副豬嗜血桿菌種特異性基因的篩選及PCR診斷方法的建立
發(fā)布時(shí)間:2021-07-20 17:15
副豬嗜血桿菌(Haemophilus parasuis, Hps)是革拉瑟氏病的致病菌,屬于巴斯德菌科家族成員之一,可引發(fā)豬多發(fā)性漿膜炎和關(guān)節(jié)炎。常感染早期斷奶仔豬,甚至能從健康豬的上呼吸道分離出。Hps常與其它病原菌發(fā)生并發(fā)或繼發(fā)感染,死亡率高,致使全世界范圍內(nèi)養(yǎng)豬行業(yè)經(jīng)濟(jì)損失嚴(yán)重?梢酝ㄟ^(guò)抗生素治療和接種疫苗在一定程度上來(lái)預(yù)防和控制革拉瑟氏病的發(fā)生。然而,防控本病的關(guān)鍵是先對(duì)病原體進(jìn)行鑒別診斷。找到Hps種屬特異性基因并以此為靶基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,是準(zhǔn)確、快速診斷Hps的關(guān)鍵。抑制消減雜交(suppression subtractive hybridization.SSH)是一項(xiàng)應(yīng)用于篩選原核生物或真核生物差異基因及差異表達(dá)基因的有效途徑,應(yīng)用廣泛,近年來(lái)可用于比較兩種親緣性相近的菌株基因組之間的差異。本實(shí)驗(yàn)以副豬嗜血桿菌(Hps)血清5型參考菌株Nagasaki和與之親緣性相近的豬胸膜肺炎放線桿菌(App)血清1型參考菌株Shope4074作為研究對(duì)象,通過(guò)抑制消減雜交(SSH)技術(shù)篩選Hps相對(duì)于App的差異基因。分別提取Hps和App基因組DNA,得到完好的核酸條帶。經(jīng)Alu...
【文章來(lái)源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:53 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略表
1 引言
1.1 副豬嗜血桿菌研究現(xiàn)狀
1.1.1 病原學(xué)
1.1.2 流行病學(xué)與分型
1.1.3 致病機(jī)理與毒力因子
1.1.4 病理變化
1.1.5 診斷
1.1.6 防治
1.2 抑制消減雜交
1.2.1 抑制消減雜交技術(shù)的原理
1.2.2 抑制消減雜交技術(shù)的特點(diǎn)
1.2.3 抑制消減雜交技術(shù)的應(yīng)用
1.3 本試驗(yàn)研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 菌種及載體
2.1.2 主要試劑
2.1.3 培養(yǎng)基配制
2.1.4 Southern blot溶液配制
2.1.5 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 細(xì)菌純培養(yǎng)及基因組DNA的提取
2.2.2 抑制消減雜交(SSH)
2.2.3 差異片斷的克隆
2.2.4 Southern blot分析
2.2.5 差異片段序列測(cè)定與分析
2.2.6 副豬嗜血桿菌PCR診斷方法的建立
3 結(jié)果與分析
3.1 基因組DNA提取
3.2 酶切
3.3 Hps基因組DNA接頭連接效率分析
3.4 抑制消減雜交結(jié)果及效率分析
3.5 差異片斷克隆的篩選
3.6 Southern blot分析
3.7 差異基因同源性分析
3.8 PCR診斷方法的建立
3.8.1 PCR特異性分析
3.8.2 PCR敏感性分析
3.8.3 臨床樣品的檢測(cè)
4 討論
4.1 基因組DNA質(zhì)量
4.2 抑制消減雜交技術(shù)在細(xì)菌差異基因篩選中的應(yīng)用
4.3 抑制消減雜交技術(shù)的影響因素
4.4 Southern blot分析
4.5 PCR診斷方法的建立
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]三聚體自轉(zhuǎn)運(yùn)粘附素研究進(jìn)展[J]. 劉金葉,馮娟,徐力文,蘇友祿,郭志勛. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2012(04)
[2]應(yīng)用抑制性差減雜交篩選副豬嗜血桿菌4型菌株可能毒力基因[J]. 李淼,李春玲,宋帥,楊冬霞. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2012(01)
[3]抑制消減雜交技術(shù)篩選鵝產(chǎn)蛋期差異表達(dá)基因[J]. 郭軍,章雙杰,鄒劍敏,陸火林,蘇建東,湯青萍. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(08)
[4]長(zhǎng)角血蜱雄蜱抑制消減雜交cDNA文庫(kù)的構(gòu)建與分析[J]. 劉建剛,劉光遠(yuǎn),田占成,謝俊仁,龔真莉,張麗艷. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2009(08)
[5]副豬嗜血桿菌抗體間接ELISA檢測(cè)方法的建立與應(yīng)用[J]. 馮小明,儲(chǔ)岳峰,賀英,高鵬程,趙萍,郭晗,樊祜卿,逯忠新. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2009(07)
[6]抑制性消減雜交技術(shù)分析豬鏈球菌2型毒力相關(guān)基因[J]. 齊翀,劉軍,祝令偉,王文東,孟福強(qiáng),馮書章. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2009(05)
[7]副豬嗜血桿菌血清5型間接血凝試驗(yàn)和間接ELISA抗體檢測(cè)方法的建立[J]. 石碧,崔耀文,賈凡,金卉,萬(wàn)云,蔡旭旺,方剛,陳煥春,周銳. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2007(11)
[8]豬胸膜肺炎放線桿菌血清7型抑制消減雜交文庫(kù)的構(gòu)建和分析[J]. 王勇,劉思國(guó),王春來(lái),宮強(qiáng),劉建東,劉慧芳,周媛媛,常月紅,云孟克,李廣興. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2007(07)
