基于IGPD靶標研究蘆丁對木糖葡萄球菌生物被膜的干預作用
發(fā)布時間:2021-06-10 16:40
木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylosus,S.xylosus)是凝固酶陰性葡萄球菌奶牛乳房炎的主要分離菌,其分離率不僅呈上升趨勢,且具有較強的生物被膜形成能力。生物被膜的存在能夠增強細菌應對外界環(huán)境改變帶來的生存壓力,增強細菌耐藥性以及造成宿主的持續(xù)性感染。因此,如何干預或消除細菌生物被膜的形成成為了科研工作者關注的熱點。咪唑甘油磷酸酯脫水酶(Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase,IGPD)在木糖葡萄球菌生物被膜的形成中發(fā)揮重要作用。IGPD是L-組氨酸合成通路中重要的金屬酶之一,其廣泛存在于低等植物和微生物的細胞內,被認為是潛在的藥物靶點。蘆丁是黃酮類藥物,具有多種藥理活性,但其能否干預木糖葡萄球菌生物被膜的形成以及干預機制尚未見報道。在本研究中,探究在木糖葡萄球菌生物被膜形成過程中,蘆丁對木糖葡萄球菌生物被膜的干預作用;基于分子對接、表面等離子共振技術和氨基酸定點突變技術,闡明蘆丁是否與IGPD的某些位點結合,確定其作用靶位;探究蘆丁對hisB基因表達、IGPD蛋白表達、L-組氨酸含量、酶活性變化的影響;具體的研究結果如下...
【文章來源】:東北農業(yè)大學黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
細菌生物被膜的形成過程
東北農業(yè)大學農學碩士學位論文咪唑甘油磷酸酯脫水酶及 L-組氨酸的研究進展 咪唑甘油磷酸酯脫水酶的研究進展唑甘油磷酸酯脫水酶(imidazoleglycerol phosphate dehydratase, IGPD)是一種等植物和微生物機體內的金屬酶[34],IGPD 在細菌、低等真核生物中保守,然的機體內卻不存在[35]。目前其具體的催化機理仍不清楚,據報道其可能的催化 所示[36]。外,IGPD 是植物以及微生物體內 L-組氨酸生物合成途徑的關鍵酶之一,在 L合成中發(fā)揮重要作用,因此通過抑制 IGPD 的活性從而阻斷 L-組氨酸的生物合使細菌死亡而不會影響到人和動物的生命安全,另外,Sinhan[37]等報道 IGPD三聚體 X 射線晶體衍射結構,為 IGPD 抑制劑的研究提供了更加有利的思路與D 成為了新的除草劑的潛在靶標酶。
引 言黃色葡萄球菌的 IGPD 的晶體結構為 CNS 菌屬 IGPD 的研究提供有利的結構基礎,研究中,以金黃色葡萄球菌 IGPD 為模板,通過同源模建的方法,獲得了可信度在 9糖葡萄球菌 IGPD 的三維結構[40],木糖葡萄球菌的三維結構如圖 1-3 所示,這對于球菌 IGPD 的抑制劑的篩選有較大的幫助。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]反枝莧乙酰乳酸合成酶與煙嘧磺隆分子結合模式分析及抗性位點預測[J]. 楊冬臣,霍靜倩,張哲,齊萌,張金林. 農藥學學報. 2019(01)
[2]基于定點突變的植物Ⅲ型聚酮合酶結構與功能研究進展[J]. 李星,陳默,柴團耀,王紅. 生物工程學報. 2018(04)
[3]大環(huán)內酯類抗生素對細菌生物被膜作用的研究進展[J]. 丁雙元,官麗莉,馬紅霞,劉樹明. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(03)
[4]牛乳源金黃色葡萄球菌生物被膜形成與耐藥性的研究[J]. 陳程,張銳,姜興佳,吳帆,常佳偉,吉星,王曈,萬佳宏,王桂琴. 中國獸醫(yī)科學. 2018(06)
[5]Strategies for combating bacterial biofilm infections[J]. Hong Wu,Claus Moser,Heng-Zhuang Wang,Niels Hφiby,Zhi-Jun Song. International Journal of Oral Science. 2015(01)
[6]CMP羥甲基化酶MilA中與甲基羥化過程相關的關鍵氨基酸定點突變分析[J]. 高土玲,陳誠,趙功,鄧子新,胡申才,賀新義. 微生物學通報. 2014(01)
[7]咪唑甘油磷酸酯脫水酶與含氮雜環(huán)磷酸酯類抑制劑作用方式的分子模擬[J]. 申濤,杜鳳沛,劉婷,姚廣偉,吳崢,方萌萌,徐筱杰,路慧哲. 物理化學學報. 2011(08)
[8]分子對接方法的應用與發(fā)展[J]. 段愛霞,陳晶,劉宏德,劉秀輝,盧小泉. 分析科學學報. 2009(04)
[9]細菌生物被膜的耐藥機制及控制策略[J]. 賈鳴,胡曉梅,胡福泉. 生命的化學. 2008(03)
[10]基于氨基酸序列預測蛋白質功能性點突變位點[J]. 宋卓,張寧,阮吉壽,楊卓,張濤. 生物物理學報. 2007(02)
博士論文
[1]碳基納米材料與生物分子相互作用的分子動力學研究[D]. 于怡.蘇州大學 2018
[2]基于IGPD靶標探討頭孢喹肟干預木糖葡萄球菌生物被膜形成的機制[D]. 周永輝.東北農業(yè)大學 2018
