大尾寒羊保種群分子系譜的構(gòu)建及遺傳結(jié)構(gòu)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-17 11:04
系譜記錄是明確個(gè)體間親緣關(guān)系,以個(gè)體選擇為主的現(xiàn)代育種實(shí)踐,是動(dòng)物遺傳育種的重要信息來(lái)源。然而,隨著社會(huì)經(jīng)濟(jì)的不斷發(fā)展,人類對(duì)高產(chǎn)的盲目追求,加上大量高產(chǎn)外來(lái)品種的引進(jìn),導(dǎo)致大尾寒羊品種受到了前所未有的破壞,存欄量逐年下降。目前,在山東省內(nèi)建立大尾寒羊國(guó)家級(jí)保種群已迫在眉睫。由于大尾寒羊個(gè)體來(lái)源復(fù)雜,原保種群管理不嚴(yán)格,存在分子系譜不清楚,遺傳結(jié)構(gòu)不清晰等問(wèn)題,為保護(hù)大尾寒羊遺傳資源,需通過(guò)分子手段了解大尾寒羊個(gè)體間的親子關(guān)系,構(gòu)建分子系譜,識(shí)別雜交個(gè)體,制定育種計(jì)劃。本研究對(duì)大尾寒羊保種群145只個(gè)體為材料,選取25個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),預(yù)實(shí)驗(yàn)采用40只個(gè)體進(jìn)行混池檢測(cè),篩選了15個(gè)多態(tài)性較高的微衛(wèi)星位點(diǎn),用于親權(quán)鑒定和分子系譜構(gòu)建。Cervus3.0進(jìn)行親子關(guān)系分析,例如:雜合度(H)、多態(tài)性信息含量(PIC)、給定候選親本與子代基因型,排除候選親本的概率(NE-1P)、給定已知親本基因型、候選親本基因型和子代基因型,排除候選親本的概率(NE-2P)和多個(gè)位點(diǎn)的累積排除概率(CEP),以及Hardy-Weinberg平衡檢測(cè)。用Pedigraph3.0軟件,繪制具有復(fù)雜近交系結(jié)構(gòu)的家系系譜...
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:76 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
大尾寒羊血液基因組DNA提取凝膠電泳圖,M:DL2000DNAMarkerFigure1GelelectrophoresismapofbloodgenomicDNAofLargeTailedHanSheep,M:DL2000DNAMarker
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文21結(jié)果用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),使用凝膠成像系統(tǒng)觀察并拍照,檢測(cè)產(chǎn)物有無(wú)擴(kuò)增出,部分微衛(wèi)星標(biāo)記的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),見(jiàn)圖2,圖3,圖4,圖5。Marker為100-3000bp的marker。通過(guò)瓊脂糖電泳檢測(cè)結(jié)果可以看出,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖條帶清晰,效果較好,擴(kuò)增的片段長(zhǎng)度與目的長(zhǎng)度吻合,可以用來(lái)進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。圖2基因座BMS574的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖3基因座OarFCB20的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure2PCRamplificationofBMS574Figure3PCRamplificationofOarFCB20圖4基因座BMS1248的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖5基因座MB023的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure4PCRamplificationofBMS1248Figure5PCRamplificationofMB0233.3遺傳參數(shù)分析3.3.1微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性在預(yù)實(shí)驗(yàn)的40只大尾寒羊中,對(duì)25個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行多態(tài)性篩選,通過(guò)等位基因數(shù),多態(tài)信息含量等因素,選取了15個(gè)等位基因數(shù)目較多、多態(tài)性較高的微衛(wèi)星位點(diǎn)用于大尾寒羊分子系譜的構(gòu)建和遺傳結(jié)構(gòu)分析。通過(guò)Cervus3.0中AlleleFrequencyAnalysis程序,會(huì)得到各種遺傳參數(shù),具體信息見(jiàn)表5。
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文21結(jié)果用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),使用凝膠成像系統(tǒng)觀察并拍照,檢測(cè)產(chǎn)物有無(wú)擴(kuò)增出,部分微衛(wèi)星標(biāo)記的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),見(jiàn)圖2,圖3,圖4,圖5。Marker為100-3000bp的marker。通過(guò)瓊脂糖電泳檢測(cè)結(jié)果可以看出,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖條帶清晰,效果較好,擴(kuò)增的片段長(zhǎng)度與目的長(zhǎng)度吻合,可以用來(lái)進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。圖2基因座BMS574的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖3基因座OarFCB20的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure2PCRamplificationofBMS574Figure3PCRamplificationofOarFCB20圖4基因座BMS1248的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖5基因座MB023的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure4PCRamplificationofBMS1248Figure5PCRamplificationofMB0233.3遺傳參數(shù)分析3.3.1微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性在預(yù)實(shí)驗(yàn)的40只大尾寒羊中,對(duì)25個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行多態(tài)性篩選,通過(guò)等位基因數(shù),多態(tài)信息含量等因素,選取了15個(gè)等位基因數(shù)目較多、多態(tài)性較高的微衛(wèi)星位點(diǎn)用于大尾寒羊分子系譜的構(gòu)建和遺傳結(jié)構(gòu)分析。通過(guò)Cervus3.0中AlleleFrequencyAnalysis程序,會(huì)得到各種遺傳參數(shù),具體信息見(jiàn)表5。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析安徽地方種豬的遺傳多樣性[J]. 丁勇,尚金男,徐怡亮,丁月云,崔文竹,高亞飛,殷宗俊,張曉東. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2019(05)
