隨著人類科技的不斷進(jìn)步,越來越多的疾病也隨之產(chǎn)生,困擾著人類,并且對(duì)人類的生命安全甚至種族的延續(xù)都產(chǎn)生了致命的威脅。禽流感病毒不僅對(duì)家禽養(yǎng)殖造成巨大危害,同時(shí)也嚴(yán)重危害著人類的健康。這篇文章針對(duì)已經(jīng)爆發(fā)數(shù)年的禽流感病毒的歷史數(shù)據(jù),運(yùn)用數(shù)據(jù)挖掘方法,對(duì)禽流感病毒進(jìn)行詳細(xì)分析,為根治此類病毒做出理論依據(jù)。近年來,禽流感的爆發(fā)使得相關(guān)數(shù)據(jù)成指數(shù)型增長(zhǎng),單純通過實(shí)驗(yàn)手段來研究已經(jīng)越來越難以取得突破性進(jìn)展,在這樣的現(xiàn)狀下,數(shù)據(jù)挖掘的引入就成為了一種必然。數(shù)據(jù)挖掘是新型的一門多學(xué)科的交叉學(xué)科,涉及到經(jīng)濟(jì)學(xué)、管理學(xué)、工學(xué)、理學(xué)等很多領(lǐng)域,在近幾年的研究中得到了廣泛的應(yīng)用。本文設(shè)計(jì)的病毒數(shù)據(jù)很難通過簡(jiǎn)單的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析發(fā)現(xiàn)潛在聯(lián)系,所以要用數(shù)據(jù)挖掘的方法從比較大量的、復(fù)雜的、有眾多噪聲和模糊性干擾的情況下提取有效和實(shí)用的病毒信息。本課題對(duì)不同宿主禽流感病毒間的糖基化位點(diǎn)在數(shù)目、位置、使用氨基酸殘基等信息進(jìn)行了較詳細(xì)分析,發(fā)現(xiàn)這些信息不足以有效地判斷流感病毒是否可以跨宿主傳播。通過對(duì)禽類與人類禽流感病毒使用數(shù)據(jù)挖掘的方法進(jìn)行分析的多序列比對(duì)結(jié)果的對(duì)比分析,找到了多個(gè)可以區(qū)分不同宿主的氨基酸殘基的特異性片段,... 

【文章來源】：大連海事大學(xué)遼寧省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

識(shí)別的18個(gè)抗原變異關(guān)鍵位置在HA蛋A抗原表位中的位置

使得分析更為快速，沒有選用最近一次爆發(fā)的H1N1的HA蛋白，共獲得54條序列，使用clustalW進(jìn)行多序列比對(duì)，比對(duì)結(jié)果如圖4.1和圖4. 2。多序列比對(duì)后差異很小的位置有24-51位，87-138位，302-525位，529-567位，在這些位置中除了禽流感病毒均具有的序列，很可能具有某一片段是禽類禽流感病毒獨(dú)有的序列片段，而其余差異比較大的序列片段就很可能是每種毒株具有的個(gè)體差異。** ； * ； *****************************1 gi|209164818|g ffiA1:IX?IMlirrAANADTLCIGYBANKSTDTVDTVIMNVTVmSVNIXEDPHK(mC|(‘ gi|189313196|g MEAILLVIIYTFTAANADTICIGYlANHSTDTVDTVIE^N\T￥THS7KXXEE?HlTGKICi：gi 119 3 8 7 7 8 4 7 I g MAILWIIVTFTTANADTICIG￥|IANlTSTDTVDT?LElCNVT?'mSVKIXEDraHCS-Ci(4 gi 1198482881 gb MKAIIWLLVTFTTAHADTICTCOTAHroTDTVDTVIE^KVTVTHSVKXXEDKfiKGKLqK5 gi|30522968|gb HKTILVVLIYTFTTADADTLCIGYaAWNSTDTVDTVIEKNVTVmSVKLIElrtffllTGKLCK6 gi|189313177|g ffiAILLVIXCTFTAANADIXCIGYIUNNSTDTVDTYIEKNVTVraSVNIXEDSHNGKLCK

圖4. 4人類HI禽流感病毒HA蛋白多序列比對(duì)結(jié)果二Fig. 4.4 HI human bird flu virus HA protein sequence alignment results(2)多序列比對(duì)后差異很小的位置有17-51位，87-99位，113-147位，292-567

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]面向領(lǐng)域的數(shù)據(jù)挖掘云平臺(tái)研究[J]. 曾安,陳云,潘丹,楊海東,謝光強(qiáng).  微電子學(xué)與計(jì)算機(jī). 2014(08)
[2]數(shù)據(jù)挖掘在中國(guó)的現(xiàn)狀和發(fā)展分析[J]. 閆燕.  科技信息. 2014(05)
[3]數(shù)據(jù)挖掘研究現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢(shì)[J]. 王惠中,彭安群.  工礦自動(dòng)化. 2011(02)
[4]Mutation trend of hemagglutinin of influenza A virus: a review from a computational mutation viewpoint[J]. Guang WU~1 Shao-min YAN Computational Mutation Project.DreamSciTech Consulting,301.Building 12.Nanyou A-zone,Jiannan Road.Shenzhen 518054,China.  Acta Pharmacologica Sinica. 2006(05)



本文編號(hào)：3231206