[3]基于谷氨酰胺合成酶靶標探討紅霉素干預木糖葡萄球菌生物被膜形成的機制[D]. 楊艷北.東北農業(yè)大學 2017
碩士論文
[1]蘆丁干預S.suis生物被膜的形成及其對cps基因簇和毒力基因表達的影響[D]. 王帥.東北農業(yè)大學 2017
[2]ALA-PDT對銅綠假單胞菌生物膜及其QS系統(tǒng)的影響的實驗研究[D]. 譚楊.第三軍醫(yī)大學 2017
[3]基于核受體靶點的小分子設計及化學生物學研究[D]. 張歡.華僑大學 2015
[4]定向進化技術提高枯草芽孢桿菌角蛋白酶活性研究[D]. 高靜雷.四川農業(yè)大學 2014
本文編號:3222743
【文章來源】:東北農業(yè)大學黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
細菌生物被膜的形成過程
東北農業(yè)大學農學碩士學位論文咪唑甘油磷酸酯脫水酶及 L-組氨酸的研究進展 咪唑甘油磷酸酯脫水酶的研究進展唑甘油磷酸酯脫水酶(imidazoleglycerol phosphate dehydratase, IGPD)是一種等植物和微生物機體內的金屬酶[34],IGPD 在細菌、低等真核生物中保守,然的機體內卻不存在[35]。目前其具體的催化機理仍不清楚,據報道其可能的催化 所示[36]。外,IGPD 是植物以及微生物體內 L-組氨酸生物合成途徑的關鍵酶之一,在 L合成中發(fā)揮重要作用,因此通過抑制 IGPD 的活性從而阻斷 L-組氨酸的生物合使細菌死亡而不會影響到人和動物的生命安全,另外,Sinhan[37]等報道 IGPD三聚體 X 射線晶體衍射結構,為 IGPD 抑制劑的研究提供了更加有利的思路與D 成為了新的除草劑的潛在靶標酶。
引 言黃色葡萄球菌的 IGPD 的晶體結構為 CNS 菌屬 IGPD 的研究提供有利的結構基礎,研究中,以金黃色葡萄球菌 IGPD 為模板,通過同源模建的方法,獲得了可信度在 9糖葡萄球菌 IGPD 的三維結構[40],木糖葡萄球菌的三維結構如圖 1-3 所示,這對于球菌 IGPD 的抑制劑的篩選有較大的幫助。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]反枝莧乙酰乳酸合成酶與煙嘧磺隆分子結合模式分析及抗性位點預測[J]. 楊冬臣,霍靜倩,張哲,齊萌,張金林. 農藥學學報. 2019(01)
[2]基于定點突變的植物Ⅲ型聚酮合酶結構與功能研究進展[J]. 李星,陳默,柴團耀,王紅. 生物工程學報. 2018(04)
[3]大環(huán)內酯類抗生素對細菌生物被膜作用的研究進展[J]. 丁雙元,官麗莉,馬紅霞,劉樹明. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(03)
[4]牛乳源金黃色葡萄球菌生物被膜形成與耐藥性的研究[J]. 陳程,張銳,姜興佳,吳帆,常佳偉,吉星,王曈,萬佳宏,王桂琴. 中國獸醫(yī)科學. 2018(06)
[5]Strategies for combating bacterial biofilm infections[J]. Hong Wu,Claus Moser,Heng-Zhuang Wang,Niels Hφiby,Zhi-Jun Song. International Journal of Oral Science. 2015(01)
[6]CMP羥甲基化酶MilA中與甲基羥化過程相關的關鍵氨基酸定點突變分析[J]. 高土玲,陳誠,趙功,鄧子新,胡申才,賀新義. 微生物學通報. 2014(01)
[7]咪唑甘油磷酸酯脫水酶與含氮雜環(huán)磷酸酯類抑制劑作用方式的分子模擬[J]. 申濤,杜鳳沛,劉婷,姚廣偉,吳崢,方萌萌,徐筱杰,路慧哲. 物理化學學報. 2011(08)
[8]分子對接方法的應用與發(fā)展[J]. 段愛霞,陳晶,劉宏德,劉秀輝,盧小泉. 分析科學學報. 2009(04)
[9]細菌生物被膜的耐藥機制及控制策略[J]. 賈鳴,胡曉梅,胡福泉. 生命的化學. 2008(03)
[10]基于氨基酸序列預測蛋白質功能性點突變位點[J]. 宋卓,張寧,阮吉壽,楊卓,張濤. 生物物理學報. 2007(02)
博士論文
[1]碳基納米材料與生物分子相互作用的分子動力學研究[D]. 于怡.蘇州大學 2018
[2]基于IGPD靶標探討頭孢喹肟干預木糖葡萄球菌生物被膜形成的機制[D]. 周永輝.東北農業(yè)大學 2018
[3]基于谷氨酰胺合成酶靶標探討紅霉素干預木糖葡萄球菌生物被膜形成的機制[D]. 楊艷北.東北農業(yè)大學 2017
碩士論文
[1]蘆丁干預S.suis生物被膜的形成及其對cps基因簇和毒力基因表達的影響[D]. 王帥.東北農業(yè)大學 2017
[2]ALA-PDT對銅綠假單胞菌生物膜及其QS系統(tǒng)的影響的實驗研究[D]. 譚楊.第三軍醫(yī)大學 2017
[3]基于核受體靶點的小分子設計及化學生物學研究[D]. 張歡.華僑大學 2015
[4]定向進化技術提高枯草芽孢桿菌角蛋白酶活性研究[D]. 高靜雷.四川農業(yè)大學 2014
本文編號:3222743
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