新疆羊種布魯氏菌分離株的鑒定與L7/L12蛋白的原核表達和生物信息學分析
發(fā)布時間:2021-08-11 05:49
【目的】分離并鑒定新疆羊種布魯氏菌。原核表達該菌的L7/L12蛋白,檢測該蛋白的反應原性及進行部分生物學分析!痉椒ā坎捎眉毦鷦澗培養(yǎng)、形態(tài)學觀察、PCR檢測以及生化試驗進行布魯氏菌分離鑒定。利用常規(guī)分子生物學方法表達并純化羊種布魯氏菌分離株的L7/L12蛋白,應用Western Blot分析融合蛋白的反應原性。使用生物信息學軟件對該蛋白進行了生物信息學分析!窘Y(jié)果】分離鑒定確定該菌株為羊種布魯氏菌。經(jīng)過測序與酶切鑒定,正確構(gòu)建了表達載體p ET-28a-L7/L12.SDS-PAGE試驗顯示純化的L7/L12蛋白為單一條帶;經(jīng)過Western Blot檢測,該融合蛋白具有良好的反應原性。生物信息學分析顯示,該蛋白無跨膜區(qū)結(jié)構(gòu),不存在信號肽,二級結(jié)構(gòu)α-螺旋為主并利用Phyre2服務器成功構(gòu)建了該蛋白的三維模型!窘Y(jié)論】鑒定出該分離菌株,表達并純化了該菌的L7/L12融合蛋白,Western Blot證明該蛋白具有良好的反應原性,為后續(xù)該蛋白的亞單位疫苗研究奠定了基礎(chǔ)。
【文章來源】:新疆農(nóng)業(yè)科學. 2017,54(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
7/L12基因的擴增
晰,雜帶較少,說明純化效果較好(圖5b)。圖52.7重組蛋白L7/L12的反應原性檢測將純化后的重組蛋白L7/L12轉(zhuǎn)至NC膜,采用羊布魯菌陽性血清作為一抗,HRP標記的兔抗羊抗體為二抗進行免疫印跡分析。WesternBlot結(jié)果顯示在19ku的位置上有一條明顯的特異性反應條帶,表明融合蛋白能被抗布魯氏菌的綿羊血清所識別,且目的蛋白具有良好的反應原性,與理論分析相符合。圖61-2:純化后的L7/L12蛋白;M:蛋白MarkerSDS-PAGEa-nalysistheeffectofpurifiedL7/L12fusionprotein1-2:thepurifiedL7/L12protein;M:ProteinMarker圖5SDS-PAGE電泳檢測L7/L12融合蛋白純化效果Fig.5SDS-PAGEanalysistheeffectofpurifiedL7/L12fusionprotein1-3:純化的His-L7/L12融合蛋白;M:蛋白Marker1-3:thepurifiedHis-L7/L12fusionprotein;M:ProteinMarker圖6融合蛋白His-L7/L12WesternBlot分析Fig.6TheWesternBlotanalysisoffusionproteinHis-L7/L122.8目的蛋白的生物信息學通過TMHMMServerv.2.0在線軟件分析得568
3期劉升等:新疆羊種布魯氏菌分離株的鑒定與L7/L12蛋白的原核表達和生物信息學分析出,目的蛋白無跨膜螺旋結(jié)構(gòu)(圖7)。SignalP4.1Server對該蛋白氨基酸序列分析顯示,該蛋白有信號肽(圖8)。利用SOPMA在線軟件分析該蛋白的二級結(jié)構(gòu),結(jié)果顯示,85個氨基酸參與形成α-螺旋,占68.55%。延伸鏈占8.87%,有13個氨基酸參與形成β-折疊,占10.48%,無規(guī)卷曲結(jié)構(gòu)占12.10%(圖9)。通過Phyre2在線服務器構(gòu)建出并優(yōu)化目的蛋白的三維結(jié)構(gòu)(圖10)。利用PDBsumGenerate在線評估(圖11)。從Ra-machandran圖中可以看出,在121個氨基酸殘基中,有98個處于核心允許區(qū),占92.5%,6個處于額外允許區(qū),占5.7%,1個處于最大允許區(qū),占0.9%,不可信區(qū)域為1,占0.9%。這說明該模型具有一定的可信度。圖7~11圖7TMHMMServerv.2.0預測L7/L12蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域Fig.7ThepredictionoftransmembranedomainofL7/L12proteinbyTMHMMServerv.2.0圖8SignalP4.1Server預測L7/L12蛋白信號肽Fig.8ThepredictionofsignalpeptideofL7/L12proteinbySignalP4.1Server569
【參考文獻】:
期刊論文
[1]新疆動物布魯氏菌病現(xiàn)狀分析[J]. 閆晶華,李金平,米吉提,地里夏提,閆昊. 新疆畜牧業(yè). 2011(10)
