溫州水牛是國家級畜禽遺傳資源保護品種。與普通牛奶相比,水牛奶擁有較高的干物質(zhì)含量,具有很大的潛在價值。因此發(fā)掘溫州水牛的候選功能基因和單核苷酸多態(tài)性分子標(biāo)記,能夠為乳用溫州水牛的分子標(biāo)記輔助育種及其乳產(chǎn)品的開發(fā)利用提供理論依據(jù)和技術(shù)支持。本試驗以平陽縣挺志溫州水牛乳業(yè)有限公司和湖北荊門市沙洋縣五里鎮(zhèn)奶水牛養(yǎng)殖示范基地內(nèi)的溫州水牛為研究對象,選取泌乳前期、泌乳中期、泌乳后期各10頭溫州水牛,分析了不同泌乳時期外周血白細(xì)胞基因組表達譜變化情況,并對不同泌乳時期的差異表達基因進行了KEGG通路分析。選取JAK-STAT信號通路、TGF-β信號通路和Wnt信號通路作為研究對象,確定不同泌乳時期這些通路內(nèi)的2倍上調(diào)或下調(diào)的IL-21R等共4個差異表達基因及其分子功能。并將IL-21R基因列為溫州水牛乳質(zhì)性狀的候選功能基因,運用PCR-SSCP方法對134頭溫州水牛IL-21R基因的進行了SNPs檢測。同時對已報道的與中國荷斯坦奶牛乳質(zhì)性狀相關(guān)的STAT1基因3’UTR,STAT4基因intron20和PRL基因exon4內(nèi)存在的SNP在溫州水牛試驗群體內(nèi)進行了檢測。結(jié)果如下：（1）溫州水牛不同泌... 

【文章來源】：南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：87 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
英文縮寫說明
第一章 文獻綜述
    1.1 溫州水牛及水牛奶產(chǎn)業(yè)的現(xiàn)狀概述
        1.1.1 溫州水牛品種資源簡介
        1.1.2 水牛奶的營養(yǎng)價值和發(fā)展?jié)摿?br>    1.2 水牛乳質(zhì)性狀相關(guān)基因及其多態(tài)性的研究進展
        1.2.1 參與乳腺發(fā)育和泌乳調(diào)控的主效基因及其多態(tài)性研究進展
        1.2.2 參與乳脂合成及其相關(guān)代謝通路調(diào)控的主效基因及其多態(tài)性研究進展
        1.2.3 參與乳蛋白合成的主效基因及其多態(tài)性研究進展
        1.2.4 水牛乳質(zhì)性狀相關(guān)基因研究現(xiàn)狀小結(jié)
    1.3 基因芯片技術(shù)研究進展
        1.3.1 基因芯片簡介
        1.3.2 基因芯片在畜牧業(yè)中的應(yīng)用
        1.3.3 基因芯片技術(shù)小結(jié)
第二章 溫州水牛全基因組表達譜芯片檢測與數(shù)據(jù)分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 試驗動物與采樣方法
        2.1.2 主要試驗設(shè)備及儀器
        2.1.3 主要試劑
        2.1.4 芯片的制備
        2.1.5. 芯片數(shù)據(jù)處理與分析方法
    2.2 芯片分析結(jié)果
        2.2.1 試驗樣品總RNA的檢測
        2.2.2 不同泌乳時期溫州水牛外周血白細(xì)胞基因芯片檢測的原始灰度圖
        2.2.3 不同泌乳時期溫州水牛外周血白細(xì)胞基因芯片檢測的質(zhì)量判斷
        2.2.4 不同泌乳時期溫州水牛外周血白細(xì)胞基因芯片檢測的結(jié)果
        2.2.5 不同泌乳時期溫州水牛外周血白細(xì)胞基因芯片檢測的基因表達譜散點圖
        2.2.6 不同泌乳時期溫州水牛外周血白細(xì)胞基因芯片差異表達基因分析
    2.3 討論
        2.3.1 JAK-STAT信號通路及其差異表達基因的功能分析
        2.3.2 TGF-β信號通路及其差異表達基因的功能分析
        2.3.3 Wnt信號通路及其差異表達基因的功能分析
第三章 溫州水牛IL-21R基因的PCR-SSCP檢測及其遺傳多態(tài)性分析
    3.1 材料與方法
        3.1.1 試驗動物及采樣方法
        3.1.2 血液DNA提取
        3.1.3 PCR擴增及檢測
        3.1.4 PCR-SSCP檢測
        3.1.5 PCR產(chǎn)物的純化回收及測序
        3.1.6 序列分析
        3.1.7 統(tǒng)計分析
    3.2 結(jié)果
        3.2.1 溫州水�；蚪MDNA提取結(jié)果
        3.2.2 溫州水牛IL-21R基因各引物擴增片段結(jié)果
        3.2.3 溫州水牛IL-21R基因各引物對擴增片段的PCR-SSCP檢測及測序
        3.2.4 IL-21R基因SNPs連鎖不平衡程度分析
        3.2.5 溫州水牛IL-21R基因SNPs的群體遺傳學(xué)分析
    3.3. 討論
        3.3.1 溫州水牛試驗群體IL-21R基因SNPs分析
        3.3.2 溫州水牛試驗群體IL-21R基因SNPs的遺傳多樣性分析
        3.3.3 小結(jié)
第四章 溫州水牛STAT1、STAT4、PRL基因PCR-SSCP分析
    4.1 材料與方法
        4.1.1 試驗材料
        4.1.2 血液DNA提取
        4.1.3 PCR擴增及檢測
        4.1.4 PCR-SSCP檢測
        4.1.5 PCR產(chǎn)物的純化回收及測序
        4.1.6 序列分析
        4.1.7 統(tǒng)計分析
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 溫州水牛STAT1基因引物對擴增片段的SSCP檢測及不同基因型的測序
        4.2.2 溫州水牛STAT4基因引物對擴增片段的SSCP檢測及不同基因型的測序
        4.2.3 溫州水牛PRL基因引物對擴增片段的SSCP檢測及不同基因型的測序
        4.2.4 溫州水牛STAT1、STAT4和PRL基因SNPs的群體遺傳學(xué)分析
        4.2.5 溫州水牛STAT1、STAT4和PRL基因擴增片段與荷斯坦奶牛序列的多重比對
    4.3 討論
        4.3.1 溫州水牛試驗群體STAT1、STAT4和PRL基因的SNPs分析
        4.3.2 溫州水牛試驗群體STAT1,STAT4,PRL基因SNPs的遺傳多態(tài)性分析
        4.3.3 溫州水牛試驗群體與荷斯坦奶牛群體STAT1、STAT4和PRL基因SNPs的差異
        4.3.4 小結(jié)
第五章 全文結(jié)論
參考文獻
附錄
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
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[5]水牛奶組分及其功能特性研究進展[J]. 李全陽,張憲省,劉小玲,姜元欣.  食品科學(xué). 2011(03)
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碩士論文
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本文編號：3233579