FADV-4環(huán)介導等溫擴增-HNB可視化檢測方法的建立和應用
發(fā)布時間:2021-07-01 21:33
為了建立簡便、快速的FADV-4環(huán)介導等溫擴增(LAMP)可視化檢測方法,試驗以FADV-4高度保守的基因序列hexon基因為靶基因設(shè)計了6條引物,對反應體系的Mg2+濃度、Bst DNA聚合酶用量、反應溫度、反應持續(xù)時間進行優(yōu)化,考察了優(yōu)化體系的靈敏度及特異性。同時用建立的FADV-4 LAMP及LAMP-HNB可視化的檢測方法對臨床模擬樣品進行檢測。結(jié)果表明:當Mg2+濃度為6 mmol/L、Bst DNA聚合酶濃度為320 U/mL、反應溫度為65℃、反應時間為60 min、HNB使用濃度為120μmol/L時反應最優(yōu)。LAMP最低DNA檢測濃度為1.46 pg/μL,靈敏度是PCR的100倍,臨床模擬樣品LAMP、LAMP-HNB檢測結(jié)果與普通PCR檢測結(jié)果完全符合。說明所建立的FADV-4 LAMP-HNB可視化檢測方法適用于臨床的快速診斷。
【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(24)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
Mg2+濃度優(yōu)化試驗結(jié)果
不同濃度Bst DNA聚合酶反應時均顯示有特異條帶,且條帶在40~320 U/mL范圍內(nèi)明顯增強,但是Bst DNA聚合酶濃度為320,390 U/mL時對應的條帶亮度基本一致(見圖2)。為了節(jié)約試劑減少成本,因此選擇Bst DNA聚合酶最佳濃度為320 U/mL。3.3 反應溫度的優(yōu)化
LAMP反應溫度設(shè)置從60,61,62,63,64,65,66,67 ℃依次遞增,反應溫度為64,65,66,67 ℃時有明顯拖尾的梯形條帶,64 ℃時梯形條帶較淡,65,66,67 ℃時條帶亮度基本一致,60,61,62,63 ℃梯形條帶不明顯(見圖3)。因此,最終選擇65 ℃為最佳反應溫度。3.4 反應時間的優(yōu)化
【參考文獻】:
期刊論文
[1]禽腺病毒血清4型RPA-LFD快速檢測方法的建立[J]. 萬文妍,劉延珂,吳艷陽,楊東東,王增,趙軍. 中國獸醫(yī)學報. 2019(01)
[2]豬流行性腹瀉病毒環(huán)介導等溫擴增檢測方法的建立及應用[J]. 羅亞坤,梁琳,王靜,劉存,劉琪,劉暢,藺文成,崔尚金. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(02)
[3]雞心包積水綜合征疫苗研究進展[J]. 程小果,王慧,程寧,陳申秒,朱杰,宿春虎,郭建友,張小榮,吳艷濤. 動物醫(yī)學進展. 2016(11)
[4]禽腺病毒4型PCR檢測方法的建立與應用[J]. 袁萬哲,張姍,陳萍,張超,經(jīng)美,崔元,孫繼國,劉聚祥. 中國動物檢疫. 2016(05)
[5]環(huán)介導等溫擴增(LAMP)技術(shù)的應用研究[J]. 劉永生,丁耀忠,張杰. 中國農(nóng)學通報. 2010(08)
[6]PCR-RFLP技術(shù)對Ⅰ群禽腺病毒12個血清型毒株的分型鑒定[J]. 唐熠,謝芝勛,熊文婕,劉加波,龐耀珊,鄧顯文,謝志勤,謝麗基. 中國獸醫(yī)科學. 2009(10)
本文編號:3259906
【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(24)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
Mg2+濃度優(yōu)化試驗結(jié)果
不同濃度Bst DNA聚合酶反應時均顯示有特異條帶,且條帶在40~320 U/mL范圍內(nèi)明顯增強,但是Bst DNA聚合酶濃度為320,390 U/mL時對應的條帶亮度基本一致(見圖2)。為了節(jié)約試劑減少成本,因此選擇Bst DNA聚合酶最佳濃度為320 U/mL。3.3 反應溫度的優(yōu)化
LAMP反應溫度設(shè)置從60,61,62,63,64,65,66,67 ℃依次遞增,反應溫度為64,65,66,67 ℃時有明顯拖尾的梯形條帶,64 ℃時梯形條帶較淡,65,66,67 ℃時條帶亮度基本一致,60,61,62,63 ℃梯形條帶不明顯(見圖3)。因此,最終選擇65 ℃為最佳反應溫度。3.4 反應時間的優(yōu)化
【參考文獻】:
期刊論文
[1]禽腺病毒血清4型RPA-LFD快速檢測方法的建立[J]. 萬文妍,劉延珂,吳艷陽,楊東東,王增,趙軍. 中國獸醫(yī)學報. 2019(01)
[2]豬流行性腹瀉病毒環(huán)介導等溫擴增檢測方法的建立及應用[J]. 羅亞坤,梁琳,王靜,劉存,劉琪,劉暢,藺文成,崔尚金. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(02)
[3]雞心包積水綜合征疫苗研究進展[J]. 程小果,王慧,程寧,陳申秒,朱杰,宿春虎,郭建友,張小榮,吳艷濤. 動物醫(yī)學進展. 2016(11)
[4]禽腺病毒4型PCR檢測方法的建立與應用[J]. 袁萬哲,張姍,陳萍,張超,經(jīng)美,崔元,孫繼國,劉聚祥. 中國動物檢疫. 2016(05)
[5]環(huán)介導等溫擴增(LAMP)技術(shù)的應用研究[J]. 劉永生,丁耀忠,張杰. 中國農(nóng)學通報. 2010(08)
[6]PCR-RFLP技術(shù)對Ⅰ群禽腺病毒12個血清型毒株的分型鑒定[J]. 唐熠,謝芝勛,熊文婕,劉加波,龐耀珊,鄧顯文,謝志勤,謝麗基. 中國獸醫(yī)科學. 2009(10)
本文編號:3259906
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