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新發(fā)血清4型禽腺病毒遺傳進化分析及細胞受體的鑒定

發(fā)布時間:2021-08-18 06:34
  2015年7月以來,心包積液-包涵體肝炎綜合征(HPS)在我國大部分家禽密集養(yǎng)殖地區(qū)大規(guī)模爆發(fā)流行并迅速蔓延,給我國家禽養(yǎng)殖業(yè)帶來了巨大的經(jīng)濟損失。針對新發(fā)疫情,本研究從HPS蛋雞肝臟組織中分離1株高致病性HLJFAd15毒株并鑒定其為FAdV-4。HLJFAd15全基因組分析發(fā)現(xiàn)HLJFAd15存在ORF19、ORF27的大片段天然缺失,與我國近期分離鑒定的高致病性毒株一致,被定義為新基因型FAdV-4。我們利用HLJFAd15毒株成功建立了新發(fā)FAdV-4的SPF雞攻毒感染模型,其口服接種和肌肉注射接種的致死率分別達到76.9%和100%,同時能夠很好的復(fù)制臨床心包積液和包涵體肝炎的癥狀。SPF雞動物感染模型的成功建立對我國新發(fā)FAdV-4疫苗的研發(fā)和致病機制研究具有重要意義。鑒于目前為止尚沒有鴨源FAdV-4的全基因組序列,我們分離鑒定了 1株鴨源FAdV-4毒株HLJDAd15,并對該毒株進行了全基因組序列測定,上傳GenBank第1株鴨源FAdV-4的全基因組序列,豐富了 FAdV-4基因組的多樣性,為FAdV-4診斷靶標的選擇提供了參考。HLJDAd15致病性實驗顯示我國新... 

【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學院北京市

【文章頁數(shù)】:81 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

新發(fā)血清4型禽腺病毒遺傳進化分析及細胞受體的鑒定


圖2-1肝臟DNA進行PCR擴增結(jié)果??

序列,序列分析,毒株


中國農(nóng)業(yè)科學院博士后出站報告?第二章新發(fā)血清4型禽腺病毒遺傳進化分析??M?1?+?-??2.〇〇〇^?MHa??i,〇,?g—??^PT?4^561?bo??5〇〇^?WmmSm?F??25〇^?immi??i」??圖2-1肝臟DNA進行PCR擴增結(jié)果??M:?DL2,000;?1:?HLJFAdl5;?+:陽性對照;陰性對照??Fig.?2-1?PCR?results?of?DNA?sample?of?liver??M:?DL2,000;?1:?HLJFAdl5;?+:?positive?control;?negative?control??2.3.1.2HLJFAdl5?的?hexon?序歹丨J分析??HLJFAdl5毒株鑒定為FAdV-4之后,設(shè)計針對FAdV-4的hexon序列的特??異性引物,擴增其全長hexon序列并進行序列分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)HLJFAdl5毒株與??我國流行JSJ13毒株高度同源(圖2-2)。??1QOr?764?(JN112373}?FAdv^??一t?HG?(GU734104)??-100J?A-2A(AF083975)?fAdv^??L??HBQ12?(KM096545)??43??340?(NC?021221}?FAdv-B??.!〇n??CELO?(U46933)?fa<jv-a??9T???HLJFAd15??cl?JSJ13(KM098544)??1〇〇?KC(EU177545)??—?PB-05(EU931691)?FAdv^??100?100?PK-01?(EU931693)??97????KR5?(HE6C?152)

序列,序列分析,缺失,毒株


.3?HLJFAdl5?的?hexon?序歹IJ分析??通過hexon全長序列比對,確定HUFAdl5毒株為FAdV-4,鑒于HLJFAdl5??毒株與JSJ13毒株高度同源,我們根據(jù)JSJ13毒株的序列(GenBank序列號:??KM096544)設(shè)計了?36對引物,擴增了?HUFAdl5毒株的全基因組序列,并上傳??至GenBank?(序列號:KU991797)。通過全基因組序列分析發(fā)現(xiàn),HLJFAdl5毒??株的基因組在ORF42和ORF43之間存在1966bp的大片段天然缺失(圖2-3),??證實為我國新發(fā)的FAdV-4毒株。??29464?35413}???37378p^§:?40115??一—???、.:丨丨丨.:^:?I??????丨..?:..::.;??(HE608152)?處?ORf22?0??27?ORF28??.?酬A??畛??ONI?0W<2?ORT29??(GU188428)???JSJ13??(KM096544)?1?_??—???■■??HB1510??(KU587519)???一一?—??29482?35427?35428?38164???""??????I。?—?—?f88088?*???in?.JJUUU??HLJFAdl5?靈麵??(KU991797)?參?oww?c?m??u?納峰??X?L?|?G叫?I?|???0?2000?4000?6000?8000?10000??圖2-3?HUFAdl?5的1966?bp缺失序列分析??Fig

【參考文獻】:
期刊論文
[1]Ⅰ亞群禽腺病毒通用PCR檢測方法的建立及應(yīng)用[J]. 肖躍強,于雪,劉吉山,楊慧,苗立中,徐晴晴,何誠,沈志強.  中國預(yù)防獸醫(yī)學報. 2018(03)
[2]雞馬立克氏病強弱病毒株P(guān)CR鑒別檢測方法在診斷中的應(yīng)用評價[J]. 呂紅超,張艷萍,孫國榮,高玉龍,李志杰,鄭惠文,包珂巖,王笑梅,劉長軍.  中國預(yù)防獸醫(yī)學報. 2016(07)
[3]Ⅰ群禽腺病毒SYBR GreenⅠ熒光PCR檢測方法的建立[J]. 文艷玲,謝芝勛,王瑩,謝麗基.  中國獸醫(yī)科學. 2008(09)
[4]禽腺病毒江蘇分離株的細胞培養(yǎng)特性[J]. 周斌,鄭其升,劉華雷,曹瑞兵,陳溥言.  南京農(nóng)業(yè)大學學報. 2005(02)

碩士論文
[1]禽腺病毒血清4型巢式PCR和環(huán)介導(dǎo)等溫擴增檢測方法建立及應(yīng)用[D]. 鐘鳴.東北農(nóng)業(yè)大學 2019



本文編號:3349388

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