豬不同肌纖維類型中轉(zhuǎn)錄組差異表達的miRNAs生物學(xué)功能研究
發(fā)布時間:2021-06-22 12:09
MicroRNA(miRNA)是一類內(nèi)源性的長約21-23 nt的非編碼小RNA分子,主要通過其5’種子區(qū)域(2-8 nt)與靶基因的3’非編碼區(qū)互補配對結(jié)合來抑制靶基因的轉(zhuǎn)錄或者使得靶基因降解,作為關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控因子調(diào)控真核生物的基因表達。骨骼肌是一種高度異質(zhì)性的組織,由不同的肌纖維組成,結(jié)合其功能、形態(tài)特征以及肌球蛋白重鏈比例,可以將其分為紅肌、中間型和白肌。最近研究發(fā)現(xiàn)在紅肌和白肌之間存在差異表達的miRNAs,這些差異的miRNA主要跟骨骼肌發(fā)育、代謝等功能相關(guān)。然而,在3種肌纖維類型(紅肌、中間型和白肌)中的miRNA轉(zhuǎn)錄組差異有待進一步研究。豬作為重要的農(nóng)業(yè)經(jīng)濟動物和生物醫(yī)學(xué)研究模型,本實驗以豬不同骨骼肌為研究對象,主要通過熒光定量和高通量測序方法檢測不同類型肌肉中的miRNAs轉(zhuǎn)錄組差異,結(jié)果如下:1本實驗采集了豬不同部位的15種骨骼肌,用Sanger sequencing驗證過的特異肌球蛋白重鏈引物來定量在這15種骨骼肌中的肌球蛋白重鏈表達量,根據(jù)肌球蛋白重鏈比例的聚類分析顯示,可以聚成紅肌、中間型和白肌三大類。進一步定量線粒體拷貝數(shù)和酵解酶(乳酸脫氫酶的A,LDHA...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1各種骨骼肉的特征??Fig.?1?The?characteri之ations?of?various?skele化?1?muscles??
如氧化、酵解。為了進一步區(qū)分不同的肌纖維代謝能力的差異W及證明??這15種肌肉的分類結(jié)果,本實驗同時還檢測線粒體拷貝數(shù)和L公化4的相對表達水??平。如圖2B所示,紅肌類肌肉中的mtDNA的拷貝數(shù)極涅著高于中間型和白肌纖??維,中間型肌肉中的mtDNA的拷貝數(shù)極顯著高于白肌,白肌纖維中mtDNA的拷??貝數(shù)最化。如圖2C所示,紅肌類肌肉中的IX估4表達量極顯著低于中間型和白肌??纖維,中間型肌肉中的王;幢磉_量顯著高于紅肌類肌肉但是低于白肌類纖維,白??肌纖維中LD化4表達量極顯著高于中間型和紅肌纖維。并且線粒體拷貝數(shù)和么0化4??在不同肌纖維類型內(nèi)的肌肉中表達差異不大,從圖2B和2C中可W明顯看出分為了??3大類。綜上所述,根據(jù)氧化、酵解氧化能力也將肌肉很顯著分成了紅肌、白肌和??中間型,證明我們之前用MyHC亞型的比值進行肌肉分型的正確性。??為了節(jié)約實驗成本,本實驗從這15種肌肉組織中選擇3種具有典型的每種肌??纖維特征的肌肉代這紅肌、白肌和中間型纖維。在紐肌纖維類型中
共表達高豐度的豬已知miRNAs的用于下面的功能分析。為了驗證深度測序結(jié)果的??可靠性,本實驗隨機選擇了?20個miRNAs用qRT-PC艮進行驗證。結(jié)果顯示小RNA??測序數(shù)據(jù)與qRT-PCR結(jié)果呈極顯著顯著的正相關(guān)護=0.780,?f?<?10氣(圖3巧,再??次驗證了深度測序方法的可靠性。??22??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]降解組測序技術(shù)在植物miRNA研究中的應(yīng)用[J]. 董淼,黃越,陳文鐸,徐濤,郎秋蕾. 植物學(xué)報. 2013(03)
[2]骨骼肌衛(wèi)星細胞對肉品質(zhì)的影響及其分化調(diào)控[J]. 沈林園,張順華,吳澤輝,鄭夢月,李學(xué)偉,朱礪. 遺傳. 2013(09)
[3]MicroRNAs Involved in Skeletal Muscle Differentiation[J]. Wen Luo,,Qinghua Nie,Xiquan Zhang. 遺傳學(xué)報. 2013(03)
[4]hper1基因3′端UTR區(qū)雙熒光素酶報告系統(tǒng)構(gòu)建[J]. 趙溪巖,成姝婷,勾洵,王正榮,肖靜,郭慧玲,汪宇輝. 四川生理科學(xué)雜志. 2013(01)
[5]豬miR-369靶基因腫瘤壞死抑制因子-α(TNF-α)的鑒定[J]. 母治平,鄧娟,王滔,李明洲,李學(xué)偉. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2012(08)
碩士論文
[1]榮昌豬和長白豬MyHC基因的表達模式及其與肉質(zhì)性狀的相關(guān)性研究[D]. 冉彪.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號:3242808
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1各種骨骼肉的特征??Fig.?1?The?characteri之ations?of?various?skele化?1?muscles??
