豬RXRB和MYOM1基因組織表達(dá)量及其遺傳進(jìn)化分析
發(fā)布時(shí)間:2021-08-10 01:20
通過對(duì)長白山野豬和東北民豬數(shù)字基因表達(dá)譜文庫的篩選,本課題組發(fā)現(xiàn)有20多個(gè)基因與肌纖維的發(fā)育以及肉質(zhì)有關(guān)。本實(shí)驗(yàn)此次選取候選基因RXRB和MYOM-1,以東北民豬(♀♂)、長白山野豬(♀♂)為材料進(jìn)行組織差異表達(dá)分析、單核苷酸多態(tài)性分析和遺傳結(jié)構(gòu)分析。為進(jìn)一步了解這些基因在肌纖維發(fā)育過程中和對(duì)豬肉質(zhì)的作用及調(diào)控機(jī)制,進(jìn)而開展改善豬肌肉性狀和屠宰性狀的遺傳學(xué)研究提供科學(xué)依據(jù)。研究結(jié)果顯示,兩個(gè)基因的表達(dá)量在同品種不同性別組織間、同性別不同品種組織間,同品種同性別不同組織間均存在廣泛的差異性。其中RXRB基因在四種豬的肌肉組織表達(dá)量普遍高于非肌肉組織,表明RXRB基因可能與豬的肌纖維發(fā)育及特性存在密切聯(lián)系。RXRB基因在四個(gè)品種豬中均有多個(gè)組織不表達(dá),由此可見RXRB基因在各組織間表達(dá)存在時(shí)空特異性,楊國偉等試驗(yàn)表明該基因在組織中的表達(dá)存在明顯的時(shí)間和空間變化,與本實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致。MYOM-1基因在四種豬的各組織間呈現(xiàn)無規(guī)律變化,通過對(duì)MYOM-1基因單核苷酸多態(tài)性與肌纖維性狀和屠宰性狀間的關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)不同基因型的豬肌纖維性狀和屠宰性狀沒有顯著的差異性(P>0.05),MYOM-1基...
【文章來源】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)吉林省
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
第一章 前言
1.1 豬肌纖維的研究進(jìn)展
1.2 本研究的意義
第二章 長白山野豬和東北民豬 RXRB 基因 mRNA 組織表達(dá)特性分析
2.1 RXRB 基因的作用機(jī)制及研究進(jìn)展
2.2 研究材料和方法
2.2.1 試驗(yàn)動(dòng)物
2.2.2 試驗(yàn)試劑和儀器
2.2.3 試驗(yàn)方法
2.2.3.1 RNA 的提取與濃度測(cè)定
2.2.3.2 cDNA 的獲得與檢測(cè)
2.2.3.3 引物設(shè)計(jì)
2.2.3.4 PCR 條件的建立
2.2.3.5 PCR 產(chǎn)物的凝膠電泳分析
2.2.3.6 數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 總 RNA 提取結(jié)果
2.3.2 兩種豬不同組織中 RXRB 基因 mRNA 表達(dá)結(jié)果
2.3.3 四種豬各組織 RXRB 基因 mRNA 表達(dá)量相互比較
2.4 討論
第三章 長白山野豬和東北民豬 MYOM-1 基因 mRNA 組織表達(dá)及單核苷酸多態(tài)性分析與屠宰性狀、肌纖維性狀間的關(guān)聯(lián)分析
3.1 MYOM-1 基因的作用機(jī)制及研究進(jìn)展
3.2 長白山野豬和東北民豬 MYOM1 基因 mRNA 組織表達(dá)特性分析
3.2.1 試驗(yàn)動(dòng)物
3.2.2 試驗(yàn)試劑和儀器
3.2.3 試驗(yàn)方法
3.2.3.1 RNA 的提取與濃度測(cè)定
3.2.3.2 cDNA 的獲得與檢測(cè)
3.2.3.3 引物設(shè)計(jì)
3.2.3.4 PCR 條件的建立
3.2.3.5 PCR 產(chǎn)物的凝膠電泳分析
3.2.4 結(jié)果與分析
3.2.4.1 總 RNA 提取
3.2.4.2 兩種豬不同組織中 MYOM-1 基因 mRNA 表達(dá)結(jié)果
3.2.4.3 四種豬各組織 MYOM-1 基因 mRNA 表達(dá)量相互比較
3.3 MYOM-1 基因單核苷酸多態(tài)性與肌纖維性狀和屠宰性狀間的關(guān)聯(lián)分析
3.3.1 試驗(yàn)樣品與生產(chǎn)性狀資料
3.3.1.1 試驗(yàn)東北民豬豬群建立
3.3.1.2 屠宰性狀記錄
3.3.1.3 血液樣本采集
3.3.2 東北民豬背最長肌肌纖維密度測(cè)定
3.3.3 利用 PCR-SSCP 對(duì)各樣本中的 MYOM-1 基因進(jìn)行分型
3.3.3.1 主要儀器設(shè)備
3.3.3.2 試劑藥品
3.3.3.3 主要試劑的配制方法
3.3.3.4 實(shí)驗(yàn)方法
3.3.3.5 結(jié)果與分析
3.4 討論
第四章 RXRB 基因和 MYOM-1 基因物種間同源性和物種進(jìn)化情況分析
4.1 豬 RXRB 基因和 MYOM-1 基因遺傳進(jìn)化與系統(tǒng)發(fā)生分析研究進(jìn)展
4.2 研究材料和方法
