強(qiáng)、弱毒力新城疫病毒雙重?zé)晒舛縍T-PCR檢測方法的建立
發(fā)布時(shí)間:2021-06-16 05:59
通過比對新城疫病毒強(qiáng)、弱毒株F基因序列,根據(jù)其在F0裂解位點(diǎn)的差異以及F基因保守序列設(shè)計(jì)合成NDV-V-probe和NDV-L-probe探針組和NDV-F、NDV-R引物組,以基因Ⅶ型NA-1株和基因Ⅱ型LaSota疫苗株病毒RNA作為定量檢測的標(biāo)準(zhǔn)品,建立檢測方法。對所建立的標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行分析,相關(guān)系數(shù)R2均為0.997,線性關(guān)系良好。通過計(jì)算變異系數(shù)CV/%分別為0.034%和0.027%,均小于1%,說明穩(wěn)定性良好。對禽類常見病毒IBV、H9亞型AIV檢測未發(fā)現(xiàn)有交叉反應(yīng),特異性好、重復(fù)性佳。結(jié)果表明:成功建立了新城疫病毒強(qiáng)、弱毒雙重?zé)晒舛縍T-PCR的檢測方法,實(shí)現(xiàn)了從分子水平上快速鑒別強(qiáng)、弱毒力的新城疫病毒,也可快速區(qū)分野毒感染動物和疫苗接種動物,減少不必要的經(jīng)濟(jì)損失。
【文章來源】:中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017,37(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
圖1目的基因擴(kuò)增M.DL2000DNAMarker;泳道1~5.強(qiáng)毒株的擴(kuò)增目的片段;6~9.弱毒株的擴(kuò)增目的片
2.3標(biāo)準(zhǔn)曲線的確立按2.2優(yōu)化的反應(yīng)條件,將標(biāo)準(zhǔn)品10倍梯度倍比稀釋后,分別得到1.0×107~1.01copies/μL的標(biāo)準(zhǔn)品模板,以確立的擴(kuò)增體系進(jìn)行反應(yīng)。根據(jù)擴(kuò)增曲線,分別以Ct為Y軸,標(biāo)準(zhǔn)品濃度的對數(shù)值為X軸繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖5、6),線性關(guān)系分別為y=-3.36x+41.85和y=-3.43x+38.35,R2均為0.997。線性關(guān)系良好。圖4JOE通道引物濃度的優(yōu)化1~4.0.2,0.4,0.6,0.8μmol/L;5.陰性對照圖5NA-1株RNA標(biāo)準(zhǔn)品標(biāo)準(zhǔn)曲線2.4敏感性試驗(yàn)將RNA標(biāo)準(zhǔn)品以10倍梯度倍比稀釋,分別得到1.0×107~1.01copies/μL的標(biāo)準(zhǔn)品;熒光定量PCR擴(kuò)增結(jié)果圖見圖7和圖8,最低圖6LaSota株RNA標(biāo)準(zhǔn)品標(biāo)準(zhǔn)曲線檢測濃度分別為1.0×102copies/μL和1.0×101copies/μL。圖7FAM通道敏感性試驗(yàn)1~8.1.0×107~1.01copies/μL;9.陰性對照4中國獸醫(yī)學(xué)報(bào)2017年1月第37卷第1期ChinJVetSciJan.2017Vol.37No.1
2.3標(biāo)準(zhǔn)曲線的確立按2.2優(yōu)化的反應(yīng)條件,將標(biāo)準(zhǔn)品10倍梯度倍比稀釋后,分別得到1.0×107~1.01copies/μL的標(biāo)準(zhǔn)品模板,以確立的擴(kuò)增體系進(jìn)行反應(yīng)。根據(jù)擴(kuò)增曲線,分別以Ct為Y軸,標(biāo)準(zhǔn)品濃度的對數(shù)值為X軸繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖5、6),線性關(guān)系分別為y=-3.36x+41.85和y=-3.43x+38.35,R2均為0.997。線性關(guān)系良好。圖4JOE通道引物濃度的優(yōu)化1~4.0.2,0.4,0.6,0.8μmol/L;5.陰性對照圖5NA-1株RNA標(biāo)準(zhǔn)品標(biāo)準(zhǔn)曲線2.4敏感性試驗(yàn)將RNA標(biāo)準(zhǔn)品以10倍梯度倍比稀釋,分別得到1.0×107~1.01copies/μL的標(biāo)準(zhǔn)品;熒光定量PCR擴(kuò)增結(jié)果圖見圖7和圖8,最低圖6LaSota株RNA標(biāo)準(zhǔn)品標(biāo)準(zhǔn)曲線檢測濃度分別為1.0×102copies/μL和1.0×101copies/μL。圖7FAM通道敏感性試驗(yàn)1~8.1.0×107~1.01copies/μL;9.陰性對照4中國獸醫(yī)學(xué)報(bào)2017年1月第37卷第1期ChinJVetSciJan.2017Vol.37No.1
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鑒別新城疫強(qiáng)、弱毒一步RT-PCR方法的建立及應(yīng)用[J]. 明文龍,尹仁福,謝光耀,薛聰,王珂,袁乾亮,丁壯. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(07)
[2]新城疫流行病學(xué)新特點(diǎn)及鵝新城疫防控策略[J]. 丁壯,尹仁福,薛聰,王建忠,錢晶. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(01)
[3]鵝源新城疫病毒實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 尹仁福,劉新鑫,丁壯,劉美,吳昊. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2008(04)