[2]岷縣黑裘皮羊微衛(wèi)星遺傳多樣性分析[J]. 張瑞,郎俠,吳建平,劉婷,宮旭胤,王彩蓮,遲浩斌,梁婷玉. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(08)
[3]西藏崗巴綿羊種質(zhì)特異標(biāo)記研究[J]. 洛桑催成,德慶卓嘎,巴桑吉巴,格桑加措,平措班旦,扎西,普布次仁,張立,旦巴,大格桑羅布. 畜禽業(yè). 2019(06)
[4]山東省濟(jì)寧青山羊群體遺傳多樣性分析[J]. 王可,劉昭華,曹洪防,楚惠民,崔緒奎. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(05)
[5]灘羊微衛(wèi)星標(biāo)記多態(tài)性及與體尺性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 李標(biāo),張瑞瑩,王小琪,張存芳,段子淵. 生物技術(shù)通報(bào). 2019(06)
[6]阿拉善沙漠雙峰駝的微衛(wèi)星多態(tài)性與體尺性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 烏仁套迪,斯琴圖雅,白俊艷. 畜牧與獸醫(yī). 2018(09)
[7]阿拉善戈壁雙峰駝的微衛(wèi)星多態(tài)性與體尺性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 烏仁套迪,白俊艷,巴拉,周俊文,張文彬. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2018(07)
[8]布拖黑綿羊微衛(wèi)星標(biāo)記遺傳多樣性研究[J]. 周明亮,陳明華,龐倩,楊平貴,李燕. 草學(xué). 2018(02)
[9]MiniFiler及Yfiler試劑盒無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前親子鑒定的可能性探究[J]. 蔣浩君,尹路,穆豪放,陳芳,何農(nóng)躍,杜舟. 中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志. 2017(01)
[10]新疆羅布羊群體遺傳多樣性及系統(tǒng)進(jìn)化分析[J]. 鄭永富,王姍姍,高慶華,錢夢(mèng)陽(yáng),宮昌海,陳曉利,韓春梅. 生物技術(shù). 2016(06)
碩士論文
[1]兩個(gè)山羊品種分子系譜的構(gòu)建及家系遺傳特征分析[D]. 紀(jì)志賓.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]7個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記與波爾山羊生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 蘇杰.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]中國(guó)9個(gè)地方山羊品種遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[D]. 樊睿.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2009
[4]六個(gè)miniSTR基因座群體遺傳學(xué)研究[D]. 李霞.河北醫(yī)科大學(xué) 2009
[5]山東地方山羊種群邊際多樣性和優(yōu)先保護(hù)次序[D]. 李培培.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[6]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析部分山羊品種的遺傳多樣性[D]. 趙艷紅.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號(hào):3288052
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:76 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
大尾寒羊血液基因組DNA提取凝膠電泳圖,M:DL2000DNAMarkerFigure1GelelectrophoresismapofbloodgenomicDNAofLargeTailedHanSheep,M:DL2000DNAMarker
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文21結(jié)果用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),使用凝膠成像系統(tǒng)觀察并拍照,檢測(cè)產(chǎn)物有無(wú)擴(kuò)增出,部分微衛(wèi)星標(biāo)記的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),見(jiàn)圖2,圖3,圖4,圖5。Marker為100-3000bp的marker。通過(guò)瓊脂糖電泳檢測(cè)結(jié)果可以看出,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖條帶清晰,效果較好,擴(kuò)增的片段長(zhǎng)度與目的長(zhǎng)度吻合,可以用來(lái)進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。圖2基因座BMS574的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖3基因座OarFCB20的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure2PCRamplificationofBMS574Figure3PCRamplificationofOarFCB20圖4基因座BMS1248的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖5基因座MB023的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure4PCRamplificationofBMS1248Figure5PCRamplificationofMB0233.3遺傳參數(shù)分析3.3.1微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性在預(yù)實(shí)驗(yàn)的40只大尾寒羊中,對(duì)25個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行多態(tài)性篩選,通過(guò)等位基因數(shù),多態(tài)信息含量等因素,選取了15個(gè)等位基因數(shù)目較多、多態(tài)性較高的微衛(wèi)星位點(diǎn)用于大尾寒羊分子系譜的構(gòu)建和遺傳結(jié)構(gòu)分析。通過(guò)Cervus3.0中AlleleFrequencyAnalysis程序,會(huì)得到各種遺傳參數(shù),具體信息見(jiàn)表5。