4.2.1 研究材料
4.2.2 研究方法
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 使用 MEGA6.0 軟件構(gòu)建進(jìn)化樹
4.3.2 遺傳進(jìn)化分析
4.3.2.1 等位基因間的系統(tǒng)發(fā)生分析
4.3.2.2 系統(tǒng)發(fā)生分析中出現(xiàn)的問題及原因分析
4.3.2.3 各物種內(nèi)和物種間的遺傳變異程度對(duì)物種結(jié)構(gòu)及多樣性的影響
4.3.2.4 從系統(tǒng)發(fā)生方面分析 RXRB 基因和 MYOM-1基因與物種生理功能間的關(guān)系
4.4 結(jié)論
第五章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
作者簡介
致謝
本文編號(hào):3333166
【文章來源】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)吉林省
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
第一章 前言
1.1 豬肌纖維的研究進(jìn)展
1.2 本研究的意義
第二章 長白山野豬和東北民豬 RXRB 基因 mRNA 組織表達(dá)特性分析
2.1 RXRB 基因的作用機(jī)制及研究進(jìn)展
2.2 研究材料和方法
2.2.1 試驗(yàn)動(dòng)物
2.2.2 試驗(yàn)試劑和儀器
2.2.3 試驗(yàn)方法
2.2.3.1 RNA 的提取與濃度測(cè)定
2.2.3.2 cDNA 的獲得與檢測(cè)
2.2.3.3 引物設(shè)計(jì)
2.2.3.4 PCR 條件的建立
2.2.3.5 PCR 產(chǎn)物的凝膠電泳分析
2.2.3.6 數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 總 RNA 提取結(jié)果
2.3.2 兩種豬不同組織中 RXRB 基因 mRNA 表達(dá)結(jié)果
2.3.3 四種豬各組織 RXRB 基因 mRNA 表達(dá)量相互比較
2.4 討論
第三章 長白山野豬和東北民豬 MYOM-1 基因 mRNA 組織表達(dá)及單核苷酸多態(tài)性分析與屠宰性狀、肌纖維性狀間的關(guān)聯(lián)分析
3.1 MYOM-1 基因的作用機(jī)制及研究進(jìn)展
3.2 長白山野豬和東北民豬 MYOM1 基因 mRNA 組織表達(dá)特性分析
3.2.1 試驗(yàn)動(dòng)物
3.2.2 試驗(yàn)試劑和儀器
3.2.3 試驗(yàn)方法
3.2.3.1 RNA 的提取與濃度測(cè)定
3.2.3.2 cDNA 的獲得與檢測(cè)
3.2.3.3 引物設(shè)計(jì)
3.2.3.4 PCR 條件的建立
3.2.3.5 PCR 產(chǎn)物的凝膠電泳分析
3.2.4 結(jié)果與分析
3.2.4.1 總 RNA 提取
3.2.4.2 兩種豬不同組織中 MYOM-1 基因 mRNA 表達(dá)結(jié)果
3.2.4.3 四種豬各組織 MYOM-1 基因 mRNA 表達(dá)量相互比較
3.3 MYOM-1 基因單核苷酸多態(tài)性與肌纖維性狀和屠宰性狀間的關(guān)聯(lián)分析
3.3.1 試驗(yàn)樣品與生產(chǎn)性狀資料
3.3.1.1 試驗(yàn)東北民豬豬群建立
3.3.1.2 屠宰性狀記錄
3.3.1.3 血液樣本采集
3.3.2 東北民豬背最長肌肌纖維密度測(cè)定
3.3.3 利用 PCR-SSCP 對(duì)各樣本中的 MYOM-1 基因進(jìn)行分型
3.3.3.1 主要儀器設(shè)備
3.3.3.2 試劑藥品
3.3.3.3 主要試劑的配制方法
3.3.3.4 實(shí)驗(yàn)方法
3.3.3.5 結(jié)果與分析
3.4 討論
第四章 RXRB 基因和 MYOM-1 基因物種間同源性和物種進(jìn)化情況分析
4.1 豬 RXRB 基因和 MYOM-1 基因遺傳進(jìn)化與系統(tǒng)發(fā)生分析研究進(jìn)展
4.2 研究材料和方法
4.2.1 研究材料
4.2.2 研究方法
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 使用 MEGA6.0 軟件構(gòu)建進(jìn)化樹
4.3.2 遺傳進(jìn)化分析
4.3.2.1 等位基因間的系統(tǒng)發(fā)生分析
4.3.2.2 系統(tǒng)發(fā)生分析中出現(xiàn)的問題及原因分析
4.3.2.3 各物種內(nèi)和物種間的遺傳變異程度對(duì)物種結(jié)構(gòu)及多樣性的影響
4.3.2.4 從系統(tǒng)發(fā)生方面分析 RXRB 基因和 MYOM-1基因與物種生理功能間的關(guān)系
4.4 結(jié)論
第五章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
作者簡介
致謝
本文編號(hào):3333166
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