流行性出血病病毒（Epizootic haemorrhagic disease virus,EHDV）是一種嚴重危害反芻動物的蟲媒病毒,全世界已發(fā)現(xiàn)9種血清型EHDV,長久以來我國EHDV血清型分布、病毒活動規(guī)律和病毒遺傳特征不明確,對我國的畜牧業(yè)進出口和牛羊養(yǎng)殖業(yè)構成了潛在威脅。本文首次報道了2013～2016年在云南省與廣西壯族自治區(qū)設立的哨兵動物中,9株EHDV-5型毒株的分離以及病毒基因節(jié)段2、3與6（Seg-2、Seg-3、Seg-6）的序列特征。中國分離的9株EHDV-5型毒株Seg-2,Seg-3與Seg-6及其編碼蛋白之間高度保守,核酸與氨基酸序列相似度均大于99%,在系統(tǒng)發(fā)生樹上聚為緊密的一簇,表明我國云南與廣西流行的EHDV-5有著最近的共有祖先。中國與澳大利亞EHDV-5毒株不同基因節(jié)段之間也有著較高的序列相似度（>91%）,表明兩地流行EHDV-5型毒株有著共同的起源。中國毒株的Seg-2與Seg-6在系統(tǒng)發(fā)生樹上雖與澳大利亞毒株（CSIRO 157）聚為一簇,但最終形成了獨立的進化分支,表明中國流行的EHDV-5發(fā)生了獨立的進化。本研究首先豐富了世界范圍... 

【文章來源】：病毒學報. 2020,36(03)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

基于最大似然法的流行性出血病病毒（EHDV)Seg-2序列的系統(tǒng)發(fā)育分析

EHDV的VP3蛋白序列高度保守，但其編碼的Seg‐3基因在不同地域分離毒株之間存在較大差異，體現(xiàn)出強烈的地域性特征[12]。我國分離9株EHDV‐5型毒株的Seg‐3核酸序列相似度為（99.26±0.5)%,VP3氨基酸序列相似度為（99.75±0.2）%。構建的EHDV Seg‐3系統(tǒng)發(fā)生樹顯示，中國EHDV‐5型毒株與分離自日本、澳大利亞的不同血清型EHDV毒株均屬于“Eastern”型（圖2),Seg‐3序列相似度為（94.21±2.2)%,VP3序列相似度為（99.38±0.4）%。中國毒株與分離自中東地區(qū)、非洲與北美洲等“Western”型毒株遺傳關系較遠，Seg‐3序列相似度僅為（79.70±0.3)%,VP3序列相似度僅為（96.62±0.3）%。4 EHDV-5型毒株Seg-6基因節(jié)段分析

Seg‐6編碼的VP5蛋白對同為病毒外殼蛋白的VP2構象存在一定影響，從而也影響著EHDV血清型特異性抗體的產(chǎn)生，根據(jù)不同血清型Seg‐6核酸序列的差異也可將EHDV分為A、B、C和D四個群[11]。我國分離9株EHDV‐5型毒株的Seg‐6核酸序列相似度為（98.92±0.8)%,VP5氨基酸序列相似度為（99.68±0.3）%。與在Seg‐2分析中觀察到的情況一致，中國與澳大利亞EHDV‐5型毒株的Seg‐6在系統(tǒng)發(fā)生樹上形成一個獨立分支，與EHDV‐4型毒株共同構成D群（Group D），在系統(tǒng)發(fā)生樹上中國EHDV‐5型毒株也構成了單獨的一個“中國支系”（圖4），與EHDV‐4型毒株Seg‐6核酸序列相似度為（72.08±0.8)%,VP5氨基酸序列相似度為（86.61±0.2）%；與澳大利亞EHDV‐5型毒株的Seg‐6核酸序列相似度為（93.49±0.2)%,VP5氨基酸序列相似度為（99.0±0.2）%。討論


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