fig.1-2 The results of hemagglutination test before and after purification F48E9A. F48E9 allantoic fluid; B. After purification F48E9.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HIV-P24核酸適配體的篩選[J]. 張寧,毛愛紅,馬瑾,廖世奇,張麗瓊,王曉清,馬君. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2012(09)
[2]結(jié)核患者血清IgG抗體適體的制備及特異性鑒定[J]. 柏文娟,胡忠義,劉忠華,楊華,秦蓮花. 中國人獸共患病學(xué)報. 2011(12)
[3]基于核酸適體的丙肝病毒核心蛋白檢測新方法[J]. 張振,趙子龍,徐麗,吳新姣,朱海珍,譚蔚泓,方曉紅. 中國科學(xué):化學(xué). 2011(08)
[4]基于G-四聯(lián)體的納米探針比色檢測鉛離子[J]. 莫志宏,高應(yīng)梅,溫志渝,范艷萍. 高等學(xué);瘜W(xué)學(xué)報. 2010(11)
[5]Development of HBsAg-Binding Aptamers that bind HepG2.2.15 cells via HBV surface antigen[J]. Jia LIU 1 ,Yan YANG 2** ,Bin HU 1 ,Zhi-yong MA 1 ,Hong-ping HUANG 2 ,Yuan YU 2 , Shen-pei LIU 2 ,Meng-ji LU 3,4 and Dong-liang YANG 1,2 (1.Division of Clinical Immunology,Tongji Hospital,Tongji Medical College,Huazhong University of Science and Technology,Wuhan 430030,China;2.Experimental Medicine Center,Tongji Hospital,Tongji Medical College,Huazhong University of Science and Technology,Wuhan 430030,China;3.Department of Microbiology, Tongji Medical College,Huazhong University of Science and Technology,Wuhan 430030,China;4.Institute of Virology,Medical School of Duisburg-Essen University,Essen,45122,Germany). Virologica Sinica. 2010(01)
[6]高效薄層層析-病毒覆蓋結(jié)合法比較細(xì)胞表面神經(jīng)節(jié)苷脂與不同動物源性新城疫病毒結(jié)合特性[J]. 馮新,宋戰(zhàn)昀,韓文瑜,丁壯. 微生物學(xué)報. 2010(02)
[7]HIV-1抑制蛋白N-SRCR單克隆抗體的制備與鑒定[J]. 聶超,劉忠,賀欣,吳稚偉. 醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報. 2010(01)
[8]鵝源副黏病毒NA-1株反向遺傳操作體系的建立[J]. 孫玉章,丁壯,孟柯音,叢彥龍,母連志,王昌慶,李少麗. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2010(01)
[9]結(jié)核分枝桿菌ESAT-6抗原適體的篩選與親和性分析[J]. 馬占忠,秦蓮花,王玉炯,胡忠義. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2007(05)
[10]利用SELEX技術(shù)構(gòu)建靶向光敏藥物[J]. 許川山,Albert WING Nang Leung,楊青,曾霞波. 中國激光醫(yī)學(xué)雜志. 2006(06)
本文編號:3350011
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
SELEX篩選技術(shù)路線圖
蔗糖梯度離心純化結(jié)果
鑒定結(jié)果經(jīng)過的復(fù)合 RT-PCR 擴增后,產(chǎn)物經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定結(jié)果如圖 1-2 F48E9 株病毒純化前后血凝試驗結(jié)果A.F48E9 株病毒尿囊液;B.純化后 F48E9 株病毒。Fig.1-2 The results of hemagglutination test before and after purification F48E9A. F48E9 allantoic fluid; B. After purification F48E9.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HIV-P24核酸適配體的篩選[J]. 張寧,毛愛紅,馬瑾,廖世奇,張麗瓊,王曉清,馬君. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2012(09)
[2]結(jié)核患者血清IgG抗體適體的制備及特異性鑒定[J]. 柏文娟,胡忠義,劉忠華,楊華,秦蓮花. 中國人獸共患病學(xué)報. 2011(12)
[3]基于核酸適體的丙肝病毒核心蛋白檢測新方法[J]. 張振,趙子龍,徐麗,吳新姣,朱海珍,譚蔚泓,方曉紅. 中國科學(xué):化學(xué). 2011(08)
[4]基于G-四聯(lián)體的納米探針比色檢測鉛離子[J]. 莫志宏,高應(yīng)梅,溫志渝,范艷萍. 高等學(xué);瘜W(xué)學(xué)報. 2010(11)
[5]Development of HBsAg-Binding Aptamers that bind HepG2.2.15 cells via HBV surface antigen[J]. Jia LIU 1 ,Yan YANG 2** ,Bin HU 1 ,Zhi-yong MA 1 ,Hong-ping HUANG 2 ,Yuan YU 2 , Shen-pei LIU 2 ,Meng-ji LU 3,4 and Dong-liang YANG 1,2 (1.Division of Clinical Immunology,Tongji Hospital,Tongji Medical College,Huazhong University of Science and Technology,Wuhan 430030,China;2.Experimental Medicine Center,Tongji Hospital,Tongji Medical College,Huazhong University of Science and Technology,Wuhan 430030,China;3.Department of Microbiology, Tongji Medical College,Huazhong University of Science and Technology,Wuhan 430030,China;4.Institute of Virology,Medical School of Duisburg-Essen University,Essen,45122,Germany). Virologica Sinica. 2010(01)
[6]高效薄層層析-病毒覆蓋結(jié)合法比較細(xì)胞表面神經(jīng)節(jié)苷脂與不同動物源性新城疫病毒結(jié)合特性[J]. 馮新,宋戰(zhàn)昀,韓文瑜,丁壯. 微生物學(xué)報. 2010(02)
[7]HIV-1抑制蛋白N-SRCR單克隆抗體的制備與鑒定[J]. 聶超,劉忠,賀欣,吳稚偉. 醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報. 2010(01)
[8]鵝源副黏病毒NA-1株反向遺傳操作體系的建立[J]. 孫玉章,丁壯,孟柯音,叢彥龍,母連志,王昌慶,李少麗. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2010(01)
[9]結(jié)核分枝桿菌ESAT-6抗原適體的篩選與親和性分析[J]. 馬占忠,秦蓮花,王玉炯,胡忠義. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2007(05)
[10]利用SELEX技術(shù)構(gòu)建靶向光敏藥物[J]. 許川山,Albert WING Nang Leung,楊青,曾霞波. 中國激光醫(yī)學(xué)雜志. 2006(06)
本文編號:3350011
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