綿羊胚胎期尾脂沉積關(guān)鍵功能基因挖掘
發(fā)布時間:2021-06-09 17:45
我國是綿羊存欄量和羊肉消費(fèi)大國,提高綿羊生產(chǎn)性能一直是畜禽遺傳育種領(lǐng)域研究重點(diǎn)。綿羊按照尾型可以被劃分為脂尾羊、脂臀羊和瘦尾羊。脂尾性狀是瘦尾羊經(jīng)過長期的自然選擇和人工選育形成的獨(dú)特性狀。目前,綿羊脂尾性狀的相關(guān)研究大多從基因組水平、轉(zhuǎn)錄組水平對不同尾型的成年綿羊進(jìn)行分析,然而綿羊尾脂的沉積在胚胎時期已經(jīng)開始,出生后綿羊的脂尾已經(jīng)形成。因此本研究對綿羊胚胎期尾脂沉積過程中關(guān)鍵的功能基因和生物學(xué)通路進(jìn)行了探索性研究。基于上述背景,本研究主要工作內(nèi)容和結(jié)果如下:(1)胚胎期尾組織組織形態(tài)學(xué)分析表明E70-E80是尾脂沉積的關(guān)鍵時期。采集了灘羊(脂尾羊)妊娠期60天(E60)、70天(E70)、80天(E80)和90天(E90)的胚胎尾部組織,我們發(fā)現(xiàn)E70-E80尾組織在形態(tài)上發(fā)生了劇烈的變化(由“棍狀”變?yōu)椤膀蝌綘睢保。HE染色和油紅染色表明E60和E70時期尾部無脂肪沉積,但脂肪前體細(xì)胞在尾組織中聚集成規(guī)則的葉狀細(xì)胞團(tuán);E80和E90時期尾部的脂肪前體細(xì)胞大量增殖分化為脂肪細(xì)胞,尾部脂肪大量沉積。(2)尾脂沉積時間要早于皮下、肌內(nèi)和內(nèi)臟脂肪的沉積。同時對E80時期尾、肌肉、皮膚、肝臟和...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
DNA芯片技術(shù)原理
?Rodelspergeretal.,2017;Sakaietal.,2015)。但是該方法對組織提取RNA要求極高、價(jià)格昂貴,限制了該技術(shù)的大規(guī)模的應(yīng)用。RNA-Seq技術(shù)指的是應(yīng)用第二代測序技術(shù)對組織或細(xì)胞轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物構(gòu)建的cDNA文庫進(jìn)行測序的技術(shù),在目前的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究領(lǐng)域最為常見,應(yīng)用的最為廣泛,該方法通過在不同的實(shí)驗(yàn)環(huán)節(jié)進(jìn)行設(shè)計(jì),能夠分別對全轉(zhuǎn)錄組、mRNA、lncRNA和microRNA進(jìn)行建庫測序。一般來說,組織或細(xì)胞中提取出的RNA反轉(zhuǎn)成cDNA,在cDNA雙末端添加具有特定序列的接頭,然后對每個帶接頭的cDNA片段擴(kuò)增或直接進(jìn)行單末端或雙末端高通量測序(圖1-2)。目前,多種測序平臺被開發(fā)出來用于轉(zhuǎn)錄組高通量測序,如:Roche454LifeScience(Barbazuketal.,2007)、IlluminaIG(Nagalakshmietal.,2008)和AppliedBiosystemsSOLiD(Cloonanetal.,2008)等,不同的測序方法或不同的測序平臺單次可測定的讀段長度存在差異,一般在30-400pb。測序后,產(chǎn)生的讀段一方面可以與參考基因組或參考轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行作圖,另一方面可以在沒有參考基因組的情況下用進(jìn)行重新組裝,構(gòu)建新的轉(zhuǎn)錄圖譜,之后根據(jù)匹配到每個基因外顯子區(qū)域讀段的總數(shù)推斷基因的表達(dá)水平,進(jìn)而根據(jù)匹配的外顯子長度對表達(dá)水平進(jìn)行歸一化處理。圖1-2轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)流程Fig.1-2Transcriptomesequencingprocess(Wangetal.,2009)相較于基于芯片雜交的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,RNA-Seq具有眾多優(yōu)點(diǎn)。首先,該技術(shù)突破了必須對已注釋基因進(jìn)行檢測的限制,因此,該技術(shù)可以很好地應(yīng)用于無參考基因組的非模式生物的研究。轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)能夠以單堿基分辨率對轉(zhuǎn)錄結(jié)構(gòu)、轉(zhuǎn)錄水平基因組變異信息(如SNP和可