[2]新疆布魯氏菌病疫情現(xiàn)狀與防治對策[J]. 任德坤,常青,師茂林,李凡卡. 地方病通報. 2008(05)
[3]中國布魯氏菌病疫情監(jiān)測與控制[J]. 崔步云. 疾病監(jiān)測. 2007(10)
[4]布魯氏菌病再度肆虐及其原因[J]. 尚德秋. 中國地方病防治雜志. 2001(01)
博士論文
[1]流產(chǎn)布魯氏菌Omp25與L7/L12促巨噬細胞凋亡的分子機制[D]. 曹滌非.東北農(nóng)業(yè)大學 2012
本文編號:3335582
【文章來源】:新疆農(nóng)業(yè)科學. 2017,54(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
7/L12基因的擴增
晰,雜帶較少,說明純化效果較好(圖5b)。圖52.7重組蛋白L7/L12的反應原性檢測將純化后的重組蛋白L7/L12轉(zhuǎn)至NC膜,采用羊布魯菌陽性血清作為一抗,HRP標記的兔抗羊抗體為二抗進行免疫印跡分析。WesternBlot結(jié)果顯示在19ku的位置上有一條明顯的特異性反應條帶,表明融合蛋白能被抗布魯氏菌的綿羊血清所識別,且目的蛋白具有良好的反應原性,與理論分析相符合。圖61-2:純化后的L7/L12蛋白;M:蛋白MarkerSDS-PAGEa-nalysistheeffectofpurifiedL7/L12fusionprotein1-2:thepurifiedL7/L12protein;M:ProteinMarker圖5SDS-PAGE電泳檢測L7/L12融合蛋白純化效果Fig.5SDS-PAGEanalysistheeffectofpurifiedL7/L12fusionprotein1-3:純化的His-L7/L12融合蛋白;M:蛋白Marker1-3:thepurifiedHis-L7/L12fusionprotein;M:ProteinMarker圖6融合蛋白His-L7/L12WesternBlot分析Fig.6TheWesternBlotanalysisoffusionproteinHis-L7/L122.8目的蛋白的生物信息學通過TMHMMServerv.2.0在線軟件分析得568
3期劉升等:新疆羊種布魯氏菌分離株的鑒定與L7/L12蛋白的原核表達和生物信息學分析出,目的蛋白無跨膜螺旋結(jié)構(gòu)(圖7)。SignalP4.1Server對該蛋白氨基酸序列分析顯示,該蛋白有信號肽(圖8)。利用SOPMA在線軟件分析該蛋白的二級結(jié)構(gòu),結(jié)果顯示,85個氨基酸參與形成α-螺旋,占68.55%。延伸鏈占8.87%,有13個氨基酸參與形成β-折疊,占10.48%,無規(guī)卷曲結(jié)構(gòu)占12.10%(圖9)。通過Phyre2在線服務器構(gòu)建出并優(yōu)化目的蛋白的三維結(jié)構(gòu)(圖10)。利用PDBsumGenerate在線評估(圖11)。從Ra-machandran圖中可以看出,在121個氨基酸殘基中,有98個處于核心允許區(qū),占92.5%,6個處于額外允許區(qū),占5.7%,1個處于最大允許區(qū),占0.9%,不可信區(qū)域為1,占0.9%。這說明該模型具有一定的可信度。圖7~11圖7TMHMMServerv.2.0預測L7/L12蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域Fig.7ThepredictionoftransmembranedomainofL7/L12proteinbyTMHMMServerv.2.0圖8SignalP4.1Server預測L7/L12蛋白信號肽Fig.8ThepredictionofsignalpeptideofL7/L12proteinbySignalP4.1Server569
【參考文獻】:
期刊論文
[1]新疆動物布魯氏菌病現(xiàn)狀分析[J]. 閆晶華,李金平,米吉提,地里夏提,閆昊. 新疆畜牧業(yè). 2011(10)
[2]新疆布魯氏菌病疫情現(xiàn)狀與防治對策[J]. 任德坤,常青,師茂林,李凡卡. 地方病通報. 2008(05)
[3]中國布魯氏菌病疫情監(jiān)測與控制[J]. 崔步云. 疾病監(jiān)測. 2007(10)
[4]布魯氏菌病再度肆虐及其原因[J]. 尚德秋. 中國地方病防治雜志. 2001(01)
博士論文
[1]流產(chǎn)布魯氏菌Omp25與L7/L12促巨噬細胞凋亡的分子機制[D]. 曹滌非.東北農(nóng)業(yè)大學 2012
本文編號:3335582
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