基因變異對(duì)奶牛生產(chǎn)性狀的影響及隱性遺傳疾病致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-06-21 23:56
本研究開展了兩個(gè)方面的研究,(1)在483頭荷斯坦奶牛中,對(duì)我們實(shí)驗(yàn)室前期研究從SNP芯片中篩選出的PTHRP, TGFB1, PTK2, MAF1和PHF20的與奶牛生產(chǎn)性能相關(guān)的SNPs進(jìn)行了其變異遺傳效應(yīng)的驗(yàn)證,以獲得繁殖和產(chǎn)奶性能相關(guān)的分子遺傳標(biāo)記。(2)建立鋅缺乏癥(Bovine hereditary zinc deficiency, BHZD)、脊髓型肌萎縮癥(Spinal muscular atrophy, SMA)、血友。℉emophilia A)以及軸突病變(Degenerative Axonopathy)四種疾病的致病基因突變位點(diǎn)的分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù),并利用測(cè)序技術(shù)對(duì)其準(zhǔn)確性進(jìn)行驗(yàn)證,且對(duì)現(xiàn)有的荷斯坦奶牛樣本進(jìn)行檢測(cè),以淘汰奶牛群中的遺傳病有害基因。主要研究結(jié)果如下:1、PTHRP基因變異對(duì)奶牛產(chǎn)奶繁殖性能具有顯著的影響。在PTHRP基因intron1中的SNP位點(diǎn)(C→T突變),對(duì)第二胎次的305產(chǎn)奶量、總產(chǎn)奶量、總蛋白量均有顯著影響(P<0.05), CC基因型個(gè)體的高于其他二個(gè)基因型個(gè)體的;對(duì)第一胎和第三胎的犢牛出生重量均達(dá)到了顯著水平(P<0....
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:89 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
第一部分 基因變異對(duì)奶牛繁殖產(chǎn)奶性狀影響的分析
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 引言
1.2 候選基因研究進(jìn)展
1.2.1 甲狀旁腺素相關(guān)蛋白(parathyroid hormone-related protein,PTHRP)基因
1.2.2 TGFB1(轉(zhuǎn)化生長因子-β1)基因
1.2.3 PTK2(粘著斑激酶)基因
1.2.4 MAF1(同源釀酒酵母)基因
1.2.5 PHF20(指蛋白20)基因
1.3 研究目的和意義
第二章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)牛
2.1.2 血液樣品的采集和提取方法
2.2 主要儀器與設(shè)備
2.3 主要的試劑及配制
2.3.1 主要試劑的配制
2.3.2 其他試劑
2.4 試驗(yàn)方法
2.4.1 基因組DNA的提取
2.4.2 聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)
2.4.3 SNPs的檢測(cè)
2.4.4 PCR產(chǎn)物酶切及電泳
2.4.5 分子生物學(xué)軟件和數(shù)據(jù)分析軟件
2.4.6 群體遺傳學(xué)研究和數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
第三章 結(jié)果與分析
3.1 PTHRP基因
3.1.1 牛的PTHRP基因目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.1.2 PTHRP基因的基因多態(tài)性檢測(cè)
3.1.3 牛PTHRP基因SNP位點(diǎn)的PCR-RFLP多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
3.1.4 奶牛PTHRP基因的變異特征
3.1.5 PTHRP基因型與荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.2 PTK2基因
3.2.1 牛的PTK2基因目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.2.2 牛PTK2基因SNP位點(diǎn)的CRS-PCR-RFLP多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
3.2.3 奶牛PTK2基因的變異特征
3.2.4 PTK2基因型與荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.3 MAF1基因
3.3.1 牛的MAF1基因目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.3.2 牛MAF1基因SNP位點(diǎn)的PCR-RFLP多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
3.3.3 奶牛MAF1基因的變異特征
3.3.4 MAF1基因型與荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.4 PHF20基因
3.4.1 牛的PHF20基因目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.4.2 牛PHF20基因SNP位點(diǎn)的PCR-RFLP多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
3.4.3 奶牛PHF20基因的變異特征
3.4.4 PHF20基因型與荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.5 TGFB1基因
3.5.1 牛的TGFBl基因目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.5.2 TGFB1基因的基因變異位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)
第四章 討論
4.1 PTHRP基因內(nèi)含子變異對(duì)奶牛產(chǎn)奶性能影響的討論
4.2 MAF1、PTK2和PHF20基因變異對(duì)奶牛繁殖和產(chǎn)奶性狀產(chǎn)生遺效應(yīng)的驗(yàn)證及其討論
4.2.1 PTK2基因多態(tài)性和性狀關(guān)聯(lián)分析
4.2.2 MAF1基因多態(tài)性和性狀關(guān)聯(lián)分析
4.2.3 PHF20基因多態(tài)性和性狀關(guān)聯(lián)分析
第二部分 隱性遺傳疾病致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的建立
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 引言
1.2 脊髓型肌萎縮癥(Spinal muscular atrophy,SMA)的研究進(jìn)展
1.2.2 SMA的檢測(cè)方法與分布
1.3 牛鋅缺乏癥(bovine hereditary zinc deficiency,BHZD)的研究進(jìn)展
1.3.1 牛鋅缺乏癥(bovine hereditary zinc deficiency,BHZD)的發(fā)病機(jī)制及臨床癥狀
1.3.2 BHZD的檢測(cè)方法與分布
1.4 血友病(hemophilia A)的研究進(jìn)展