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一章緒論5用于儲存脂肪,同時含有豐富的線粒體,具有棕色脂肪細(xì)胞特性;當(dāng)細(xì)胞受到冷刺激時,轉(zhuǎn)化為多泡脂肪細(xì)胞,能夠如同棕色脂肪細(xì)胞一樣產(chǎn)熱。米色脂肪細(xì)胞在小鼠體內(nèi)主要分布在皮下白色脂肪組織庫,目前尚未證實(shí)在人體白色脂肪組織庫中也存在米色脂肪細(xì)胞(Harmsetal.,2013)。棕色和米色脂肪細(xì)胞產(chǎn)熱功能的實(shí)現(xiàn)主要依賴于UCP1蛋白,這種蛋白不在白色脂肪細(xì)胞或身體其他任何細(xì)胞中表達(dá)(Gaoetal.,2018)。圖1-3棕色脂肪細(xì)胞(A)、米色脂肪細(xì)胞(B)和白色脂肪細(xì)胞(C)Fig.1-3Brownadipocyte(A),beigeadipocyte(B)andwhiteadipocyte(C)脂肪組織在動物體內(nèi)處于動態(tài)變化之中,是一種能夠介導(dǎo)全身穩(wěn)態(tài)的高度動態(tài)化的器官(Bakhtiarizadehetal.,2013)。理論上,脂肪組織的生長可以通過脂肪細(xì)胞體積的增大和數(shù)量的增多來實(shí)現(xiàn),由于成熟的脂肪細(xì)胞是由前脂肪細(xì)胞分化而來的一種終末分化細(xì)胞,所以數(shù)量的增加(增生)代表著脂肪細(xì)胞重新形成的過程;體積的增大(肥大)往往和脂肪功能障礙有關(guān)。研究表明,大多數(shù)WAT中脂肪細(xì)胞的數(shù)量在生長過程中逐漸確定了下來,成年時期,前脂肪細(xì)胞分化出的新的脂肪細(xì)胞用來取代死亡的脂肪細(xì)胞,以保持脂肪細(xì)胞的數(shù)量(Jefferyetal.,2015)。此外,成年人體內(nèi)的AT主要由白色脂肪細(xì)胞構(gòu)成,但是在新生兒體內(nèi)的AT主要由富含線粒體的脂肪細(xì)胞組成;在高營養(yǎng)飲食狀態(tài)會導(dǎo)致體內(nèi)白色脂肪細(xì)胞體積、數(shù)量迅速增加(Jefferyetal.,2015),而減肥一般會造成脂肪細(xì)胞體積減小,與數(shù)目無關(guān)。動物脂肪組織還受到性別、環(huán)境、飼養(yǎng)管理方式等眾多因素的影響,更重要的是,動物體內(nèi)脂肪組織的沉積對肉質(zhì)和風(fēng)味都有很大的影響(滑留帥等,2014)。1.1.3綿羊尾脂研究進(jìn)展我國幅員遼闊,擁有豐富的綿羊品種資?
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同品種脂臀羊尾脂品質(zhì)的比較分析[J]. 劉丹,何鑫,李濤,李瑾瑜,杜婷婷,程楊陽,陳衛(wèi)林,王子榮. 現(xiàn)代食品科技. 2019(04)
[2]鹽池灘羊地理標(biāo)志農(nóng)產(chǎn)品品牌培育及在脫貧攻堅(jiān)中的重要作用[J]. 李昊,楊桂麗,夏文莉. 寧夏農(nóng)林科技. 2019(02)
[3]中國綿羊起源、進(jìn)化和遺傳多樣性研究進(jìn)展[J]. 趙永欣,李孟華. 遺傳. 2017(11)
[4]蒙古羊尾椎數(shù)與尾型變異分析[J]. 何小龍,王位,王艷欣,王月星,付紹印,李虎山,劉斌,祁云霞,達(dá)賴,郭建平,蔡宇鈿,劉永斌,張文廣. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(15)
[5]灘羊利用小尾寒羊多胎遺傳基因試驗(yàn)[J]. 申正成. 甘肅畜牧獸醫(yī). 2015(09)
[6]下一代測序技術(shù)在畜禽轉(zhuǎn)錄組研究中的應(yīng)用[J]. 王樂樂,張燕軍,李曉燕,蘇蕊,王瑞軍,王志新,李金泉. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(09)
[7]脂尾去除對‘蘭州大尾羊’和‘蒙古羊’生長性能及脂肪沉積分布的影響[J]. 劉政,趙生國,李華偉,岳燕,程簫,劉立山,周瑞,劉麗,吳建平. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2015(05)
[8]動物脂肪組織的分化起源[J]. 滑留帥,王璟,李明勛,孫曉梅,楊東英,陳宏. 中國牛業(yè)科學(xué). 2014(05)
[9]新疆肥尾羊脂肪特性研究[J]. 劉成江,吳洪斌,王俊鋼,吳宏,郭安民. 食品科學(xué). 2012(06)
[10]寧夏灘羊的屠宰和肉質(zhì)理化性狀分析[J]. 喬海云,趙倩君,李穎康,許斌,張秀陶,姚娜,盧亞洲,馬月輝. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2009(23)
博士論文
