本研究以皖南黑豬、安慶六白豬、圩豬、霍壽黑豬四個安徽地方品種及一個外來品種長白豬為材料,采用PCR-SSCP技術(shù)篩查TLR4基因第三外顯子部分片段的單鏈核苷酸多態(tài)性（SNP）,并通過SPSS軟件分析所檢測到的SNP在安慶六白豬、圩豬、霍壽黑豬、大白豬四個品種中的多態(tài)性與斷奶仔豬部分免疫指標(biāo)的相關(guān)性,從而為尋找與豬抗病性狀相關(guān)的有效遺傳標(biāo)記奠定基礎(chǔ),為安徽地方豬抗病育種提供理論依據(jù)。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)：（1）檢測皖南黑豬,安慶六白豬,圩豬,霍壽黑豬,長白豬5個群體的TLR4基因多態(tài)性,發(fā)現(xiàn)了位于TLR4基因外顯子3上的3個SNPs,分別是G417A,C318A,C1027A。（2）群體遺傳學(xué)分析表明C318A位點(diǎn),在皖南黑豬、圩豬、安慶六白豬均檢測到CC、CA兩種基因型,在皖南黑豬中的基因型頻率分別為80.95%、19.05%,在圩豬中的基因型頻率分別為70.00%、30.00%,在安慶六白豬中的基因型頻率分別為82.50%、17.50%。其中CC基因型為該3個群體中優(yōu)勢基因型,AA基因型均未檢測到。該位點(diǎn)在3個群體中PIC值分別為0.1575、0.2225、0.1469,均處于低度多態(tài)；且經(jīng)過... 

【文章來源】：安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽省

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略詞(Abbreviation)
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 抗病育種研究概況
        1.1 抗病機(jī)理
        1.2 抗病力的遺傳學(xué)基礎(chǔ)
        1.3 抗病育種的主要途徑
        1.4 抗病育種面臨的困難及前景展望
    2 F18大腸桿菌的研究進(jìn)展
        2.1 大腸桿菌簡介
        2.2 致病機(jī)理
        2.3 大腸桿菌F18ab/ac菌毛
    3 TLR4研究進(jìn)展
        3.1 TLRs家族及其結(jié)構(gòu)
        3.2 TLR4基因的發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
        3.3 TLR4的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路
        3.4 TLR4基因研究現(xiàn)狀
    4 單核苷酸多態(tài)性(SNP)
        4.1 SNP概念
        4.2 SNPs的特點(diǎn)
        4.3 SNP的檢測技術(shù)的分類
        4.4 幾種傳統(tǒng)的SNP檢測技術(shù)
引言
第二章 豬TLR4基因第三外顯子多態(tài)性檢測
    1 試驗(yàn)材料
        1.1 試驗(yàn)動物
        1.2 主要儀器設(shè)備
        1.3 試驗(yàn)試劑
        1.4 軟件工具
    2 試驗(yàn)方法
        2.1 DNA提取
        2.2 引物設(shè)計(jì)
        2.3 PCR擴(kuò)增
        2.4 單鏈構(gòu)象多態(tài)性檢測(SSCP)
        2.5 目的片段的克隆測序
        2.6 統(tǒng)計(jì)分析方法
    3 結(jié)果與分析
        3.1 豬耳組織DNA檢測
        3.5 群體遺傳學(xué)分析
    4 討論
第三章 TLR4基因多態(tài)性與斷奶仔豬部分免疫指標(biāo)的關(guān)聯(lián)分析
    1 試驗(yàn)材料
        1.1 試驗(yàn)動物
        1.2 試驗(yàn)儀器
        1.3 主要試劑
    2 試驗(yàn)方法
        2.1 仔豬DNA樣品TLR4基因多態(tài)性的檢測
        2.2 免疫指標(biāo)的測定
    3 數(shù)據(jù)計(jì)算與分析
    4 結(jié)果與分析
        4.1 各種豬種間免疫指標(biāo)差異分析
        4.2 豬TLR4基因C1027A位點(diǎn)多態(tài)性與免疫指標(biāo)的關(guān)聯(lián)分析
        4.3 豬TLR4基因G417A位點(diǎn)多態(tài)性與免疫指標(biāo)的關(guān)聯(lián)分析
    5 討論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
攻讀學(xué)位期間發(fā)表和參與發(fā)表的學(xué)術(shù)論文


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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[2]TAP1基因?qū)嗄套胸iF18大腸桿菌抗性和部分免疫指標(biāo)的效應(yīng)分析[D]. 潘章源.揚(yáng)州大學(xué) 2012
[3]蘇鐘豬TLR4基因多態(tài)性及編碼區(qū)C1027A功能分析[D]. 劉筱.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]豬TLR4基因的突變與功能分析[D]. 翟春媛.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[5]仔豬大腸桿菌F18粘附型與FUT1基因型相關(guān)性研究[D]. 羅艷茹.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[6]牛UCP3基因多態(tài)性與血清生化指標(biāo)的相關(guān)性研究[D]. 李秋玲.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
[7]大腸桿菌F18菌毛FedF亞單位單克隆抗體的制備及其初步應(yīng)用[D]. 丁愛云.揚(yáng)州大學(xué) 2006
[8]豬NRAMP1基因PCR-RFLP多態(tài)性與免疫指標(biāo)及生產(chǎn)性狀關(guān)系的研究[D]. 吳宏梅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2005



本文編號：3216772