1.4.1 血友病(hemophilia A)的發(fā)病機(jī)制與臨床癥狀
1.4.2 血友病(hemophilia A)的檢測(cè)方法和分布
1.5 軸突病變(Degenerative Axonopathy)的研究進(jìn)展
1.5.1 軸突病變(Degenerative Axonopathy)的發(fā)病機(jī)制及臨床癥狀
1.5.2 軸突病變(Degenerative Axonopathy)的檢測(cè)方法和分布
1.6 研究目的和意義
第二章 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)牛來源
2.1.2 血液樣品的采集和提取方法(見第一部分的材料與方法)
2.2 主要儀器與設(shè)備(見第一部分的材料與方法)
2.3 主要的試劑及配制(見第一部分的材料與方法)
2.4 試驗(yàn)方法
2.4.1 基因組DNA的提取(見第一部分的材料與方法)
2.4.2 聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)
2.4.3 PCR產(chǎn)物酶切及電泳(見第一部分的材料與方法)
2.4.4 PCR產(chǎn)物回收及測(cè)序
第三章 結(jié)果與分析
3.1 牛鋅缺乏癥(BHZD)致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.1.1 BHZD致病位點(diǎn)PCR-RFLP(BtsC Ⅰ)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.1.2 利用序列測(cè)序技術(shù)對(duì)BHZD致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證
3.1.3 PCR-RFLP致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)在荷斯坦奶牛上的應(yīng)用
3.2 牛脊髓型肌萎縮癥(SMA)致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.2.1 SMA致病位點(diǎn)PCR-RFLP(Mva Ⅰ)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.2.2 利用序列測(cè)序技術(shù)對(duì)SMA致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證
3.2.3 PCR-RFLP致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)在荷斯坦奶牛上的應(yīng)用
3.3 牛血友病(Hemophilia A)致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.3.1 血友病致病位點(diǎn)PCR-RFLP(Ear Ⅰ)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.3.2 利用序列測(cè)序技術(shù)對(duì)Hemophilia A致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證
3.3.3 PCR-RFLP致病位點(diǎn)檢測(cè)方法在荷斯坦奶牛上的應(yīng)用
3.4 牛軸突病變(Degenerative Axonopathy)致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.4.1 軸突病變致病位點(diǎn)PCR-RFLP(TspR Ⅰ)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.4.2 利用序列測(cè)序技術(shù)對(duì)軸突病變致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證
3.4.3 PCR-RFLP致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)在荷斯坦奶牛上的應(yīng)用
第四章 討論
4.1 關(guān)于建立SMA、BHZD、Hemophilia A以及Degenerative Axonopathy四種隱性遺傳疾病致病位點(diǎn)的PCR-RFLP檢測(cè)技術(shù)
4.2 荷斯坦奶牛隱性遺傳疾病的檢測(cè)
第三部分 小結(jié)
1.1 主要結(jié)論
1.2 本研究創(chuàng)新點(diǎn)
1.3 本研究的進(jìn)一步研究內(nèi)容
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):3241686
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:89 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
Abstract
縮略詞表
第一部分 基因變異對(duì)奶牛繁殖產(chǎn)奶性狀影響的分析
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 引言
1.2 候選基因研究進(jìn)展
1.2.1 甲狀旁腺素相關(guān)蛋白(parathyroid hormone-related protein,PTHRP)基因
1.2.2 TGFB1(轉(zhuǎn)化生長因子-β1)基因
1.2.3 PTK2(粘著斑激酶)基因
1.2.4 MAF1(同源釀酒酵母)基因
1.2.5 PHF20(指蛋白20)基因
1.3 研究目的和意義
第二章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)牛
2.1.2 血液樣品的采集和提取方法
2.2 主要儀器與設(shè)備
2.3 主要的試劑及配制
2.3.1 主要試劑的配制
2.3.2 其他試劑
2.4 試驗(yàn)方法
2.4.1 基因組DNA的提取
2.4.2 聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)
2.4.3 SNPs的檢測(cè)
2.4.4 PCR產(chǎn)物酶切及電泳
2.4.5 分子生物學(xué)軟件和數(shù)據(jù)分析軟件
2.4.6 群體遺傳學(xué)研究和數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
第三章 結(jié)果與分析
3.1 PTHRP基因
3.1.1 牛的PTHRP基因目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.1.2 PTHRP基因的基因多態(tài)性檢測(cè)
3.1.3 牛PTHRP基因SNP位點(diǎn)的PCR-RFLP多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
3.1.4 奶牛PTHRP基因的變異特征
3.1.5 PTHRP基因型與荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.2 PTK2基因
3.2.1 牛的PTK2基因目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.2.2 牛PTK2基因SNP位點(diǎn)的CRS-PCR-RFLP多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
3.2.3 奶牛PTK2基因的變異特征
3.2.4 PTK2基因型與荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.3 MAF1基因