[1]呼倫貝爾綿羊尾部脂肪組織的轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)分析[D]. 樊紅櫻.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]中國羊肉品牌化及其效應(yīng)研究[D]. 董謙.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)灘羊卷曲被毛形成的分子機(jī)制研究[D]. 康曉龍.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]中國部分綿羊群體的起源、遺傳多樣性及保護(hù)研究[D]. 趙倩君.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2007
碩士論文
[1]肥尾和瘦尾羊全基因組選擇信號檢測[D]. 劉真.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]灘羊肉品質(zhì)研究[D]. 錢文熙.寧夏大學(xué) 2005
本文編號:3221035
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
DNA芯片技術(shù)原理
?Rodelspergeretal.,2017;Sakaietal.,2015)。但是該方法對組織提取RNA要求極高、價(jià)格昂貴,限制了該技術(shù)的大規(guī)模的應(yīng)用。RNA-Seq技術(shù)指的是應(yīng)用第二代測序技術(shù)對組織或細(xì)胞轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物構(gòu)建的cDNA文庫進(jìn)行測序的技術(shù),在目前的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究領(lǐng)域最為常見,應(yīng)用的最為廣泛,該方法通過在不同的實(shí)驗(yàn)環(huán)節(jié)進(jìn)行設(shè)計(jì),能夠分別對全轉(zhuǎn)錄組、mRNA、lncRNA和microRNA進(jìn)行建庫測序。一般來說,組織或細(xì)胞中提取出的RNA反轉(zhuǎn)成cDNA,在cDNA雙末端添加具有特定序列的接頭,然后對每個帶接頭的cDNA片段擴(kuò)增或直接進(jìn)行單末端或雙末端高通量測序(圖1-2)。目前,多種測序平臺被開發(fā)出來用于轉(zhuǎn)錄組高通量測序,如:Roche454LifeScience(Barbazuketal.,2007)、IlluminaIG(Nagalakshmietal.,2008)和AppliedBiosystemsSOLiD(Cloonanetal.,2008)等,不同的測序方法或不同的測序平臺單次可測定的讀段長度存在差異,一般在30-400pb。測序后,產(chǎn)生的讀段一方面可以與參考基因組或參考轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行作圖,另一方面可以在沒有參考基因組的情況下用進(jìn)行重新組裝,構(gòu)建新的轉(zhuǎn)錄圖譜,之后根據(jù)匹配到每個基因外顯子區(qū)域讀段的總數(shù)推斷基因的表達(dá)水平,進(jìn)而根據(jù)匹配的外顯子長度對表達(dá)水平進(jìn)行歸一化處理。圖1-2轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)流程Fig.1-2Transcriptomesequencingprocess(Wangetal.,2009)相較于基于芯片雜交的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,RNA-Seq具有眾多優(yōu)點(diǎn)。首先,該技術(shù)突破了必須對已注釋基因進(jìn)行檢測的限制,因此,該技術(shù)可以很好地應(yīng)用于無參考基因組的非模式生物的研究。轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)能夠以單堿基分辨率對轉(zhuǎn)錄結(jié)構(gòu)、轉(zhuǎn)錄水平基因組變異信息(如SNP和可
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一章緒論5用于儲存脂肪,同時含有豐富的線粒體,具有棕色脂肪細(xì)胞特性;當(dāng)細(xì)胞受到冷刺激時,轉(zhuǎn)化為多泡脂肪細(xì)胞,能夠如同棕色脂肪細(xì)胞一樣產(chǎn)熱。米色脂肪細(xì)胞在小鼠體內(nèi)主要分布在皮下白色脂肪組織庫,目前尚未證實(shí)在人體白色脂肪組織庫中也存在米色脂肪細(xì)胞(Harmsetal.,2013)。棕色和米色脂肪細(xì)胞產(chǎn)熱功能的實(shí)現(xiàn)主要依賴于UCP1蛋白,這種蛋白不在白色脂肪細(xì)胞或身體其他任何細(xì)胞中表達(dá)(Gaoetal.,2018)。圖1-3棕色脂肪細(xì)胞(A)、米色脂肪細(xì)胞(B)和白色脂肪細(xì)胞(C)Fig.1-3Brownadipocyte(A),beigeadipocyte(B)andwhiteadipocyte(C)脂肪組織在動物體內(nèi)處于動態(tài)變化之中,是一種能夠介導(dǎo)全身穩(wěn)態(tài)的高度動態(tài)化的器官(Bakhtiarizadehetal.,2013)。