運(yùn)用生物信息學(xué)方法對(duì)牛支原體（Mycoplasma bovis）和無(wú)乳支原體（Mycoplasma agalactiae）的相似性進(jìn)行多重比對(duì)分析。使用Mega 7、Clustal a、Sibeilia等生物信息學(xué)軟件對(duì)M.bovis與M.agalactiae的全基因組、16S rRNA、脂蛋白家族進(jìn)行相似性比對(duì)分析。通過(guò)多重比對(duì)發(fā)現(xiàn),M.bovis與M.agalactiae在全基因、16S rRNA、以及脂蛋白家族方面均表現(xiàn)出較高的相似性。 

【文章來(lái)源】：江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,36(02)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

牛支原體標(biāo)準(zhǔn)株與無(wú)乳支原體分離株的基因組共線性分析

運(yùn)用生物信息學(xué)軟件Sibelia對(duì)M.bovis的標(biāo)準(zhǔn)株P(guān)G45與M.agalactiae的標(biāo)準(zhǔn)株P(guān)G2進(jìn)行全基因組共線性分析。由共線性圓形圖(圖1)可以發(fā)現(xiàn),PG45與PG2之間有4個(gè)位置的基因具有共線性關(guān)系,說(shuō)明M.bovis與M.agalactiae的標(biāo)準(zhǔn)株具有一定的相似性。在M.bovis與M.agalactiae標(biāo)準(zhǔn)株表現(xiàn)出共線性的前提下,對(duì)M.bovis標(biāo)準(zhǔn)株P(guān)G45與M.agalactiae分離株5632進(jìn)行全基因組共線性分析(圖2),對(duì)M.bovis分離株Ningxia-1與M.agalactiae分離株5632也進(jìn)行了全基因組共線性分析(圖3)。結(jié)果表明M.bovis與M.agalactiae不僅在標(biāo)準(zhǔn)株中具有共線性關(guān)系,在分離株中同樣存在共線性關(guān)系,說(shuō)明二者在基因組共線性層面上具有相似性。

牛支原體分離株與無(wú)乳支原體分離株的基因組共線性分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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