長鏈非編碼RNA（long non-coding RNAs, lncRNAs）是一類長度>200 nt的非編碼RNA,在多種生物學(xué)過程中發(fā)揮重要調(diào)控作用。近年來研究表明,lncRNAs可被病毒誘導(dǎo)表達(dá),其作為一類新型的調(diào)控因子介導(dǎo)宿主與病毒相互作用,通過病原識別受體,以不同機(jī)制激活或抑制天然免疫應(yīng)答反饋病毒感染。本文闡述了lncRNAs介導(dǎo)病毒與宿主相互作用中的調(diào)控機(jī)制,歸納了它們在宿主抗病毒天然免疫應(yīng)答過程中的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),以期為研究lncRNAs在抗病毒中的作用提供參考,為揭示病毒的致病機(jī)制和發(fā)現(xiàn)新的抗病毒靶標(biāo)奠定基礎(chǔ)。 

【文章來源】：畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2020,51(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

LncRNA機(jī)制的4種原型的示意圖[22]

當(dāng)病毒入侵宿主后,一方面誘導(dǎo)宿主lncRNAs的差異性轉(zhuǎn)錄,另一方面與PRR結(jié)合,啟動PRR信號級聯(lián)反應(yīng),活化下游免疫相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄,誘導(dǎo)IFN等細(xì)胞因子的表達(dá)。IFN等抗病毒細(xì)胞因子分泌到細(xì)胞內(nèi)外,與其受體(IFNR)結(jié)合激活JAK-STAT信號通路,誘導(dǎo)一系列ISGs表達(dá),這些ISGs直接或間接發(fā)揮IFN的抗病毒和免疫調(diào)節(jié)功能[40],從而為機(jī)體建立起抗病毒感染的第一道防線(圖2)。IFN應(yīng)答過程包括PRR激活、IFN產(chǎn)生和ISGs表達(dá)等,已有的研究表明,lncRNAs可在不同環(huán)節(jié)調(diào)控IFN介導(dǎo)天然免疫應(yīng)答[7]。lnc-Lsm3b是一種源于宿主自身的lncRNA,可被IFN誘導(dǎo)表達(dá),它與病毒RNA競爭結(jié)合RIG-I,是免疫應(yīng)答晚期的負(fù)反饋調(diào)控因子。RIG-I的分子包含C端CTD結(jié)構(gòu)域和N端的CARDs、DECH解旋酶結(jié)構(gòu)域,病毒未感染時RIG-I分子以自身抑制狀態(tài)存在,其中CARD2結(jié)構(gòu)域與DECH解旋酶結(jié)構(gòu)域的插入?yún)^(qū)結(jié)合,而當(dāng)RNA病毒入侵后,病毒的5′三磷酸雙鏈與CTD結(jié)構(gòu)域結(jié)合,改變RIG-I結(jié)構(gòu)并釋放CARDs結(jié)構(gòu)域,介導(dǎo)下游信號傳遞與免疫應(yīng)答。曹雪濤課題組利用免疫共沉淀(IP)獲取與RIG-I結(jié)合的RNA,將拉下來的所有RNA進(jìn)行RNA-seq測序發(fā)現(xiàn),當(dāng)使用水皰性口炎病毒(vesi-cular stomatitis virus, VSV)刺激后,目的lnc-Lsm3b表達(dá)量明顯增加。然后,構(gòu)建lnc-Lsm3b缺陷小鼠進(jìn)行體外刺激和體內(nèi)感染VSV,發(fā)現(xiàn)lnc-Lsm3b缺陷后,IFN表達(dá)量顯著升高,表明lnc-Lsm3b抑制機(jī)體抗病毒過程。然后,利用紫外交聯(lián)免疫共沉淀測序技術(shù)(CLIP-seq)發(fā)現(xiàn),lnc-Lsm3b與RIG-I結(jié)合并改變其空間構(gòu)象,使RIG-I無法識別RNA,導(dǎo)致IFN產(chǎn)生減少。同時,lnc-Lsm3b在RNA病毒感染的巨噬細(xì)胞內(nèi)可抑制RIG-I介導(dǎo)的免疫應(yīng)答,阻抑IFN與抗炎因子的產(chǎn)生,抗病毒信號受到抑制[41]。Lin等[9]通過對VSV全轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)Lnczc3 h7a能夠分別結(jié)合TRIM25和RIG-I,并以腳手架的方式促進(jìn)TRIM25和RIG-I的結(jié)合,增強(qiáng)TRIM25對RIG-I的K63泛素化,從而正向調(diào)控RIG-I介導(dǎo)的信號通路和抗病毒天然免疫反應(yīng)。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Analysis of Expression Profiles of Long Noncoding RNAs and mRNAs in A549 Cells Infected with H3N2 Swine Influenza Virus by RNA Sequencing[J]. Yina Zhang,Tianqi Yu,Yingnan Ding,Yahui Li,Jing Lei,Boli Hu,Jiyong Zhou.  Virologica Sinica. 2020(02)



本文編號：3319073