理論上,脂肪組織的生長可以通過脂肪細(xì)胞體積的增大和數(shù)量的增多來實(shí)現(xiàn),由于成熟的脂肪細(xì)胞是由前脂肪細(xì)胞分化而來的一種終末分化細(xì)胞,所以數(shù)量的增加(增生)代表著脂肪細(xì)胞重新形成的過程;體積的增大(肥大)往往和脂肪功能障礙有關(guān)。研究表明,大多數(shù)WAT中脂肪細(xì)胞的數(shù)量在生長過程中逐漸確定了下來,成年時期,前脂肪細(xì)胞分化出的新的脂肪細(xì)胞用來取代死亡的脂肪細(xì)胞,以保持脂肪細(xì)胞的數(shù)量(Jefferyetal.,2015)。此外,成年人體內(nèi)的AT主要由白色脂肪細(xì)胞構(gòu)成,但是在新生兒體內(nèi)的AT主要由富含線粒體的脂肪細(xì)胞組成;在高營養(yǎng)飲食狀態(tài)會導(dǎo)致體內(nèi)白色脂肪細(xì)胞體積、數(shù)量迅速增加(Jefferyetal.,2015),而減肥一般會造成脂肪細(xì)胞體積減小,與數(shù)目無關(guān)。動物脂肪組織還受到性別、環(huán)境、飼養(yǎng)管理方式等眾多因素的影響,更重要的是,動物體內(nèi)脂肪組織的沉積對肉質(zhì)和風(fēng)味都有很大的影響(滑留帥等,2014)。1.1.3綿羊尾脂研究進(jìn)展我國幅員遼闊,擁有豐富的綿羊品種資?
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同品種脂臀羊尾脂品質(zhì)的比較分析[J]. 劉丹,何鑫,李濤,李瑾瑜,杜婷婷,程楊陽,陳衛(wèi)林,王子榮. 現(xiàn)代食品科技. 2019(04)
[2]鹽池灘羊地理標(biāo)志農(nóng)產(chǎn)品品牌培育及在脫貧攻堅(jiān)中的重要作用[J]. 李昊,楊桂麗,夏文莉. 寧夏農(nóng)林科技. 2019(02)
[3]中國綿羊起源、進(jìn)化和遺傳多樣性研究進(jìn)展[J]. 趙永欣,李孟華. 遺傳. 2017(11)
[4]蒙古羊尾椎數(shù)與尾型變異分析[J]. 何小龍,王位,王艷欣,王月星,付紹印,李虎山,劉斌,祁云霞,達(dá)賴,郭建平,蔡宇鈿,劉永斌,張文廣. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(15)
[5]灘羊利用小尾寒羊多胎遺傳基因試驗(yàn)[J]. 申正成. 甘肅畜牧獸醫(yī). 2015(09)
[6]下一代測序技術(shù)在畜禽轉(zhuǎn)錄組研究中的應(yīng)用[J]. 王樂樂,張燕軍,李曉燕,蘇蕊,王瑞軍,王志新,李金泉. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(09)
[7]脂尾去除對‘蘭州大尾羊’和‘蒙古羊’生長性能及脂肪沉積分布的影響[J]. 劉政,趙生國,李華偉,岳燕,程簫,劉立山,周瑞,劉麗,吳建平. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2015(05)
[8]動物脂肪組織的分化起源[J]. 滑留帥,王璟,李明勛,孫曉梅,楊東英,陳宏. 中國牛業(yè)科學(xué). 2014(05)
[9]新疆肥尾羊脂肪特性研究[J]. 劉成江,吳洪斌,王俊鋼,吳宏,郭安民. 食品科學(xué). 2012(06)
[10]寧夏灘羊的屠宰和肉質(zhì)理化性狀分析[J]. 喬海云,趙倩君,李穎康,許斌,張秀陶,姚娜,盧亞洲,馬月輝. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2009(23)
博士論文
[1]呼倫貝爾綿羊尾部脂肪組織的轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)分析[D]. 樊紅櫻.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]中國羊肉品牌化及其效應(yīng)研究[D]. 董謙.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)灘羊卷曲被毛形成的分子機(jī)制研究[D]. 康曉龍.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]中國部分綿羊群體的起源、遺傳多樣性及保護(hù)研究[D]. 趙倩君.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2007
碩士論文
[1]肥尾和瘦尾羊全基因組選擇信號檢測[D]. 劉真.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]灘羊肉品質(zhì)研究[D]. 錢文熙.寧夏大學(xué) 2005
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