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文21結(jié)果用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),使用凝膠成像系統(tǒng)觀察并拍照,檢測(cè)產(chǎn)物有無(wú)擴(kuò)增出,部分微衛(wèi)星標(biāo)記的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),見(jiàn)圖2,圖3,圖4,圖5。Marker為100-3000bp的marker。通過(guò)瓊脂糖電泳檢測(cè)結(jié)果可以看出,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖條帶清晰,效果較好,擴(kuò)增的片段長(zhǎng)度與目的長(zhǎng)度吻合,可以用來(lái)進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。圖2基因座BMS574的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖3基因座OarFCB20的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure2PCRamplificationofBMS574Figure3PCRamplificationofOarFCB20圖4基因座BMS1248的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖5基因座MB023的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure4PCRamplificationofBMS1248Figure5PCRamplificationofMB0233.3遺傳參數(shù)分析3.3.1微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性在預(yù)實(shí)驗(yàn)的40只大尾寒羊中,對(duì)25個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行多態(tài)性篩選,通過(guò)等位基因數(shù),多態(tài)信息含量等因素,選取了15個(gè)等位基因數(shù)目較多、多態(tài)性較高的微衛(wèi)星位點(diǎn)用于大尾寒羊分子系譜的構(gòu)建和遺傳結(jié)構(gòu)分析。通過(guò)Cervus3.0中AlleleFrequencyAnalysis程序,會(huì)得到各種遺傳參數(shù),具體信息見(jiàn)表5。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析安徽地方種豬的遺傳多樣性[J]. 丁勇,尚金男,徐怡亮,丁月云,崔文竹,高亞飛,殷宗俊,張曉東. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2019(05)
[2]岷縣黑裘皮羊微衛(wèi)星遺傳多樣性分析[J]. 張瑞,郎俠,吳建平,劉婷,宮旭胤,王彩蓮,遲浩斌,梁婷玉. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(08)
[3]西藏崗巴綿羊種質(zhì)特異標(biāo)記研究[J]. 洛桑催成,德慶卓嘎,巴桑吉巴,格桑加措,平措班旦,扎西,普布次仁,張立,旦巴,大格桑羅布. 畜禽業(yè). 2019(06)
[4]山東省濟(jì)寧青山羊群體遺傳多樣性分析[J]. 王可,劉昭華,曹洪防,楚惠民,崔緒奎. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(05)
[5]灘羊微衛(wèi)星標(biāo)記多態(tài)性及與體尺性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 李標(biāo),張瑞瑩,王小琪,張存芳,段子淵. 生物技術(shù)通報(bào). 2019(06)
[6]阿拉善沙漠雙峰駝的微衛(wèi)星多態(tài)性與體尺性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 烏仁套迪,斯琴圖雅,白俊艷. 畜牧與獸醫(yī). 2018(09)
[7]阿拉善戈壁雙峰駝的微衛(wèi)星多態(tài)性與體尺性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 烏仁套迪,白俊艷,巴拉,周俊文,張文彬. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2018(07)
[8]布拖黑綿羊微衛(wèi)星標(biāo)記遺傳多樣性研究[J]. 周明亮,陳明華,龐倩,楊平貴,李燕. 草學(xué). 2018(02)
[9]MiniFiler及Yfiler試劑盒無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前親子鑒定的可能性探究[J]. 蔣浩君,尹路,穆豪放,陳芳,何農(nóng)躍,杜舟. 中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志. 2017(01)
[10]新疆羅布羊群體遺傳多樣性及系統(tǒng)進(jìn)化分析[J]. 鄭永富,王姍姍,高慶華,錢夢(mèng)陽(yáng),宮昌海,陳曉利,韓春梅. 生物技術(shù). 2016(06)
碩士論文
[1]兩個(gè)山羊品種分子系譜的構(gòu)建及家系遺傳特征分析[D]. 紀(jì)志賓.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]7個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記與波爾山羊生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 蘇杰.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]中國(guó)9個(gè)地方山羊品種遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[D]. 樊睿.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2009
[4]六個(gè)miniSTR基因座群體遺傳學(xué)研究[D]. 李霞.河北醫(yī)科大學(xué) 2009
[5]山東地方山羊種群邊際多樣性和優(yōu)先保護(hù)次序[D]. 李培培.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[6]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析部分山羊品種的遺傳多樣性[D]. 趙艷紅.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
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