為分析地方雞種北京油雞保種群的遺傳多樣性和遺傳進(jìn)化機(jī)制,本研究對北京油雞和其他20個不同品種雞進(jìn)行簡化基因組測序,鑒定其SNP標(biāo)記,計算遺傳統(tǒng)計量,分析北京油雞的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性,篩選受到強(qiáng)烈選擇的前200個基因并進(jìn)行功能注釋分析。結(jié)果顯示:北京油雞保種群體共鑒定出295 849個SNP標(biāo)記,核苷酸多樣度為0.205 9、保種群體的平均觀察雜合度為0.200 4、近交系數(shù)為0.026 5,在21個品種中近交水平最低;連鎖不平衡分析表明北京油雞群體各等位基因不存在連鎖不平衡現(xiàn)象;利用MEGA模型進(jìn)行聚類分析,結(jié)果表明北京油雞形成一個獨立的分支,這與北京油雞的歷史背景相符;通過GO和KEGG對前200個受到強(qiáng)烈選擇的基因進(jìn)行功能注釋分析,發(fā)現(xiàn)這些差異基因主要富集在細(xì)胞形態(tài)發(fā)生分化、分泌系統(tǒng)、脈管系統(tǒng)、心血管系統(tǒng)、蛋白質(zhì)磷酸化等信號通路。本研究從分子水平對北京油雞的種質(zhì)特性進(jìn)行了評價,為北京油雞的品種保護(hù)及開發(fā)利用提供了分子理論依據(jù)。 

【文章來源】：中國畜牧雜志. 2020,56(06)北大核心

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

受選擇基因的GO注釋分類統(tǒng)計

群體結(jié)構(gòu)聚類圖

通過數(shù)據(jù)質(zhì)控，在北京油雞群體中鑒定出SNP標(biāo)記295 849個。由圖1可知，這些SNP主要分布在1、2、3、4、5和Z染色體上�？傮w上講，SNP分布數(shù)量與染色體長度呈正相關(guān)。2.2 群體遺傳多樣性分析

【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
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碩士論文
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本文編號：3289717