京海黃雞G蛋白偶聯(lián)受體1基因生物信息學(xué)及組織表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-23 18:53
試驗(yàn)旨在研究參與激素調(diào)節(jié)并調(diào)控卵巢功能的可能基因,挑選候選基因G蛋白偶聯(lián)受體1(Gprotein-coupledreceptor1),深入研究其是否參與激素調(diào)節(jié)。根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的京海黃雞GPR1基因的CDS序列設(shè)計(jì)一對(duì)引物,利用實(shí)時(shí)熒光定量RTPCR方法,檢測(cè)GPR1基因在高低產(chǎn)京海黃雞卵巢組織中的表達(dá)情況,并與生物信息學(xué)進(jìn)行關(guān)聯(lián),使用多種生物軟件和在線工具對(duì)目的序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,分析GPR1基因與其他物種的同源性、蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、蛋白質(zhì)序列的跨膜區(qū)、亞細(xì)胞定位、親水性、潛在的磷酸化位點(diǎn)、保守結(jié)構(gòu)域及該基因所編碼蛋白質(zhì)的二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示,京海黃雞與GenBank中原雞、人、牛、野豬、黑猩猩、家兔、馬、綿羊、藏羚羊、大鼠、小鼠、斑馬魚的同源性分別為100.0%、69.0%、69.1%、69.3%、68.9%、69.6%、69.2%、68.8%、68.9%、67.5%、69.0%和50.3%;氨基酸分析發(fā)現(xiàn)GPR1蛋白為疏水性蛋白,分子質(zhì)量為40.41ku,理論等電點(diǎn)為6.91,為7次跨膜蛋白;亞細(xì)胞定位顯示,該蛋白屬于非分泌蛋白;預(yù)測(cè)該蛋白含有25個(gè)潛在的磷酸化位點(diǎn),...
【文章來(lái)源】:江蘇省遺傳學(xué)會(huì)2017年學(xué)術(shù)研討會(huì)——“技術(shù)創(chuàng)新與遺傳學(xué)發(fā)展”論文摘要集江蘇省遺傳學(xué)會(huì)會(huì)議論文集
【文章頁(yè)數(shù)】:1 頁(yè)
本文編號(hào):3245476
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