脾臟是家禽重要的免疫器官。本研究選取70日齡純系公母雞各150只,利用重測序技術(shù)獲取基因組高密度SNP信息,通過全基因組關(guān)聯(lián)分析（genome-wide association study, GWAS）挖掘影響解析青腳麻雞配套系父本純系（L系）脾臟重和脾臟率的相關(guān)候選基因。研究發(fā)現(xiàn),脾臟重和脾臟率的遺傳力分別為0.28和0.32,脾臟率較脾臟重有更大的變異�；趩巫兞炕旌暇�性模型,利用質(zhì)控后的7 882 695個高質(zhì)量位點進行全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)7和9個SNP位點分別與脾臟重和脾臟率顯著相關(guān),位于1、2、4、10和26號染色體。對顯著SNP位點進行注釋,共篩選到MTMR2、CEP57、IL16和LGR6等11個可能與脾臟發(fā)育有關(guān)的候選基因。 

【文章來源】：畜牧與獸醫(yī). 2020,52(04)北大核心

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

SNP密度分布及PCA圖

表4 與脾臟重和脾臟率顯著相關(guān)的SNP位點信息 性狀 染色體 物理位置 p_value P 候選基因 CPV/% 脾臟重 1 186878278 2.52E-09 0.020 MTMR2 1.28 1 186883019 2.03E-09 0.016 CEP57 2.01 1 186883108 3.4E-10 0.003 DEUP1 1.13 1 186886393 4.84E-09 0.038 HEPHL1 1.02 2 98469678 4.35E-09 0.034 PP4R1 1.26 10 12566389 5.11E-09 0.040 IL16 2.17 26 694641 2.26E-09 0.018 LGR6、PHLDA3 2.06 脾臟率 1 186878278 3.11E-09 0.024 MTMR2 1.26 1 186883019 2.77E-09 0.022 CEP57 2.03 1 186883108 5.12E-10 0.004 DEUP1 1.06 1 186886393 5.44E-09 0.043 HEPHL1 0.98 2 98469678 3.77E-09 0.030 PP4R1 2.12 4 19542133 4.87E-09 0.038 TRIM2 1.24 4 19542329 5.69E-09 0.045 SLITRK2 1.46 4 19542525 2.00E-09 0.016 MND1 1.38 26 694641 3.52E-09 0.028 LGR6、PHLDA3 2.12 注:P為矯正后的P值,P<0.05表示顯著差異; CPV為SNP位點對表型方差的解釋率3 討論

【參考文獻】：
期刊論文
[1]復(fù)方中草藥對青腳麻雞脾臟發(fā)育、抗氧化性及細胞增殖凋亡的影響[J]. 熊憲獻,劉婷,楊云龍,孫啟,金光明,靳二輝.  安徽科技學(xué)院學(xué)報. 2019(02)
[2]雞脾臟重全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 沈曼曼,曲亮,竇套存,馬猛,郭軍,盧建,胡玉萍,李永峰,王克華.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(06)
[3]介紹兩個優(yōu)良雞品種[J]. 李銀化.  農(nóng)村百事通. 2017(17)
[4]雞胸腺重和脾臟重性狀的全基因組關(guān)聯(lián)[J]. 張磊,鄭麥青,劉冉冉,文杰,吳丹,胡耀東,孫艷發(fā),李鵬,劉麗,趙桂蘋.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(15)
[5]中國北京油雞和引進白來航蛋雞免疫性狀的比較[J]. 吳春梅,趙桂蘋,文杰,陳繼蘭,鄭麥青,陳國宏.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2007(12)



本文編號：3313380