4株新城疫病毒株的分離與鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-08-06 13:37
對近三年采集的213份臨床樣品進(jìn)行了新城疫病毒的分離與鑒定,得到4株NDV分離株,其中3株來源于雞,1株來源于鴨。通過RT-PCR方法對毒株的F和HN基因進(jìn)行了擴(kuò)增與序列測定,與Gen Bank中的NDV序列進(jìn)行了同源性和遺傳進(jìn)化分析,并測定了其致病指數(shù)。結(jié)果顯示:HB0601和HB0804株為強(qiáng)毒株,屬于基因Ⅶb亞型,其F基因與Chicken-Jiangxi-07-2009同源性最高,為99.5%和99.7%,與La Sota株的同源性為82%。SC1805和HB1906為弱毒株,屬于基因Ⅰ型,其F基因與Chicken-Colombia-1326-14475-2009同源性最高,分別為99.8%和99.9%,與La Sota株的同源性為89%。4株NDV分離株與傳統(tǒng)疫苗株的遺傳進(jìn)化關(guān)系較遠(yuǎn)。研究為ND的防控及分子流行病學(xué)研究提供了數(shù)據(jù)支撐。
【文章來源】:中國家禽. 2020,42(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
新城疫病毒分離株與其它參考株的F基因遺傳進(jìn)化樹
2016~2019年,共采集來自湖北武漢、湖北襄陽、四川內(nèi)江等地的臨床樣品213份,包括健康雞(食欲旺盛、精神充沛)的泄殖腔拭子172份,發(fā)病雞/鴨(精神萎靡、站立不穩(wěn))的組織樣品41份。通過雞胚培養(yǎng)與分離、HA效價(jià)測定、NDV和AIV的HI效價(jià)測定,初步分離出新城疫病毒4株,其背景信息見表1。進(jìn)一步采用NDV F和HN基因的特異性引物,對4株NDV進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增。結(jié)果如圖1所示,均擴(kuò)增出了與預(yù)期大小基本一致的PCR片段,對其序列進(jìn)行測定并做BLAST分析。結(jié)果表明HB0601和HB0804株屬基因Ⅱ群Ⅶ型,SC1805和HB1906屬Ⅱ群Ⅰ型。2.2 新城疫病毒分離株的生物學(xué)特性鑒定
【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]HN蛋白的來源和長度對新城疫病毒生物學(xué)特性的影響[D]. 靳繼惠.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]基因Ⅶ型NDV強(qiáng)毒株反向遺傳系統(tǒng)的建立及其應(yīng)用研究[D]. 劉蒙蒙.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]2008-2013年華東地區(qū)新城疫病毒分子流行病學(xué)及HN基因E347K變異對病毒抗原性的影響[D]. 朱杰.揚(yáng)州大學(xué) 2015
[4]新城疫分離株P(guān)和HN基因分子進(jìn)化與致病性的相關(guān)研究[D]. 梁俊文.山東師范大學(xué) 2010
[5]新城疫病毒流行株致病性和抗原性及其與F和HN基因變異的相關(guān)性[D]. 秦卓明.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]抗體免疫選擇壓作用下新城疫病毒HN基因和F基因的演化及其抗原性的比較分析[D]. 何羽婷.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]中國部分地區(qū)2010~2012年新城疫病毒分子流行病學(xué)研究[D]. 趙晨辰.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
本文編號:3325872
【文章來源】:中國家禽. 2020,42(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
新城疫病毒分離株與其它參考株的F基因遺傳進(jìn)化樹
2016~2019年,共采集來自湖北武漢、湖北襄陽、四川內(nèi)江等地的臨床樣品213份,包括健康雞(食欲旺盛、精神充沛)的泄殖腔拭子172份,發(fā)病雞/鴨(精神萎靡、站立不穩(wěn))的組織樣品41份。通過雞胚培養(yǎng)與分離、HA效價(jià)測定、NDV和AIV的HI效價(jià)測定,初步分離出新城疫病毒4株,其背景信息見表1。進(jìn)一步采用NDV F和HN基因的特異性引物,對4株NDV進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增。結(jié)果如圖1所示,均擴(kuò)增出了與預(yù)期大小基本一致的PCR片段,對其序列進(jìn)行測定并做BLAST分析。結(jié)果表明HB0601和HB0804株屬基因Ⅱ群Ⅶ型,SC1805和HB1906屬Ⅱ群Ⅰ型。2.2 新城疫病毒分離株的生物學(xué)特性鑒定
【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]HN蛋白的來源和長度對新城疫病毒生物學(xué)特性的影響[D]. 靳繼惠.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]基因Ⅶ型NDV強(qiáng)毒株反向遺傳系統(tǒng)的建立及其應(yīng)用研究[D]. 劉蒙蒙.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]2008-2013年華東地區(qū)新城疫病毒分子流行病學(xué)及HN基因E347K變異對病毒抗原性的影響[D]. 朱杰.揚(yáng)州大學(xué) 2015
[4]新城疫分離株P(guān)和HN基因分子進(jìn)化與致病性的相關(guān)研究[D]. 梁俊文.山東師范大學(xué) 2010
[5]新城疫病毒流行株致病性和抗原性及其與F和HN基因變異的相關(guān)性[D]. 秦卓明.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]抗體免疫選擇壓作用下新城疫病毒HN基因和F基因的演化及其抗原性的比較分析[D]. 何羽婷.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]中國部分地區(qū)2010~2012年新城疫病毒分子流行病學(xué)研究[D]. 趙晨辰.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
本文編號:3325872
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