豬呼吸繁殖綜合癥（Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS）是由豬呼吸繁殖綜合癥病毒（PRRSV）感染引起的,是豬群發(fā)生以繁殖障礙和呼吸系統(tǒng)癥狀為特征的一種急性、高度傳染的病毒性傳染病。研究表明,PRRSV的黏附與唾液黏附素Siglec-1（Sn,又名CD163）分子的唾液酸部分有重要關(guān)系。GP2是PRRSV的次要結(jié)構(gòu)蛋白之一,CD163是PRRSV的第二個(gè)受體基因。CD163是清道夫受體（SRCR）超家族成員之一,富含半胱氨酸,由吞噬細(xì)胞表達(dá),僅在單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞系統(tǒng)細(xì)胞膜上發(fā)現(xiàn)的跨膜分子。參與多種免疫活動(dòng),對正常生理具有意義,同時(shí)與某些疾病發(fā)展密切相關(guān)。豬繁殖與呼吸綜合征（Porcine Reproductive and Respiration Syndrome,PRRSV）主要特征為各個(gè)年齡段豬呼吸道癥狀和妊娠母豬繁殖障礙的病毒性傳染疾病,嚴(yán)重危害養(yǎng)豬業(yè)�；蚪M中有六種結(jié)構(gòu)蛋白基因由ORF2、ORF3、ORF4、ORF5、ORF6、ORF7編碼蛋白的GP2、GP3、GP4、GP5、M蛋白和N蛋白,GP2為次要結(jié)構(gòu)蛋白,... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：44 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第1章 前言
    1.1 繁殖與呼吸綜合征
    1.2 同源模建與分子對接
第2章 PRRSV糖基化蛋白GP3與CD169同源模建及相互作用模擬
    2.1 GP3蛋白和CD169蛋白
    2.2 計(jì)算方法
        2.2.1 蛋白的一級序列及晶體模型搜索
        2.2.2 序列比對
        2.2.3 同源模建
        2.2.4 模型評估
        2.2.5 模型優(yōu)化
        2.2.6 蛋白大分子對接
        2.2.7 尋找活性位點(diǎn)
        2.2.8 小分子對接及藥物小分子篩選
    2.3 結(jié)果與討論
        2.3.1 序列比對
        2.3.2 同源模建
        2.3.3 模型優(yōu)化
        2.3.4 模型評估
        2.3.5 蛋白大分子對接
        2.3.6 尋找蛋白合體的活性位點(diǎn)及分析
        2.3.7 小分子對接及藥物小分子庫篩選
    2.4 結(jié)論
第3章 PRRSV糖基化蛋白GP2與CD163同源模建及相互作用模擬
    3.1 GP2蛋白和CD163蛋白
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 下載晶體模型
        3.2.2 序列比對
        3.2.3 同源模建
        3.2.4 模型評估
        3.2.5 模型優(yōu)化
        3.2.6 蛋白-蛋白對接
        3.2.7 尋找活性位點(diǎn)
        3.2.8 藥物小分子篩選及對接
            3.2.8.1 藥物小分子篩選
            3.2.8.2 小分子對接
    3.3 結(jié)果與討論
        3.3.1 下載晶體模型
        3.3.2 序列比對
        3.3.3 同源模建
        3.3.4 模型評估
            3.3.4.1 拉氏圖法分析
            3.3.4.2 Profiles-3D評估
        3.3.5 蛋白-蛋白大分子對接
        3.3.6 尋找蛋白合體的活性位點(diǎn)及小分子藥物對接分析
        3.3.7 小分子藥物篩選
    3.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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