小尾寒羊miR-221和miR-329b-3p功能研究及其與IRS1基因的靶向關(guān)系驗(yàn)證
發(fā)布時間:2021-07-17 10:26
綿羊的泌乳性狀是一個重要的經(jīng)濟(jì)性狀,它顯著影響了后代羔羊的成活率和生長速度等性能。乳腺發(fā)育程度以及乳腺上皮細(xì)胞的數(shù)量和分泌活性直接決定了母羊的產(chǎn)奶量和乳成分。microRNA(miRNA)是真核生物中廣泛存在的一類非編碼小RNA分子,它們在動物泌乳性狀調(diào)控方面發(fā)揮了重要作用。課題組前期采集了泌乳高峰期和空懷期小尾寒羊的乳腺組織,進(jìn)行了small RNA-Seq,在兩組間發(fā)現(xiàn)了23個差異表達(dá)miRNAs,其中miR-221和miR-329b-3p在空懷期乳腺中的表達(dá)量顯著上調(diào)。因此,本研究以這兩個miRNAs為研究對象,首先用實(shí)時熒光定量PCR(Reverse Transcription-Quantitative PCR,RT-qPCR)驗(yàn)證了它們的表達(dá)量,用CCK-8試劑盒檢測了它們對綿羊乳腺上皮細(xì)胞增殖的影響,其次預(yù)測了它們的靶基因,分析了靶基因的GO和KEGG功能富集。最后用雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)和RT-qPCR等方法,驗(yàn)證了miR-221和miR-329b-3p與預(yù)測靶基因IRS1的靶向關(guān)系,并研究了miR-221和miR-329b-3p對靶基因IRS1及IRS1參與的PI3K/AK...
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
奶牛乳房右前乳區(qū)解剖示意圖[5]
小尾寒羊miR-221和miR-329b-3p功能研究及其與IRS1基因的靶向關(guān)系驗(yàn)證13保存。2.7.1.2pmiR-RB-Report載體圖譜pmiR-RB-Report載體是專門用來檢測miRNA作用的檢測工具。在載體中,以海腎熒光素酶基因作為報(bào)告基因,以螢火蟲熒光素酶基因(hLuc)作為內(nèi)參基因,通過檢測海腎熒光素酶活性的相對變化,來鑒定miRNA對該基因是否有調(diào)控作用。將靶基因的3′UTR區(qū)克隆至載體的海腎熒光素酶基因(hRluc)下游位點(diǎn),載體圖譜見圖2-1。圖2-1pmiR-RB-Report載體圖譜Figure2-1pmiR-RB-Reportvectoratlas注:hRluc為海腎熒光素酶基因,是報(bào)告基因;hLuc+為螢火蟲熒光素酶基因,是內(nèi)參基因;3′UTRRegion是靶基因3′UTR區(qū)域的連接位點(diǎn);Ampr是氨芐青霉素抗性基因,用于大腸桿菌陽性克隆子篩眩2.7.1.3擴(kuò)增產(chǎn)物與pmiR-RB-Report載體的酶切及純化(1)擴(kuò)增產(chǎn)物的純化將IRS1基因3′UTR的擴(kuò)增產(chǎn)物(或酶切產(chǎn)物)加水補(bǔ)充到100μL,加入500μL的BufferGDP,顛倒或渦旋混勻后加入到吸附柱中,將吸附柱套在收集管中,在12000rpm下離心1min。棄濾液,把吸附柱置于收集管中。加入700μLBufferGW(含無水乙醇)至吸附柱中,12000rpm下離心1min(重復(fù)此操作1次)。棄濾液,把吸附柱置于收集管中,12000rpm下離心2min。將吸附柱置于在1.5mL滅菌的離心管中,加入20μLElutionBuffer至吸附柱中央,放置2min,12000rpm下離心1min。棄去吸附柱,把DNA保存于-20℃。(2)酶切將純化產(chǎn)物與pmiR-RB-Report載體分別置于PCR管中,加入內(nèi)切酶酶切(酶切體系見表2-5),輕輕混勻后瞬時離心,置于37℃恒溫水浴鍋中水浴10min。
甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士學(xué)位論文20第三章結(jié)果與分析1綿羊乳腺上皮細(xì)胞的原代培養(yǎng)與鑒定1.1綿羊乳腺上皮細(xì)胞的原代培養(yǎng)采用膠原酶I消化乳腺的實(shí)質(zhì)部分后,得到了大量的細(xì)胞。根據(jù)成纖維細(xì)胞和乳腺上皮細(xì)胞對胰酶的耐受性不同,來分離和純化乳腺上皮細(xì)胞。純化后的綿羊乳腺上皮細(xì)胞用全培養(yǎng)液培養(yǎng),具體生長過程為:第一天,綿羊乳腺上皮細(xì)胞生長緩慢、細(xì)胞體積校第三天,細(xì)胞體積變大,開始聚集生長。第四天,細(xì)胞大量增殖,有的細(xì)胞聚集在一起形成閉合的細(xì)胞群,呈“島嶼狀”生長,此時細(xì)胞已經(jīng)鋪滿了培養(yǎng)板的50%。第五天,細(xì)胞繼續(xù)增殖,成群生長,鋪滿了培養(yǎng)板的80%,呈現(xiàn)出明顯的“鋪路石”狀(圖3-1)。圖3-1綿羊乳腺上皮細(xì)胞的培養(yǎng)(100×)Figure3-1Thecultivationoftheovinemammaryglandepithelialcells(100×)1.2綿羊乳腺上皮細(xì)胞鑒定熒光倒置顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn):在原代培養(yǎng)的細(xì)胞中,乳腺上皮細(xì)胞的標(biāo)志性蛋白(角蛋白18,Keratin18)在細(xì)胞質(zhì)中呈陽性表達(dá)(圖3-2A),而成纖維細(xì)胞的標(biāo)志性蛋白(波形蛋白,Vimentin)在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核(藍(lán)色)中均不表達(dá)(圖3-2B)。這表明本試驗(yàn)獲得了純的綿羊乳腺上皮細(xì)胞,可以作為后續(xù)的研究材料。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]miR-25 modulates triacylglycerol and lipid accumulation in goat mammary epithelial cells by repressing PGC-1beta[J]. Liuan Ma,Huiling Qiu,Zhi Chen,Li Li,Yan Zeng,Jun Luo,Deming Gou. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2018(04)
[2]綿羊STAT5a基因的組織表達(dá)及核苷酸序列變異分析[J]. 郝志云,王繼卿,胡江,劉秀,李少斌,張亞強(qiáng),王冠,羅玉柱. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]海南黑山羊繁殖周期生殖激素的分泌規(guī)律研究[J]. 華蕊,張海文,吳科榜. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(01)
[4]奶用后備牛不同生理階段乳腺發(fā)育特點(diǎn)及營養(yǎng)調(diào)控作用[J]. 崔祥,刁其玉,屠焰. 中國奶牛. 2014(Z1)
[5]秦川牛IRS-1基因多態(tài)性與體尺和肉質(zhì)性狀的相關(guān)性[J]. 馬向輝,昝林森,高建斌,楊寧,朱光星,成功,王洪寶,郝瑞杰,付常振,姜碧杰,詹小立,白銀萍. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(08)
[6]人類胞內(nèi)蛋白半衰期與其亞細(xì)胞定位的相關(guān)性研究[J]. 賈浩,張小白,宋曉峰. 計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué). 2011(04)
[7]奶山羊乳腺上皮細(xì)胞的分離、培養(yǎng)及鑒定[J]. 王楨,羅軍,王偉,趙旺生,林先滋. 生物工程學(xué)報(bào). 2010(08)
[8]miRNA研究進(jìn)展[J]. 劉強(qiáng),鄭秀峰,辛永紅. 重慶醫(yī)學(xué). 2009(15)
[9]奶山羊乳腺上皮細(xì)胞系的建立[J]. 佟慧麗,尹德云,李慶章,高學(xué)軍. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(08)
[10]胰島素受體底物-1/-2與胰島素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)[J]. 舒適,宋菊敏. 醫(yī)學(xué)綜述. 2008(05)
博士論文