3.3.1 牛的MAF1基因目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.3.2 牛MAF1基因SNP位點(diǎn)的PCR-RFLP多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
3.3.3 奶牛MAF1基因的變異特征
3.3.4 MAF1基因型與荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.4 PHF20基因
3.4.1 牛的PHF20基因目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.4.2 牛PHF20基因SNP位點(diǎn)的PCR-RFLP多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
3.4.3 奶牛PHF20基因的變異特征
3.4.4 PHF20基因型與荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.5 TGFB1基因
3.5.1 牛的TGFBl基因目的片段擴(kuò)增結(jié)果
3.5.2 TGFB1基因的基因變異位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)
第四章 討論
4.1 PTHRP基因內(nèi)含子變異對(duì)奶牛產(chǎn)奶性能影響的討論
4.2 MAF1、PTK2和PHF20基因變異對(duì)奶牛繁殖和產(chǎn)奶性狀產(chǎn)生遺效應(yīng)的驗(yàn)證及其討論
4.2.1 PTK2基因多態(tài)性和性狀關(guān)聯(lián)分析
4.2.2 MAF1基因多態(tài)性和性狀關(guān)聯(lián)分析
4.2.3 PHF20基因多態(tài)性和性狀關(guān)聯(lián)分析
第二部分 隱性遺傳疾病致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的建立
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 引言
1.2 脊髓型肌萎縮癥(Spinal muscular atrophy,SMA)的研究進(jìn)展
1.2.2 SMA的檢測(cè)方法與分布
1.3 牛鋅缺乏癥(bovine hereditary zinc deficiency,BHZD)的研究進(jìn)展
1.3.1 牛鋅缺乏癥(bovine hereditary zinc deficiency,BHZD)的發(fā)病機(jī)制及臨床癥狀
1.3.2 BHZD的檢測(cè)方法與分布
1.4 血友病(hemophilia A)的研究進(jìn)展
1.4.1 血友病(hemophilia A)的發(fā)病機(jī)制與臨床癥狀
1.4.2 血友病(hemophilia A)的檢測(cè)方法和分布
1.5 軸突病變(Degenerative Axonopathy)的研究進(jìn)展
1.5.1 軸突病變(Degenerative Axonopathy)的發(fā)病機(jī)制及臨床癥狀
1.5.2 軸突病變(Degenerative Axonopathy)的檢測(cè)方法和分布
1.6 研究目的和意義
第二章 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)牛來源
2.1.2 血液樣品的采集和提取方法(見第一部分的材料與方法)
2.2 主要儀器與設(shè)備(見第一部分的材料與方法)
2.3 主要的試劑及配制(見第一部分的材料與方法)
2.4 試驗(yàn)方法
2.4.1 基因組DNA的提取(見第一部分的材料與方法)
2.4.2 聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)
2.4.3 PCR產(chǎn)物酶切及電泳(見第一部分的材料與方法)
2.4.4 PCR產(chǎn)物回收及測(cè)序
第三章 結(jié)果與分析
3.1 牛鋅缺乏癥(BHZD)致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.1.1 BHZD致病位點(diǎn)PCR-RFLP(BtsC Ⅰ)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.1.2 利用序列測(cè)序技術(shù)對(duì)BHZD致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證
3.1.3 PCR-RFLP致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)在荷斯坦奶牛上的應(yīng)用
3.2 牛脊髓型肌萎縮癥(SMA)致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.2.1 SMA致病位點(diǎn)PCR-RFLP(Mva Ⅰ)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.2.2 利用序列測(cè)序技術(shù)對(duì)SMA致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證
3.2.3 PCR-RFLP致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)在荷斯坦奶牛上的應(yīng)用
3.3 牛血友病(Hemophilia A)致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.3.1 血友病致病位點(diǎn)PCR-RFLP(Ear Ⅰ)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.3.2 利用序列測(cè)序技術(shù)對(duì)Hemophilia A致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證
3.3.3 PCR-RFLP致病位點(diǎn)檢測(cè)方法在荷斯坦奶牛上的應(yīng)用
3.4 牛軸突病變(Degenerative Axonopathy)致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.4.1 軸突病變致病位點(diǎn)PCR-RFLP(TspR Ⅰ)檢測(cè)技術(shù)的建立
3.4.2 利用序列測(cè)序技術(shù)對(duì)軸突病變致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證
3.4.3 PCR-RFLP致病位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)在荷斯坦奶牛上的應(yīng)用
第四章 討論
4.1 關(guān)于建立SMA、BHZD、Hemophilia A以及Degenerative Axonopathy四種隱性遺傳疾病致病位點(diǎn)的PCR-RFLP檢測(cè)技術(shù)
4.2 荷斯坦奶牛隱性遺傳疾病的檢測(cè)
第三部分 小結(jié)
1.1 主要結(jié)論
1.2 本研究創(chuàng)新點(diǎn)
1.3 本研究的進(jìn)一步研究內(nèi)容
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):3241686
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