為揭示野生綠頭鴨視黃酸誘導(dǎo)基因Ⅰ（Retinoic acid-inducible geneⅠ,RIG-Ⅰ）的分子特征及其在體內(nèi)的表達分布規(guī)律,對野生綠頭鴨RIG-Ⅰ（MdRIG-Ⅰ）基因的CDS序列進行了克隆和序列分析,并應(yīng)用熒光定量PCR方法對RIG-Ⅰ基因在綠頭鴨不同組織中的表達水平進行了測定。結(jié)果顯示:MdRIG-Ⅰ基因的CDS序列全長2 802 bp,編碼933個氨基酸,與哺乳動物和魚類的RIG-Ⅰ基因同源率較低,為43.7%～46.7%與52.2%～54.9%;與鳥類的RIG-Ⅰ基因同源率較高,為78.7%～99.8%;與番鴨和紹興麻鴨的RIG-Ⅰ基因同源率為98.3%和99.8%,有較強的種間特異性;MdRIG-Ⅰ基因mRNA在體內(nèi)不同器官的表達量均高于SPF鴨（紹興麻鴨）,且不同組織表達量各不相同:在肝臟中表達水平最高,其次是腸,在心和脾表達呈中等水平,在肺和腎表達呈低等水平。研究結(jié)果揭示了RIG-Ⅰ通路在鴨科動物抗病毒中的作用及其分子機制,為水禽先天性免疫研究奠定良好的基礎(chǔ)。 

【文章來源】：中國家禽. 2020,42(11)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

SMART預(yù)測MdRIG-Ⅰ的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域簡圖

將MdRIG-Ⅰ氨基酸序列與SPF鴨RIG-Ⅰ氨基酸序列用DNAstar Megalign進行比對，發(fā)現(xiàn)存在2個差異位點，分別是第4位和617位氨基酸殘基（見圖3）。2.5 標準曲線的建立

RIG-Ⅰ基因作為先天性免疫系統(tǒng)的重要組成部分，在機體抵抗病毒的過程中起著重要作用。本研究克隆了MdRIG-Ⅰ基因的CDS序列，生物信息學分析顯示，MdRIG-Ⅰ基因的CDS序列全長2 802 bp，由933個氨基酸組成，SMART預(yù)測顯示具有典型的RIG-Ⅰ蛋白結(jié)構(gòu)，N端為2個串聯(lián)半胱天冬氨酸激活招募區(qū)、中間為DExD/H解旋酶區(qū)、C端為抑制區(qū)。本研究中MdRIG-Ⅰ氨基酸序列與鳥類同源性為78.7%～99.8%，與哺乳類同源性為52.2%～54.9%，與魚類同源性為43.7%～46.7%，有較強的種間特異性，與Kowalinski等[8]研究結(jié)果一致。本研究發(fā)現(xiàn)綠頭鴨MdRIG-Ⅰ氨基酸序列與紹興麻鴨同源性更近，為99.8%。野生綠頭鴨和SPF鴨存在差異的位點為第4位和617位氨基酸殘基。根據(jù)王同淑等[6]的研究結(jié)果，MdRIG-Ⅰ蛋白突變的位點包含在α-螺旋重合區(qū)域中，但對親水性、柔韌性、抗原表位等蛋白質(zhì)特性均無影響，具有較強的種間特異性，這表明環(huán)境因素可能是影響野生綠頭鴨和SPF鴨抗AIV能力存在差異的主要原因。3.2 MdRIG-Ⅰ熒光定量分析

【參考文獻】：
期刊論文
[1]北京鴨RIG-I基因的克隆及其生物信息學分析[J]. 王同淑,李傳峰,陳宗艷,孟春春,吳潤,劉光清.  浙江農(nóng)業(yè)學報. 2015(05)
[2]鴨RIG-1基因的PCR擴增及其序列分析[J]. 程玉強,焦培榮,韋良孟,鐘自富,廖順娣,袁潤余,賈寶琴,羅開健,廖明.  動物醫(yī)學進展. 2012(06)
[3]雞β-actin基因?qū)崟r熒光定量PCR方法的建立[J]. 馬莉,謝秀蘭,岳華.  中國畜牧獸醫(yī). 2007(02)



本文編號：3314556