[1]奶山羊乳腺能量代謝研究[D]. 張娜.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]pik3r1通過PI3K-AKT-mTOR通路影響小鼠子宮內(nèi)膜的蛻膜化進(jìn)程[D]. 倪明云.重慶醫(yī)科大學(xué) 2018
[2]Wnt信號通路激活劑BIO在山羊乳腺上皮細(xì)胞形成腺泡樣結(jié)構(gòu)中的調(diào)控作用[D]. 孟凱.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[3]MiR-200a對奶山羊乳腺上皮細(xì)胞脂代謝的調(diào)控作用研究[D]. 張犁蘋.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
本文編號:3287992
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
奶牛乳房右前乳區(qū)解剖示意圖[5]
小尾寒羊miR-221和miR-329b-3p功能研究及其與IRS1基因的靶向關(guān)系驗(yàn)證13保存。2.7.1.2pmiR-RB-Report載體圖譜pmiR-RB-Report載體是專門用來檢測miRNA作用的檢測工具。在載體中,以海腎熒光素酶基因作為報(bào)告基因,以螢火蟲熒光素酶基因(hLuc)作為內(nèi)參基因,通過檢測海腎熒光素酶活性的相對變化,來鑒定miRNA對該基因是否有調(diào)控作用。將靶基因的3′UTR區(qū)克隆至載體的海腎熒光素酶基因(hRluc)下游位點(diǎn),載體圖譜見圖2-1。圖2-1pmiR-RB-Report載體圖譜Figure2-1pmiR-RB-Reportvectoratlas注:hRluc為海腎熒光素酶基因,是報(bào)告基因;hLuc+為螢火蟲熒光素酶基因,是內(nèi)參基因;3′UTRRegion是靶基因3′UTR區(qū)域的連接位點(diǎn);Ampr是氨芐青霉素抗性基因,用于大腸桿菌陽性克隆子篩眩2.7.1.3擴(kuò)增產(chǎn)物與pmiR-RB-Report載體的酶切及純化(1)擴(kuò)增產(chǎn)物的純化將IRS1基因3′UTR的擴(kuò)增產(chǎn)物(或酶切產(chǎn)物)加水補(bǔ)充到100μL,加入500μL的BufferGDP,顛倒或渦旋混勻后加入到吸附柱中,將吸附柱套在收集管中,在12000rpm下離心1min。棄濾液,把吸附柱置于收集管中。加入700μLBufferGW(含無水乙醇)至吸附柱中,12000rpm下離心1min(重復(fù)此操作1次)。棄濾液,把吸附柱置于收集管中,12000rpm下離心2min。將吸附柱置于在1.5mL滅菌的離心管中,加入20μLElutionBuffer至吸附柱中央,放置2min,12000rpm下離心1min。棄去吸附柱,把DNA保存于-20℃。(2)酶切將純化產(chǎn)物與pmiR-RB-Report載體分別置于PCR管中,加入內(nèi)切酶酶切(酶切體系見表2-5),輕輕混勻后瞬時離心,置于37℃恒溫水浴鍋中水浴10min。
甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士學(xué)位論文20第三章結(jié)果與分析1綿羊乳腺上皮細(xì)胞的原代培養(yǎng)與鑒定1.1綿羊乳腺上皮細(xì)胞的原代培養(yǎng)采用膠原酶I消化乳腺的實(shí)質(zhì)部分后,得到了大量的細(xì)胞。根據(jù)成纖維細(xì)胞和乳腺上皮細(xì)胞對胰酶的耐受性不同,來分離和純化乳腺上皮細(xì)胞。純化后的綿羊乳腺上皮細(xì)胞用全培養(yǎng)液培養(yǎng),具體生長過程為:第一天,綿羊乳腺上皮細(xì)胞生長緩慢、細(xì)胞體積校第三天,細(xì)胞體積變大,開始聚集生長。第四天,細(xì)胞大量增殖,有的細(xì)胞聚集在一起形成閉合的細(xì)胞群,呈“島嶼狀”生長,此時細(xì)胞已經(jīng)鋪滿了培養(yǎng)板的50%。第五天,細(xì)胞繼續(xù)增殖,成群生長,鋪滿了培養(yǎng)板的80%,呈現(xiàn)出明顯的“鋪路石”狀(圖3-1)。