如氧化、酵解。為了進一步區(qū)分不同的肌纖維代謝能力的差異W及證明??這15種肌肉的分類結(jié)果,本實驗同時還檢測線粒體拷貝數(shù)和L公化4的相對表達水??平。如圖2B所示,紅肌類肌肉中的mtDNA的拷貝數(shù)極涅著高于中間型和白肌纖??維,中間型肌肉中的mtDNA的拷貝數(shù)極顯著高于白肌,白肌纖維中mtDNA的拷??貝數(shù)最化。如圖2C所示,紅肌類肌肉中的IX估4表達量極顯著低于中間型和白肌??纖維,中間型肌肉中的王;幢磉_量顯著高于紅肌類肌肉但是低于白肌類纖維,白??肌纖維中LD化4表達量極顯著高于中間型和紅肌纖維。并且線粒體拷貝數(shù)和么0化4??在不同肌纖維類型內(nèi)的肌肉中表達差異不大,從圖2B和2C中可W明顯看出分為了??3大類。綜上所述,根據(jù)氧化、酵解氧化能力也將肌肉很顯著分成了紅肌、白肌和??中間型,證明我們之前用MyHC亞型的比值進行肌肉分型的正確性。??為了節(jié)約實驗成本,本實驗從這15種肌肉組織中選擇3種具有典型的每種肌??纖維特征的肌肉代這紅肌、白肌和中間型纖維。在紐肌纖維類型中
共表達高豐度的豬已知miRNAs的用于下面的功能分析。為了驗證深度測序結(jié)果的??可靠性,本實驗隨機選擇了?20個miRNAs用qRT-PC艮進行驗證。結(jié)果顯示小RNA??測序數(shù)據(jù)與qRT-PCR結(jié)果呈極顯著顯著的正相關(guān)護=0.780,?f?<?10氣(圖3巧,再??次驗證了深度測序方法的可靠性。??22??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]降解組測序技術(shù)在植物miRNA研究中的應(yīng)用[J]. 董淼,黃越,陳文鐸,徐濤,郎秋蕾. 植物學(xué)報. 2013(03)
[2]骨骼肌衛(wèi)星細胞對肉品質(zhì)的影響及其分化調(diào)控[J]. 沈林園,張順華,吳澤輝,鄭夢月,李學(xué)偉,朱礪. 遺傳. 2013(09)
[3]MicroRNAs Involved in Skeletal Muscle Differentiation[J]. Wen Luo,,Qinghua Nie,Xiquan Zhang. 遺傳學(xué)報. 2013(03)
[4]hper1基因3′端UTR區(qū)雙熒光素酶報告系統(tǒng)構(gòu)建[J]. 趙溪巖,成姝婷,勾洵,王正榮,肖靜,郭慧玲,汪宇輝. 四川生理科學(xué)雜志. 2013(01)
[5]豬miR-369靶基因腫瘤壞死抑制因子-α(TNF-α)的鑒定[J]. 母治平,鄧娟,王滔,李明洲,李學(xué)偉. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2012(08)
碩士論文
[1]榮昌豬和長白豬MyHC基因的表達模式及其與肉質(zhì)性狀的相關(guān)性研究[D]. 冉彪.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號:3242808
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