[9]雞白痢沙門菌基因組差異片段的篩選與分析[J]. 徐耀輝,焦新安,李求春,潘志明,黃金林. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2007(07)
[10]副豬嗜血桿菌病研究進(jìn)展[J]. 華升,梅書棋,曾德芳,徐滌平,李勇. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2006(11)
博士論文
[1]副豬嗜血桿菌的分離鑒定及診斷方法與滅活疫苗的研究[D]. 蔡旭旺.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
本文編號(hào):3293246
【文章來(lái)源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:53 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略表
1 引言
1.1 副豬嗜血桿菌研究現(xiàn)狀
1.1.1 病原學(xué)
1.1.2 流行病學(xué)與分型
1.1.3 致病機(jī)理與毒力因子
1.1.4 病理變化
1.1.5 診斷
1.1.6 防治
1.2 抑制消減雜交
1.2.1 抑制消減雜交技術(shù)的原理
1.2.2 抑制消減雜交技術(shù)的特點(diǎn)
1.2.3 抑制消減雜交技術(shù)的應(yīng)用
1.3 本試驗(yàn)研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 菌種及載體
2.1.2 主要試劑
2.1.3 培養(yǎng)基配制
2.1.4 Southern blot溶液配制
2.1.5 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 細(xì)菌純培養(yǎng)及基因組DNA的提取
2.2.2 抑制消減雜交(SSH)
2.2.3 差異片斷的克隆
2.2.4 Southern blot分析
2.2.5 差異片段序列測(cè)定與分析
2.2.6 副豬嗜血桿菌PCR診斷方法的建立
3 結(jié)果與分析
3.1 基因組DNA提取
3.2 酶切
3.3 Hps基因組DNA接頭連接效率分析
3.4 抑制消減雜交結(jié)果及效率分析
3.5 差異片斷克隆的篩選
3.6 Southern blot分析
3.7 差異基因同源性分析
3.8 PCR診斷方法的建立
3.8.1 PCR特異性分析
3.8.2 PCR敏感性分析
3.8.3 臨床樣品的檢測(cè)
4 討論
4.1 基因組DNA質(zhì)量
4.2 抑制消減雜交技術(shù)在細(xì)菌差異基因篩選中的應(yīng)用
4.3 抑制消減雜交技術(shù)的影響因素
4.4 Southern blot分析
4.5 PCR診斷方法的建立
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]三聚體自轉(zhuǎn)運(yùn)粘附素研究進(jìn)展[J]. 劉金葉,馮娟,徐力文,蘇友祿,郭志勛. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2012(04)
[2]應(yīng)用抑制性差減雜交篩選副豬嗜血桿菌4型菌株可能毒力基因[J]. 李淼,李春玲,宋帥,楊冬霞. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2012(01)
[3]抑制消減雜交技術(shù)篩選鵝產(chǎn)蛋期差異表達(dá)基因[J]. 郭軍,章雙杰,鄒劍敏,陸火林,蘇建東,湯青萍. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(08)
[4]長(zhǎng)角血蜱雄蜱抑制消減雜交cDNA文庫(kù)的構(gòu)建與分析[J]. 劉建剛,劉光遠(yuǎn),田占成,謝俊仁,龔真莉,張麗艷. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2009(08)
[5]副豬嗜血桿菌抗體間接ELISA檢測(cè)方法的建立與應(yīng)用[J]. 馮小明,儲(chǔ)岳峰,賀英,高鵬程,趙萍,郭晗,樊祜卿,逯忠新. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2009(07)
[6]抑制性消減雜交技術(shù)分析豬鏈球菌2型毒力相關(guān)基因[J]. 齊翀,劉軍,祝令偉,王文東,孟福強(qiáng),馮書章. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2009(05)
[7]副豬嗜血桿菌血清5型間接血凝試驗(yàn)和間接ELISA抗體檢測(cè)方法的建立[J]. 石碧,崔耀文,賈凡,金卉,萬(wàn)云,蔡旭旺,方剛,陳煥春,周銳. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2007(11)
[8]豬胸膜肺炎放線桿菌血清7型抑制消減雜交文庫(kù)的構(gòu)建和分析[J]. 王勇,劉思國(guó),王春來(lái),宮強(qiáng),劉建東,劉慧芳,周媛媛,常月紅,云孟克,李廣興. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2007(07)
[9]雞白痢沙門菌基因組差異片段的篩選與分析[J]. 徐耀輝,焦新安,李求春,潘志明,黃金林. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2007(07)
[10]副豬嗜血桿菌病研究進(jìn)展[J]. 華升,梅書棋,曾德芳,徐滌平,李勇. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2006(11)
博士論文
[1]副豬嗜血桿菌的分離鑒定及診斷方法與滅活疫苗的研究[D]. 蔡旭旺.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
本文編號(hào):3293246
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3293246.html
最近更新
教材專著