圖3-1綿羊乳腺上皮細(xì)胞的培養(yǎng)(100×)Figure3-1Thecultivationoftheovinemammaryglandepithelialcells(100×)1.2綿羊乳腺上皮細(xì)胞鑒定熒光倒置顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn):在原代培養(yǎng)的細(xì)胞中,乳腺上皮細(xì)胞的標(biāo)志性蛋白(角蛋白18,Keratin18)在細(xì)胞質(zhì)中呈陽性表達(dá)(圖3-2A),而成纖維細(xì)胞的標(biāo)志性蛋白(波形蛋白,Vimentin)在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核(藍(lán)色)中均不表達(dá)(圖3-2B)。這表明本試驗(yàn)獲得了純的綿羊乳腺上皮細(xì)胞,可以作為后續(xù)的研究材料。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]miR-25 modulates triacylglycerol and lipid accumulation in goat mammary epithelial cells by repressing PGC-1beta[J]. Liuan Ma,Huiling Qiu,Zhi Chen,Li Li,Yan Zeng,Jun Luo,Deming Gou. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2018(04)
[2]綿羊STAT5a基因的組織表達(dá)及核苷酸序列變異分析[J]. 郝志云,王繼卿,胡江,劉秀,李少斌,張亞強(qiáng),王冠,羅玉柱. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]海南黑山羊繁殖周期生殖激素的分泌規(guī)律研究[J]. 華蕊,張海文,吳科榜. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(01)
[4]奶用后備牛不同生理階段乳腺發(fā)育特點(diǎn)及營養(yǎng)調(diào)控作用[J]. 崔祥,刁其玉,屠焰. 中國奶牛. 2014(Z1)
[5]秦川牛IRS-1基因多態(tài)性與體尺和肉質(zhì)性狀的相關(guān)性[J]. 馬向輝,昝林森,高建斌,楊寧,朱光星,成功,王洪寶,郝瑞杰,付常振,姜碧杰,詹小立,白銀萍. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(08)
[6]人類胞內(nèi)蛋白半衰期與其亞細(xì)胞定位的相關(guān)性研究[J]. 賈浩,張小白,宋曉峰. 計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué). 2011(04)
[7]奶山羊乳腺上皮細(xì)胞的分離、培養(yǎng)及鑒定[J]. 王楨,羅軍,王偉,趙旺生,林先滋. 生物工程學(xué)報(bào). 2010(08)
[8]miRNA研究進(jìn)展[J]. 劉強(qiáng),鄭秀峰,辛永紅. 重慶醫(yī)學(xué). 2009(15)
[9]奶山羊乳腺上皮細(xì)胞系的建立[J]. 佟慧麗,尹德云,李慶章,高學(xué)軍. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(08)
[10]胰島素受體底物-1/-2與胰島素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)[J]. 舒適,宋菊敏. 醫(yī)學(xué)綜述. 2008(05)
博士論文
[1]奶山羊乳腺能量代謝研究[D]. 張娜.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]pik3r1通過PI3K-AKT-mTOR通路影響小鼠子宮內(nèi)膜的蛻膜化進(jìn)程[D]. 倪明云.重慶醫(yī)科大學(xué) 2018
[2]Wnt信號通路激活劑BIO在山羊乳腺上皮細(xì)胞形成腺泡樣結(jié)構(gòu)中的調(diào)控作用[D]. 孟凱.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[3]MiR-200a對奶山羊乳腺上皮細(xì)胞脂代謝的調(diào)控作用研究[D]. 張犁蘋.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
本文編號:3287992
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