[4]鵝副粘病毒分離株生物學(xué)特性的研究[J]. 丁壯,王承宇,向華,潘玉民,于為民,鄒嘯環(huán). 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2002(05)
[5]雞新城疫病毒強(qiáng)弱毒株RT-PCR鑒別診斷方法[J]. 曹殿軍,劉培欣,閆麗輝,孫建宏. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2000(06)
本文編號:3232510
【文章來源】:中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017,37(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
圖1目的基因擴(kuò)增M.DL2000DNAMarker;泳道1~5.強(qiáng)毒株的擴(kuò)增目的片段;6~9.弱毒株的擴(kuò)增目的片
2.3標(biāo)準(zhǔn)曲線的確立按2.2優(yōu)化的反應(yīng)條件,將標(biāo)準(zhǔn)品10倍梯度倍比稀釋后,分別得到1.0×107~1.01copies/μL的標(biāo)準(zhǔn)品模板,以確立的擴(kuò)增體系進(jìn)行反應(yīng)。根據(jù)擴(kuò)增曲線,分別以Ct為Y軸,標(biāo)準(zhǔn)品濃度的對數(shù)值為X軸繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖5、6),線性關(guān)系分別為y=-3.36x+41.85和y=-3.43x+38.35,R2均為0.997。線性關(guān)系良好。圖4JOE通道引物濃度的優(yōu)化1~4.0.2,0.4,0.6,0.8μmol/L;5.陰性對照圖5NA-1株RNA標(biāo)準(zhǔn)品標(biāo)準(zhǔn)曲線2.4敏感性試驗(yàn)將RNA標(biāo)準(zhǔn)品以10倍梯度倍比稀釋,分別得到1.0×107~1.01copies/μL的標(biāo)準(zhǔn)品;熒光定量PCR擴(kuò)增結(jié)果圖見圖7和圖8,最低圖6LaSota株RNA標(biāo)準(zhǔn)品標(biāo)準(zhǔn)曲線檢測濃度分別為1.0×102copies/μL和1.0×101copies/μL。圖7FAM通道敏感性試驗(yàn)1~8.1.0×107~1.01copies/μL;9.陰性對照4中國獸醫(yī)學(xué)報(bào)2017年1月第37卷第1期ChinJVetSciJan.2017Vol.37No.1
2.3標(biāo)準(zhǔn)曲線的確立按2.2優(yōu)化的反應(yīng)條件,將標(biāo)準(zhǔn)品10倍梯度倍比稀釋后,分別得到1.0×107~1.01copies/μL的標(biāo)準(zhǔn)品模板,以確立的擴(kuò)增體系進(jìn)行反應(yīng)。根據(jù)擴(kuò)增曲線,分別以Ct為Y軸,標(biāo)準(zhǔn)品濃度的對數(shù)值為X軸繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖5、6),線性關(guān)系分別為y=-3.36x+41.85和y=-3.43x+38.35,R2均為0.997。線性關(guān)系良好。圖4JOE通道引物濃度的優(yōu)化1~4.0.2,0.4,0.6,0.8μmol/L;5.陰性對照圖5NA-1株RNA標(biāo)準(zhǔn)品標(biāo)準(zhǔn)曲線2.4敏感性試驗(yàn)將RNA標(biāo)準(zhǔn)品以10倍梯度倍比稀釋,分別得到1.0×107~1.01copies/μL的標(biāo)準(zhǔn)品;熒光定量PCR擴(kuò)增結(jié)果圖見圖7和圖8,最低圖6LaSota株RNA標(biāo)準(zhǔn)品標(biāo)準(zhǔn)曲線檢測濃度分別為1.0×102copies/μL和1.0×101copies/μL。圖7FAM通道敏感性試驗(yàn)1~8.1.0×107~1.01copies/μL;9.陰性對照4中國獸醫(yī)學(xué)報(bào)2017年1月第37卷第1期ChinJVetSciJan.2017Vol.37No.1
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鑒別新城疫強(qiáng)、弱毒一步RT-PCR方法的建立及應(yīng)用[J]. 明文龍,尹仁福,謝光耀,薛聰,王珂,袁乾亮,丁壯. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(07)
[2]新城疫流行病學(xué)新特點(diǎn)及鵝新城疫防控策略[J]. 丁壯,尹仁福,薛聰,王建忠,錢晶. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(01)
[3]鵝源新城疫病毒實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 尹仁福,劉新鑫,丁壯,劉美,吳昊. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2008(04)
[4]鵝副粘病毒分離株生物學(xué)特性的研究[J]. 丁壯,王承宇,向華,潘玉民,于為民,鄒嘯環(huán). 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2002(05)
[5]雞新城疫病毒強(qiáng)弱毒株RT-PCR鑒別診斷方法[J]. 曹殿軍,劉培欣,閆麗輝,孫建宏. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2000(06)
本文編號:3232510
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3232510.html
最近更新
教材專著