赤水烏骨雞是貴州省優(yōu)良地方雞種,具有黑羽、烏骨兩個主要特征,但生產(chǎn)中發(fā)現(xiàn)其烏度在個體間的變異度較大,為了探討造成赤水烏骨雞烏度變異的分子機理,本研究以赤水烏骨雞為研究對象,泰和烏雞為對照,采用PCR直接測序技術(shù)篩選赤水烏骨雞MC1R、TYR和MITF基因啟動子區(qū)和外顯子區(qū)SNPs位點,并與不同組織中黑色素相關(guān)物質(zhì)含量進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析。同時利用熒光定量PCR技術(shù)分析了MC1R、TYR、MITF基因在不同品種不同組織中表達(dá)情況。研究主要結(jié)果如下:1.MC1R、TYR和MITF基因SNPs篩選對MC1R、TYR和MITF基因啟動子區(qū)和外顯子區(qū)共設(shè)計了24對引物,經(jīng)PCR擴增測序共發(fā)現(xiàn)赤水烏骨雞MC1R基因SNPs 16個（其中啟動子區(qū)12個,外顯子區(qū)4個）;泰和烏雞23個（其中啟動子區(qū)15個,外顯子區(qū)8個）;赤水烏骨雞TYR基因SNPs 7個（其中啟動子區(qū)2個,內(nèi)含子5個）;泰和烏雞6個（其中啟動子區(qū)2個,外顯子區(qū)2個,內(nèi)含子2個）;赤水烏骨雞MITF基因SNPs位點18個（其中啟動子區(qū)2個,外顯子區(qū)1個,內(nèi)含子15個）;泰和烏雞21個（其中啟動子區(qū)2個,外顯子區(qū)1個,內(nèi)含子18個）。2.赤水... 

【文章來源】：貴州大學(xué)貴州省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：153 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

MC1R基因啟動子區(qū)預(yù)測

圖 2-3 MC1R 基因核心啟動子區(qū)預(yù)測（Promoter 2.0）-3 MC1R gene core promoter region prediction（Promoter 2.0）物：MC1R 基因（GenBank：NM_001031462.1）通測軟件進(jìn)行預(yù)測，Promoter SCAN 和 Neural Netw測的區(qū)域相同，其引物為 MC1Ra，Promoter 2.0 軟C1Rb；TYR 基因（GenBank：XM_015279812.2）和_015292966.2）基因核心啟動子區(qū)參照劉小輝（201物詳細(xì)信息見表 2-4：表 2-3 啟動子在線預(yù)測軟件Tab. 2-3 Promoter online prediction software件 網(wǎng)站ter 2.0 http://www.cbs.dtu.dk/index.er SCAN http://www-bimas.cit.nih.gov/indromoter Prediction http://www.fruitfly.org/seq_tools/pr表 2-4 MC1R、TYR 及 MITF 基因核心啟動子引物信息-4 MC1R, TYR and MITF gene core promoter primer informatio

貴州大學(xué) 2019 屆碩士研究生學(xué)位論文T-PCR 反應(yīng)體系見表 2-10，RT-PCR 反應(yīng)程序見圖 2-4。表 2-10 MC1R、TYR、MITF 基因 RT-PCR 反應(yīng)體系Tab. 2-10 MC1R, TYR, MITF gene RT-PCR reaction system試劑 體積/μLSYBR SELECT MASTER MIX 5ddH2O /μL 2.5c DNA 模板/μL 1上、下游引物/μL 0.75Total 10


本文編號：3320969